Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFW9

MYRIP, Rab effector MyRIP, humanhuman

Predictions only

Length 859 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYRIPQ8NFW9 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
MYRIPQ8NFW9 STK38L-201ENST00000389032 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MYRIPQ8NFW9 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MYRIPQ8NFW9 TNRC18P1-201ENST00000502875 3650 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
MYRIPQ8NFW9 SLC13A4-201ENST00000354042 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MYRIPQ8NFW9 TRIM25-201ENST00000316881 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MYRIPQ8NFW9 NRP2-202ENST00000357118 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MYRIPQ8NFW9 YTHDF3-205ENST00000539294 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MYRIPQ8NFW9 NRP1-202ENST00000374816 2804 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MYRIPQ8NFW9 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MYRIPQ8NFW9 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MYRIPQ8NFW9 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MYRIPQ8NFW9 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
MYRIPQ8NFW9 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MYRIPQ8NFW9 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
MYRIPQ8NFW9 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MYRIPQ8NFW9 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MYRIPQ8NFW9 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MYRIPQ8NFW9 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MYRIPQ8NFW9 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MYRIPQ8NFW9 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
MYRIPQ8NFW9 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
MYRIPQ8NFW9 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MYRIPQ8NFW9 SERPING1-201ENST00000278407 2002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MYRIPQ8NFW9 NCLN-201ENST00000246117 4005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MYRIPQ8NFW9 URGCP-207ENST00000453200 4042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MYRIPQ8NFW9 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MYRIPQ8NFW9 TRPM4-202ENST00000427978 3444 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MYRIPQ8NFW9 COBLL1-225ENST00000629362 3868 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MYRIPQ8NFW9 AMT-239ENST00000636865 1914 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MYRIPQ8NFW9 CSF3R-201ENST00000331941 2375 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MYRIPQ8NFW9 EME1-202ENST00000393271 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MYRIPQ8NFW9 BCL2L12-211ENST00000614495 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MYRIPQ8NFW9 ZNF473-203ENST00000445728 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MYRIPQ8NFW9 SKP2-209ENST00000620197 3255 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MYRIPQ8NFW9 GPRASP1-203ENST00000444152 5809 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MYRIPQ8NFW9 MYO1C-218ENST00000575158 4804 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MYRIPQ8NFW9 TIPARP-201ENST00000295924 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MYRIPQ8NFW9 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MYRIPQ8NFW9 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MYRIPQ8NFW9 HDAC8-207ENST00000373573 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MYRIPQ8NFW9 ZNF124-202ENST00000472531 2243 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MYRIPQ8NFW9 GRIK4-202ENST00000438375 4214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MYRIPQ8NFW9 LINC02188-202ENST00000569740 3775 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MYRIPQ8NFW9 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MYRIPQ8NFW9 DPY19L2P2-205ENST00000439473 3994 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MYRIPQ8NFW9 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MYRIPQ8NFW9 BSCL2-206ENST00000405837 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MYRIPQ8NFW9 CDH8-201ENST00000299345 3728 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MYRIPQ8NFW9 MAP7D3-201ENST00000316077 4567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MYRIPQ8NFW9 RPS15A-213ENST00000576436 2190 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MYRIPQ8NFW9 CDC42SE2-202ENST00000395246 3485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MYRIPQ8NFW9 PIK3R3-203ENST00000420542 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MYRIPQ8NFW9 VTI1B-204ENST00000554659 5351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MYRIPQ8NFW9 C9orf170-201ENST00000623052 3239 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MYRIPQ8NFW9 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MYRIPQ8NFW9 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MYRIPQ8NFW9 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MYRIPQ8NFW9 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MYRIPQ8NFW9 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MYRIPQ8NFW9 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MYRIPQ8NFW9 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
MYRIPQ8NFW9 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MYRIPQ8NFW9 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MYRIPQ8NFW9 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MYRIPQ8NFW9 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MYRIPQ8NFW9 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MYRIPQ8NFW9 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MYRIPQ8NFW9 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MYRIPQ8NFW9 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MYRIPQ8NFW9 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MYRIPQ8NFW9 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MYRIPQ8NFW9 AL928654.5-201ENST00000624831 2501 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
MYRIPQ8NFW9 WWC2-201ENST00000403733 8826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MYRIPQ8NFW9 ARHGAP45-203ENST00000543365 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MYRIPQ8NFW9 XRCC6-201ENST00000359308 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MYRIPQ8NFW9 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MYRIPQ8NFW9 BCL9L-201ENST00000334801 10005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MYRIPQ8NFW9 DHCR24-201ENST00000371269 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MYRIPQ8NFW9 ACOT7-203ENST00000377845 1432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MYRIPQ8NFW9 MATN2-211ENST00000521689 3554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MYRIPQ8NFW9 EPM2A-207ENST00000611340 2786 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MYRIPQ8NFW9 FGGY-201ENST00000303721 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MYRIPQ8NFW9 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MYRIPQ8NFW9 ADAMTSL1-204ENST00000380545 1562 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MYRIPQ8NFW9 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MYRIPQ8NFW9 MYH16-204ENST00000452010 1599 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MYRIPQ8NFW9 PXDN-201ENST00000252804 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MYRIPQ8NFW9 NTNG1-204ENST00000370067 4628 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MYRIPQ8NFW9 DDX49-214ENST00000629999 1912 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MYRIPQ8NFW9 KDM6B-201ENST00000254846 6713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MYRIPQ8NFW9 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MYRIPQ8NFW9 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MYRIPQ8NFW9 KBTBD7-201ENST00000379483 4734 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MYRIPQ8NFW9 ACTN1-202ENST00000376839 2824 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MYRIPQ8NFW9 AL731571.1-201ENST00000617058 5428 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
MYRIPQ8NFW9 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
MYRIPQ8NFW9 GTPBP1-201ENST00000216044 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MYRIPQ8NFW9 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MYRIPQ8NFW9 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 120.4 ms