Protein–RNA interactions for Protein: Q8N488

RYBP, RING1 and YY1-binding protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RYBPQ8N488 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RYBPQ8N488 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RYBPQ8N488 TMEM106C-201ENST00000256686 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RYBPQ8N488 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RYBPQ8N488 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RYBPQ8N488 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RYBPQ8N488 DKFZP434A062-201ENST00000573103 5021 ntBASIC15.07■□□□□ 0
RYBPQ8N488 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RYBPQ8N488 TNIK-204ENST00000436636 6970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RYBPQ8N488 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RYBPQ8N488 RIC1-204ENST00000418622 6658 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RYBPQ8N488 PCDHA5-201ENST00000529619 4157 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RYBPQ8N488 ACSF2-202ENST00000427954 2251 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
RYBPQ8N488 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
RYBPQ8N488 RSPRY1-202ENST00000537866 3586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
RYBPQ8N488 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RYBPQ8N488 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RYBPQ8N488 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RYBPQ8N488 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RYBPQ8N488 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
RYBPQ8N488 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RYBPQ8N488 SMARCA4-204ENST00000444061 4938 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RYBPQ8N488 PDE8B-203ENST00000340978 3426 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RYBPQ8N488 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RYBPQ8N488 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RYBPQ8N488 SOAT1-203ENST00000539888 6794 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
RYBPQ8N488 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RYBPQ8N488 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RYBPQ8N488 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RYBPQ8N488 RPS3-201ENST00000278572 907 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
RYBPQ8N488 CDKN1A-202ENST00000373711 793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RYBPQ8N488 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
RYBPQ8N488 LILRA5-204ENST00000486742 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RYBPQ8N488 AC020659.2-202ENST00000512295 513 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
RYBPQ8N488 AL163636.1-201ENST00000554286 915 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RYBPQ8N488 PIGH-209ENST00000559581 1049 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
RYBPQ8N488 AP003096.1-203ENST00000564469 563 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
RYBPQ8N488 NRN1L-202ENST00000576147 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
RYBPQ8N488 NAT9-222ENST00000583476 583 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
RYBPQ8N488 AC011495.3-201ENST00000596472 427 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
RYBPQ8N488 CLEC11A-202ENST00000599973 1026 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RYBPQ8N488 AC005695.3-201ENST00000614522 232 ntBASIC15.06■□□□□ 0
RYBPQ8N488 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RYBPQ8N488 PSMC3-212ENST00000602866 1373 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RYBPQ8N488 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RYBPQ8N488 STYXL1-201ENST00000248600 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RYBPQ8N488 CHRD-206ENST00000450923 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RYBPQ8N488 LINC01205-202ENST00000497996 1493 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
RYBPQ8N488 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
RYBPQ8N488 KCNH4-201ENST00000264661 3920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RYBPQ8N488 GRIN1-203ENST00000371550 3940 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RYBPQ8N488 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RYBPQ8N488 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
RYBPQ8N488 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RYBPQ8N488 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RYBPQ8N488 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RYBPQ8N488 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
RYBPQ8N488 ARHGAP4-203ENST00000370028 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
RYBPQ8N488 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
RYBPQ8N488 ADCYAP1R1-207ENST00000614107 6575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
RYBPQ8N488 SLC26A1-201ENST00000361661 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
RYBPQ8N488 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
RYBPQ8N488 TMCC3-201ENST00000261226 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
RYBPQ8N488 LINC01184-204ENST00000501702 2977 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
RYBPQ8N488 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
RYBPQ8N488 ZC3HAV1-204ENST00000471652 3182 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RYBPQ8N488 ANKRD13B-201ENST00000394859 3214 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
RYBPQ8N488 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RYBPQ8N488 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
RYBPQ8N488 CABLES2-201ENST00000279101 3785 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
RYBPQ8N488 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RYBPQ8N488 COX6A2-201ENST00000287490 440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RYBPQ8N488 GPR148-201ENST00000309926 1267 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
RYBPQ8N488 TREM2-203ENST00000373122 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RYBPQ8N488 MOGAT3-202ENST00000379423 933 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RYBPQ8N488 KLK8-204ENST00000391806 1051 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RYBPQ8N488 LINC01840-201ENST00000421870 571 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
RYBPQ8N488 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RYBPQ8N488 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RYBPQ8N488 AC021723.1-201ENST00000486306 515 ntBASIC15.05■□□□□ -0
RYBPQ8N488 ROPN1B-210ENST00000514116 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RYBPQ8N488 PAX5-211ENST00000522003 1019 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RYBPQ8N488 PLEKHB1-206ENST00000535129 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
RYBPQ8N488 AC008115.1-201ENST00000542291 150 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RYBPQ8N488 AC126696.1-201ENST00000561567 756 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
RYBPQ8N488 AC021594.1-201ENST00000587174 636 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
RYBPQ8N488 AC008537.4-201ENST00000595728 1103 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
RYBPQ8N488 AL358473.2-201ENST00000610411 556 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
RYBPQ8N488 FDPS-221ENST00000612683 1198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
RYBPQ8N488 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RYBPQ8N488 AC010547.4-201ENST00000561754 1378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
RYBPQ8N488 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
RYBPQ8N488 COL20A1-203ENST00000422202 8097 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
RYBPQ8N488 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
RYBPQ8N488 SLC8B1-202ENST00000546737 1656 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RYBPQ8N488 CENPK-202ENST00000396679 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RYBPQ8N488 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RYBPQ8N488 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
RYBPQ8N488 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
RYBPQ8N488 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms