Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXH8

CCBE1, Collagen and calcium-binding EGF domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 406 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCBE1Q6UXH8 ANKRD11-203ENST00000378330 9132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CCBE1Q6UXH8 PPP2R1B-204ENST00000426998 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CCBE1Q6UXH8 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CCBE1Q6UXH8 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CCBE1Q6UXH8 ARHGEF2-201ENST00000313667 2958 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CCBE1Q6UXH8 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CCBE1Q6UXH8 PGGHG-204ENST00000409655 2963 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CCBE1Q6UXH8 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
CCBE1Q6UXH8 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CCBE1Q6UXH8 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CCBE1Q6UXH8 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
CCBE1Q6UXH8 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CCBE1Q6UXH8 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CCBE1Q6UXH8 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CCBE1Q6UXH8 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CCBE1Q6UXH8 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
CCBE1Q6UXH8 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CCBE1Q6UXH8 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
CCBE1Q6UXH8 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CCBE1Q6UXH8 AOC1-201ENST00000360937 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CCBE1Q6UXH8 NTRK2-203ENST00000323115 3708 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CCBE1Q6UXH8 PLAT-205ENST00000519510 2030 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CCBE1Q6UXH8 ANKRD42-201ENST00000260047 2514 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CCBE1Q6UXH8 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CCBE1Q6UXH8 CCT7-201ENST00000258091 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CCBE1Q6UXH8 SIRT2-202ENST00000358931 1912 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CCBE1Q6UXH8 ITGB2-205ENST00000397850 3178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CCBE1Q6UXH8 NUB1-201ENST00000413040 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CCBE1Q6UXH8 USP51-201ENST00000500968 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CCBE1Q6UXH8 TRAF3IP3-204ENST00000367026 2058 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CCBE1Q6UXH8 ARMCX3-203ENST00000471229 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CCBE1Q6UXH8 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CCBE1Q6UXH8 ALDH8A1-204ENST00000367847 1587 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CCBE1Q6UXH8 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CCBE1Q6UXH8 GSE1-203ENST00000405402 4366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CCBE1Q6UXH8 NCOR2-202ENST00000404121 7175 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CCBE1Q6UXH8 AGRN-201ENST00000379370 7323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CCBE1Q6UXH8 RAB42-201ENST00000373826 1950 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CCBE1Q6UXH8 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CCBE1Q6UXH8 CREBL2-201ENST00000228865 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CCBE1Q6UXH8 TRPM5-202ENST00000528453 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CCBE1Q6UXH8 TMPRSS13-202ENST00000445164 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CCBE1Q6UXH8 FHOD3-201ENST00000257209 4967 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CCBE1Q6UXH8 NEXN-201ENST00000330010 3195 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CCBE1Q6UXH8 SLC5A4-201ENST00000266086 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CCBE1Q6UXH8 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CCBE1Q6UXH8 RSBN1-201ENST00000261441 6621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CCBE1Q6UXH8 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CCBE1Q6UXH8 TUBB8-206ENST00000568584 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CCBE1Q6UXH8 TICRR-201ENST00000268138 6775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CCBE1Q6UXH8 GOLGA6L10-209ENST00000621197 4160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CCBE1Q6UXH8 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CCBE1Q6UXH8 MAP7D2-201ENST00000379643 3918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CCBE1Q6UXH8 DNMT3B-202ENST00000328111 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CCBE1Q6UXH8 TBC1D3P2-203ENST00000581291 2088 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CCBE1Q6UXH8 RNF14-201ENST00000347642 4213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CCBE1Q6UXH8 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CCBE1Q6UXH8 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CCBE1Q6UXH8 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
CCBE1Q6UXH8 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CCBE1Q6UXH8 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CCBE1Q6UXH8 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CCBE1Q6UXH8 UBE3A-204ENST00000438097 8939 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CCBE1Q6UXH8 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CCBE1Q6UXH8 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
CCBE1Q6UXH8 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
CCBE1Q6UXH8 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CCBE1Q6UXH8 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
CCBE1Q6UXH8 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CCBE1Q6UXH8 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CCBE1Q6UXH8 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CCBE1Q6UXH8 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CCBE1Q6UXH8 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CCBE1Q6UXH8 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
CCBE1Q6UXH8 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CCBE1Q6UXH8 R3HDM2-204ENST00000402412 4372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CCBE1Q6UXH8 FUT6-205ENST00000527106 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CCBE1Q6UXH8 APBB3-202ENST00000356738 1804 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CCBE1Q6UXH8 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CCBE1Q6UXH8 KCNIP1-208ENST00000520740 1845 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CCBE1Q6UXH8 DHRS4-AS1-204ENST00000555045 1848 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CCBE1Q6UXH8 TMEM260-201ENST00000261556 4264 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CCBE1Q6UXH8 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CCBE1Q6UXH8 AC027020.2-201ENST00000602585 2389 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
CCBE1Q6UXH8 CCDC13-201ENST00000310232 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CCBE1Q6UXH8 CXCL5-201ENST00000296027 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CCBE1Q6UXH8 TMEM87A-201ENST00000307216 1598 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CCBE1Q6UXH8 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CCBE1Q6UXH8 FES-201ENST00000328850 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CCBE1Q6UXH8 NACC2-202ENST00000371753 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CCBE1Q6UXH8 RXRG-204ENST00000619224 2252 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CCBE1Q6UXH8 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CCBE1Q6UXH8 HERC5-201ENST00000264350 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CCBE1Q6UXH8 GTF2IRD1-205ENST00000476977 5868 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CCBE1Q6UXH8 AGAP10P-201ENST00000454844 2418 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
CCBE1Q6UXH8 AL031719.1-201ENST00000623365 2587 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
CCBE1Q6UXH8 AC099521.2-201ENST00000619354 2036 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
CCBE1Q6UXH8 DLGAP3-201ENST00000235180 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CCBE1Q6UXH8 PNKD-203ENST00000273077 3021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CCBE1Q6UXH8 SATB2-201ENST00000260926 5318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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