Protein–RNA interactions for Protein: Q567U6

CCDC93, Coiled-coil domain-containing protein 93, humanhuman

Predictions only

Length 631 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC93Q567U6 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC93Q567U6 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC93Q567U6 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC93Q567U6 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC93Q567U6 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC93Q567U6 ASB15-207ENST00000540573 1651 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC93Q567U6 EMP1-211ENST00000544053 1436 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC93Q567U6 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC93Q567U6 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC93Q567U6 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC93Q567U6 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC93Q567U6 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC93Q567U6 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC93Q567U6 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC93Q567U6 NOP14-AS1-201ENST00000503709 1616 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC93Q567U6 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC93Q567U6 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC93Q567U6 CNTNAP2-225ENST00000639247 2064 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC93Q567U6 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC93Q567U6 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC93Q567U6 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC93Q567U6 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC93Q567U6 AC021305.1-201ENST00000520656 1514 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC93Q567U6 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC93Q567U6 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC93Q567U6 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC93Q567U6 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC93Q567U6 JTB-202ENST00000356648 1040 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC93Q567U6 MBD3L4-201ENST00000381394 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC93Q567U6 AL365436.2-201ENST00000434112 526 ntTSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC93Q567U6 CSNK1G2P1-201ENST00000442675 955 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC93Q567U6 AC018638.5-201ENST00000450885 754 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC93Q567U6 AC073094.1-201ENST00000453798 433 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC93Q567U6 LINC01563-201ENST00000456235 750 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC93Q567U6 FAM86B3P-203ENST00000523992 854 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC93Q567U6 SLC25A21-203ENST00000555449 1023 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC93Q567U6 SNRPA1-216ENST00000626000 539 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC93Q567U6 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC93Q567U6 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC93Q567U6 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC93Q567U6 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC93Q567U6 LAIR1-209ENST00000434277 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC93Q567U6 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC93Q567U6 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC93Q567U6 GNAO1-205ENST00000563661 1351 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC93Q567U6 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC93Q567U6 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC93Q567U6 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC93Q567U6 AC006372.4-201ENST00000624122 1543 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC93Q567U6 APTX-211ENST00000463596 1345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC93Q567U6 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC93Q567U6 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC93Q567U6 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC93Q567U6 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC93Q567U6 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC93Q567U6 RBM4B-201ENST00000310046 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC93Q567U6 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC93Q567U6 COX14-201ENST00000317943 708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC93Q567U6 TRPM2-AS-201ENST00000423310 586 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC93Q567U6 FAM92A-202ENST00000423990 914 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC93Q567U6 FAHD2CP-203ENST00000467292 965 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC93Q567U6 PGAM1P12-201ENST00000505622 748 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC93Q567U6 FAM86KP-201ENST00000509817 987 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC93Q567U6 PIGT-208ENST00000545755 1158 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC93Q567U6 NACA-221ENST00000552540 1074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC93Q567U6 AC020636.2-201ENST00000569170 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC93Q567U6 SNHG25-202ENST00000582965 278 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC93Q567U6 AC055811.3-201ENST00000584952 686 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC93Q567U6 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC93Q567U6 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC93Q567U6 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC93Q567U6 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC93Q567U6 LGALS12-202ENST00000340246 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC93Q567U6 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC93Q567U6 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC93Q567U6 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC93Q567U6 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC93Q567U6 MBP-204ENST00000382582 2281 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC93Q567U6 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC93Q567U6 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC93Q567U6 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC93Q567U6 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC93Q567U6 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC93Q567U6 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC93Q567U6 TUBA3C-202ENST00000618094 1386 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC93Q567U6 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC93Q567U6 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC93Q567U6 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC93Q567U6 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC93Q567U6 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC93Q567U6 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC93Q567U6 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC93Q567U6 LINC00963-203ENST00000423918 1654 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC93Q567U6 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC93Q567U6 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC93Q567U6 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC93Q567U6 UBL4B-201ENST00000334179 1478 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC93Q567U6 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC93Q567U6 GTF3C6-201ENST00000329970 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC93Q567U6 COX20P1-201ENST00000366529 357 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms