Protein–RNA interactions for Protein: Q4G0W2

DUSP28, Dual specificity phosphatase 28, humanhuman

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP28Q4G0W2 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DUSP28Q4G0W2 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DUSP28Q4G0W2 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DUSP28Q4G0W2 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DUSP28Q4G0W2 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DUSP28Q4G0W2 VPS25-201ENST00000253794 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DUSP28Q4G0W2 CST5-201ENST00000304710 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DUSP28Q4G0W2 EEF1B2-203ENST00000392222 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DUSP28Q4G0W2 PPP1R2P4-201ENST00000424051 595 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
DUSP28Q4G0W2 NUBP1-202ENST00000433392 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DUSP28Q4G0W2 KRT18P66-201ENST00000452970 1269 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
DUSP28Q4G0W2 SCARNA12-201ENST00000459155 270 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
DUSP28Q4G0W2 DMKN-229ENST00000467637 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DUSP28Q4G0W2 AC091179.2-201ENST00000495536 532 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DUSP28Q4G0W2 FAM60A-207ENST00000542983 738 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DUSP28Q4G0W2 ZNF124-206ENST00000543802 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DUSP28Q4G0W2 DCTPP1-202ENST00000565758 749 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DUSP28Q4G0W2 AC012645.2-201ENST00000566190 553 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DUSP28Q4G0W2 AC136624.2-201ENST00000574883 542 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DUSP28Q4G0W2 RN7SL357P-201ENST00000581065 298 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
DUSP28Q4G0W2 STRADA-221ENST00000582137 1238 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DUSP28Q4G0W2 AL021707.6-201ENST00000609212 491 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
DUSP28Q4G0W2 SLC41A3-204ENST00000383598 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DUSP28Q4G0W2 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DUSP28Q4G0W2 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DUSP28Q4G0W2 INTS11-248ENST00000545578 2263 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DUSP28Q4G0W2 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DUSP28Q4G0W2 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DUSP28Q4G0W2 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DUSP28Q4G0W2 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DUSP28Q4G0W2 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DUSP28Q4G0W2 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
DUSP28Q4G0W2 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
DUSP28Q4G0W2 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
DUSP28Q4G0W2 OR3A2-205ENST00000641164 2033 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
DUSP28Q4G0W2 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
DUSP28Q4G0W2 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
DUSP28Q4G0W2 LAIR1-209ENST00000434277 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
DUSP28Q4G0W2 PAX5-214ENST00000523241 1342 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
DUSP28Q4G0W2 C12orf76-207ENST00000549724 1302 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
DUSP28Q4G0W2 ZNF581-203ENST00000587252 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
DUSP28Q4G0W2 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
DUSP28Q4G0W2 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
DUSP28Q4G0W2 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
DUSP28Q4G0W2 LCE3B-201ENST00000335633 288 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
DUSP28Q4G0W2 LEMD1-205ENST00000367154 786 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
DUSP28Q4G0W2 NPPC-202ENST00000409852 1051 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
DUSP28Q4G0W2 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
DUSP28Q4G0W2 ATP1A4-205ENST00000470705 886 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
DUSP28Q4G0W2 LINC00634-202ENST00000505157 222 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
DUSP28Q4G0W2 AC084752.1-201ENST00000509766 622 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
DUSP28Q4G0W2 AC095040.1-201ENST00000513286 675 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
DUSP28Q4G0W2 EMP2-203ENST00000536829 781 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
DUSP28Q4G0W2 MIR5196-201ENST00000578146 115 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
DUSP28Q4G0W2 AC008687.1-201ENST00000591656 786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
DUSP28Q4G0W2 MIR6756-201ENST00000616240 63 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
DUSP28Q4G0W2 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
DUSP28Q4G0W2 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
DUSP28Q4G0W2 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
DUSP28Q4G0W2 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
DUSP28Q4G0W2 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
DUSP28Q4G0W2 TAF9-202ENST00000328663 1461 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
DUSP28Q4G0W2 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.15
DUSP28Q4G0W2 AKR1C2-202ENST00000421196 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
DUSP28Q4G0W2 RBP1-205ENST00000492918 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
DUSP28Q4G0W2 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
DUSP28Q4G0W2 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
DUSP28Q4G0W2 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
DUSP28Q4G0W2 PPM1L-201ENST00000295839 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
DUSP28Q4G0W2 ARMCX6-208ENST00000539247 1928 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.15
DUSP28Q4G0W2 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
DUSP28Q4G0W2 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
DUSP28Q4G0W2 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DUSP28Q4G0W2 ZCCHC17-201ENST00000344147 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DUSP28Q4G0W2 LTF-202ENST00000417439 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DUSP28Q4G0W2 AC055854.1-203ENST00000521141 1630 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DUSP28Q4G0W2 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DUSP28Q4G0W2 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DUSP28Q4G0W2 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DUSP28Q4G0W2 SIAE-206ENST00000618733 1980 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DUSP28Q4G0W2 C8G-201ENST00000224181 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DUSP28Q4G0W2 MAGOH-202ENST00000371470 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DUSP28Q4G0W2 CCDC167-201ENST00000373408 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DUSP28Q4G0W2 BX679664.3-201ENST00000414070 555 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
DUSP28Q4G0W2 IZUMO1R-202ENST00000440961 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DUSP28Q4G0W2 RPL35P9-201ENST00000446059 350 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
DUSP28Q4G0W2 RGS5-216ENST00000449680 788 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DUSP28Q4G0W2 TIMP1-205ENST00000456754 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DUSP28Q4G0W2 AC113935.1-201ENST00000471722 555 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
DUSP28Q4G0W2 SOX2-OT-208ENST00000477928 902 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DUSP28Q4G0W2 APOPT1-209ENST00000492189 513 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DUSP28Q4G0W2 AC034231.1-201ENST00000507251 537 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DUSP28Q4G0W2 MAX-218ENST00000557746 571 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DUSP28Q4G0W2 AC024361.2-201ENST00000574471 898 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DUSP28Q4G0W2 AC015917.2-201ENST00000580714 493 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DUSP28Q4G0W2 SLC12A5-219ENST00000628272 401 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DUSP28Q4G0W2 LINC00431-202ENST00000636375 159 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
DUSP28Q4G0W2 AC114296.1-204ENST00000637197 1173 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DUSP28Q4G0W2 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DUSP28Q4G0W2 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.6 ms