Protein–RNA interactions for Protein: Q53GQ0

HSD17B12, Very-long-chain 3-oxoacyl-CoA reductase, humanhuman

Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSD17B12Q53GQ0 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
HSD17B12Q53GQ0 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
HSD17B12Q53GQ0 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
HSD17B12Q53GQ0 NIPAL3-203ENST00000358028 1757 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
HSD17B12Q53GQ0 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
HSD17B12Q53GQ0 PNMA5-205ENST00000535214 3198 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
HSD17B12Q53GQ0 ATL2-210ENST00000452935 2199 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
HSD17B12Q53GQ0 FARP2-201ENST00000264042 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
HSD17B12Q53GQ0 PORCN-204ENST00000361988 1672 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
HSD17B12Q53GQ0 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
HSD17B12Q53GQ0 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
HSD17B12Q53GQ0 NFE2L1-218ENST00000583378 2051 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
HSD17B12Q53GQ0 PUF60-209ENST00000527197 1559 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
HSD17B12Q53GQ0 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
HSD17B12Q53GQ0 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
HSD17B12Q53GQ0 GAP43-202ENST00000393780 1901 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
HSD17B12Q53GQ0 MEGF11-201ENST00000288745 5707 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
HSD17B12Q53GQ0 EXOC6B-201ENST00000272427 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
HSD17B12Q53GQ0 OS9-218ENST00000551035 2246 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
HSD17B12Q53GQ0 ALOX15B-201ENST00000380173 2605 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
HSD17B12Q53GQ0 PRRT3-203ENST00000412055 3761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
HSD17B12Q53GQ0 MOG-221ENST00000376917 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
HSD17B12Q53GQ0 DDC-AS1-201ENST00000454521 1776 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
HSD17B12Q53GQ0 FHOD3-206ENST00000590592 4869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
HSD17B12Q53GQ0 ELAVL1-201ENST00000407627 6015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
HSD17B12Q53GQ0 NFKB1-201ENST00000226574 4085 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
HSD17B12Q53GQ0 MEAF6-204ENST00000373075 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
HSD17B12Q53GQ0 HPD-204ENST00000543163 1709 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
HSD17B12Q53GQ0 MIR9-3HG-201ENST00000536780 4778 ntTSL 3 BASIC12.97□□□□□ -0.33
HSD17B12Q53GQ0 R3HDM2-204ENST00000402412 4372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
HSD17B12Q53GQ0 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
HSD17B12Q53GQ0 CNTN2-201ENST00000331830 7999 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
HSD17B12Q53GQ0 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
HSD17B12Q53GQ0 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
HSD17B12Q53GQ0 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
HSD17B12Q53GQ0 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
HSD17B12Q53GQ0 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
HSD17B12Q53GQ0 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
HSD17B12Q53GQ0 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
HSD17B12Q53GQ0 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
HSD17B12Q53GQ0 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC12.97□□□□□ -0.33
HSD17B12Q53GQ0 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
HSD17B12Q53GQ0 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
HSD17B12Q53GQ0 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
HSD17B12Q53GQ0 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.97□□□□□ -0.33
HSD17B12Q53GQ0 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
HSD17B12Q53GQ0 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
HSD17B12Q53GQ0 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
HSD17B12Q53GQ0 AC015688.4-201ENST00000580780 1647 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
HSD17B12Q53GQ0 TINF2-215ENST00000626689 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
HSD17B12Q53GQ0 SCN2B-201ENST00000278947 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
HSD17B12Q53GQ0 RNF167-201ENST00000262482 1915 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
HSD17B12Q53GQ0 MAP3K4-203ENST00000366920 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
HSD17B12Q53GQ0 CD300LB-202ENST00000392621 2286 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
HSD17B12Q53GQ0 PRAMEF8-202ENST00000614831 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
HSD17B12Q53GQ0 PRAMEF7-202ENST00000616979 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
HSD17B12Q53GQ0 AC051649.2-201ENST00000640310 3319 ntAPPRIS P1 BASIC12.97□□□□□ -0.33
HSD17B12Q53GQ0 DSTN-201ENST00000246069 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
HSD17B12Q53GQ0 AC004899.2-201ENST00000622993 3860 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
HSD17B12Q53GQ0 CYP4F11-204ENST00000591841 2531 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
HSD17B12Q53GQ0 ARAP1-202ENST00000359373 5767 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
HSD17B12Q53GQ0 MGRN1-203ENST00000415496 6405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
HSD17B12Q53GQ0 GTF2I-215ENST00000614986 4415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
HSD17B12Q53GQ0 GTF2I-221ENST00000621734 4412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
HSD17B12Q53GQ0 INPP5E-201ENST00000371712 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
HSD17B12Q53GQ0 CENPBD1-201ENST00000314994 2744 ntAPPRIS P1 BASIC12.97□□□□□ -0.33
HSD17B12Q53GQ0 DNMT3B-202ENST00000328111 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
HSD17B12Q53GQ0 PML-202ENST00000268059 3029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
HSD17B12Q53GQ0 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
HSD17B12Q53GQ0 FAM200B-201ENST00000422728 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
HSD17B12Q53GQ0 OS9-206ENST00000435406 2346 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
HSD17B12Q53GQ0 PRKAB1-201ENST00000229328 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
HSD17B12Q53GQ0 THSD7A-205ENST00000617773 10583 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
HSD17B12Q53GQ0 MIR497HG-202ENST00000572453 3838 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
HSD17B12Q53GQ0 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
HSD17B12Q53GQ0 SCAF4-202ENST00000399804 4127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
HSD17B12Q53GQ0 SHCBP1-201ENST00000303383 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
HSD17B12Q53GQ0 AGL-203ENST00000361915 7368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
HSD17B12Q53GQ0 BCL2L11-221ENST00000621302 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
HSD17B12Q53GQ0 BCL2L11-222ENST00000622509 5231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
HSD17B12Q53GQ0 TYK2-205ENST00000525621 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
HSD17B12Q53GQ0 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
HSD17B12Q53GQ0 PSIP1-203ENST00000380733 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
HSD17B12Q53GQ0 VPS9D1-202ENST00000561976 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
HSD17B12Q53GQ0 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
HSD17B12Q53GQ0 DNM2-204ENST00000408974 3013 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
HSD17B12Q53GQ0 MARVELD2-203ENST00000436532 1563 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
HSD17B12Q53GQ0 STK26-202ENST00000394334 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
HSD17B12Q53GQ0 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
HSD17B12Q53GQ0 C11orf21-201ENST00000381153 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
HSD17B12Q53GQ0 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
HSD17B12Q53GQ0 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
HSD17B12Q53GQ0 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
HSD17B12Q53GQ0 SLC6A12-207ENST00000536824 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
HSD17B12Q53GQ0 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC12.96□□□□□ -0.33
HSD17B12Q53GQ0 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
HSD17B12Q53GQ0 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
HSD17B12Q53GQ0 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
HSD17B12Q53GQ0 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
HSD17B12Q53GQ0 PCTP-207ENST00000576183 2680 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.1 ms