Protein–RNA interactions for Protein: Q86SS6

SYT9, Synaptotagmin-9, humanhuman

Predictions only

Length 491 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT9Q86SS6 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
SYT9Q86SS6 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
SYT9Q86SS6 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
SYT9Q86SS6 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
SYT9Q86SS6 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
SYT9Q86SS6 HMGB3P14-201ENST00000494195 599 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
SYT9Q86SS6 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC13.21□□□□□ -0.29
SYT9Q86SS6 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
SYT9Q86SS6 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC13.21□□□□□ -0.29
SYT9Q86SS6 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
SYT9Q86SS6 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC13.21□□□□□ -0.29
SYT9Q86SS6 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
SYT9Q86SS6 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
SYT9Q86SS6 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
SYT9Q86SS6 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
SYT9Q86SS6 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
SYT9Q86SS6 ACTG1P22-201ENST00000603793 1099 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
SYT9Q86SS6 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
SYT9Q86SS6 ATP8B3-201ENST00000310127 5095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
SYT9Q86SS6 ZNF239-203ENST00000426961 2027 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
SYT9Q86SS6 FBXO3-203ENST00000526785 5798 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
SYT9Q86SS6 PIGT-203ENST00000372689 1971 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
SYT9Q86SS6 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
SYT9Q86SS6 CDK20-201ENST00000325303 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
SYT9Q86SS6 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
SYT9Q86SS6 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
SYT9Q86SS6 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.3
SYT9Q86SS6 SSTR1-201ENST00000267377 4295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.3
SYT9Q86SS6 KIF6-203ENST00000394362 2394 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
SYT9Q86SS6 ITGAM-202ENST00000544665 4718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
SYT9Q86SS6 EPHB3-201ENST00000330394 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
SYT9Q86SS6 ADK-205ENST00000539909 1866 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.3
SYT9Q86SS6 VWA8-201ENST00000281496 3475 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
SYT9Q86SS6 HOXA3-201ENST00000317201 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SYT9Q86SS6 ARHGEF26-202ENST00000465093 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SYT9Q86SS6 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SYT9Q86SS6 ARHGAP4-201ENST00000350060 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SYT9Q86SS6 FGD6-203ENST00000546711 4568 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SYT9Q86SS6 FFAR4-201ENST00000371481 3605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SYT9Q86SS6 FKBP9-214ENST00000538336 3621 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SYT9Q86SS6 PSIP1-204ENST00000380738 3364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SYT9Q86SS6 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SYT9Q86SS6 PEX5L-211ENST00000472994 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SYT9Q86SS6 ZNRF3-202ENST00000406323 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SYT9Q86SS6 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SYT9Q86SS6 RPS6KC1-201ENST00000366959 5454 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SYT9Q86SS6 RPS6KC1-202ENST00000366960 5490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SYT9Q86SS6 ALOX15B-201ENST00000380173 2605 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SYT9Q86SS6 COL6A1-207ENST00000612273 3251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SYT9Q86SS6 TGFBRAP1-201ENST00000258449 2827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SYT9Q86SS6 PPT1-213ENST00000641319 2388 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
SYT9Q86SS6 MCRIP1-207ENST00000574190 2775 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SYT9Q86SS6 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SYT9Q86SS6 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SYT9Q86SS6 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SYT9Q86SS6 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SYT9Q86SS6 PRKY-203ENST00000528056 7218 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SYT9Q86SS6 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SYT9Q86SS6 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SYT9Q86SS6 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SYT9Q86SS6 AC013391.2-201ENST00000559041 501 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SYT9Q86SS6 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SYT9Q86SS6 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SYT9Q86SS6 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SYT9Q86SS6 MAN2B1-203ENST00000456935 3184 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SYT9Q86SS6 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SYT9Q86SS6 COL8A2-201ENST00000303143 4447 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SYT9Q86SS6 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SYT9Q86SS6 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SYT9Q86SS6 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SYT9Q86SS6 GPT2-201ENST00000340124 3984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SYT9Q86SS6 CCDC43-203ENST00000588210 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SYT9Q86SS6 IQCE-216ENST00000611775 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SYT9Q86SS6 HARS2-201ENST00000230771 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SYT9Q86SS6 NUDT4-201ENST00000337179 9753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SYT9Q86SS6 SNAP91-215ENST00000521743 4263 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SYT9Q86SS6 STARD8-201ENST00000252336 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SYT9Q86SS6 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SYT9Q86SS6 ZFP36L1-201ENST00000336440 3026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SYT9Q86SS6 YTHDF3-205ENST00000539294 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SYT9Q86SS6 SDC2-201ENST00000302190 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SYT9Q86SS6 ZBTB7B-202ENST00000368426 3594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SYT9Q86SS6 NLRP2B-201ENST00000434992 3194 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SYT9Q86SS6 FAM200B-201ENST00000422728 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SYT9Q86SS6 ISLR-202ENST00000395118 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SYT9Q86SS6 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SYT9Q86SS6 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SYT9Q86SS6 IGF2-203ENST00000381395 4527 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SYT9Q86SS6 CCDC186-202ENST00000369286 1928 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SYT9Q86SS6 PTPA-205ENST00000357197 2653 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
SYT9Q86SS6 RGMB-201ENST00000308234 4580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SYT9Q86SS6 USP44-203ENST00000537435 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SYT9Q86SS6 ADAMTS10-201ENST00000270328 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
SYT9Q86SS6 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
SYT9Q86SS6 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
SYT9Q86SS6 LINC00174-204ENST00000421767 4702 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
SYT9Q86SS6 DNM1-212ENST00000627543 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
SYT9Q86SS6 AGGF1P1-201ENST00000509500 2073 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
SYT9Q86SS6 AC138894.1-201ENST00000635887 2824 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
SYT9Q86SS6 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
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