Protein–RNA interactions for Protein: Q15836

VAMP3, Vesicle-associated membrane protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP3Q15836 PLAG1-203ENST00000429357 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
VAMP3Q15836 C1GALT1-205ENST00000436587 6235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.75
VAMP3Q15836 AC007603.1-201ENST00000563124 2085 ntTSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.75
VAMP3Q15836 CSNK1G1-205ENST00000607537 2083 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
VAMP3Q15836 PDZRN3-205ENST00000466780 2737 ntTSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.75
VAMP3Q15836 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
VAMP3Q15836 UNC45B-201ENST00000268876 5679 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.75
VAMP3Q15836 SLC16A2-201ENST00000587091 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
VAMP3Q15836 MSH6-213ENST00000614496 4150 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
VAMP3Q15836 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
VAMP3Q15836 AC073862.5-201ENST00000624129 2027 ntBASIC10.4□□□□□ -0.75
VAMP3Q15836 MISP-201ENST00000215582 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
VAMP3Q15836 PSAP-202ENST00000394936 2872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
VAMP3Q15836 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
VAMP3Q15836 MYO5B-201ENST00000285039 9505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
VAMP3Q15836 TGFBI-201ENST00000442011 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
VAMP3Q15836 BBS1-202ENST00000393994 1790 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
VAMP3Q15836 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
VAMP3Q15836 DPY19L1-201ENST00000310974 4870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
VAMP3Q15836 CNTD1-204ENST00000588408 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
VAMP3Q15836 LANCL1-207ENST00000450366 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
VAMP3Q15836 RUFY4-202ENST00000374155 2977 ntTSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
VAMP3Q15836 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
VAMP3Q15836 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
VAMP3Q15836 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
VAMP3Q15836 AC005041.1-201ENST00000517883 7033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
VAMP3Q15836 AC006450.3-201ENST00000453529 2146 ntTSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
VAMP3Q15836 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
VAMP3Q15836 PLIN3-201ENST00000221957 2333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
VAMP3Q15836 AC012617.1-204ENST00000586340 2305 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
VAMP3Q15836 FKBP4-201ENST00000001008 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
VAMP3Q15836 MFAP3L-201ENST00000361618 6318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
VAMP3Q15836 INO80-211ENST00000616814 4272 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
VAMP3Q15836 CASP7-201ENST00000345633 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
VAMP3Q15836 CDH16-204ENST00000565796 2694 ntTSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
VAMP3Q15836 HYLS1-202ENST00000425380 2061 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.39□□□□□ -0.75
VAMP3Q15836 PSG8-AS1-201ENST00000425668 1873 ntTSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
VAMP3Q15836 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
VAMP3Q15836 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
VAMP3Q15836 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
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VAMP3Q15836 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
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VAMP3Q15836 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
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VAMP3Q15836 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
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VAMP3Q15836 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
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VAMP3Q15836 CAGE1-201ENST00000296742 2821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
VAMP3Q15836 RPS24-204ENST00000440692 2814 ntTSL 3 BASIC10.39□□□□□ -0.75
VAMP3Q15836 DDX5-210ENST00000578804 2021 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
VAMP3Q15836 ZSCAN32-202ENST00000396846 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
VAMP3Q15836 ZSCAN32-203ENST00000396852 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
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VAMP3Q15836 CAMKK2-205ENST00000392474 4453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
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VAMP3Q15836 BCKDK-204ENST00000394951 2164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
VAMP3Q15836 BICRAL-203ENST00000614467 6510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
VAMP3Q15836 DNAJB12-203ENST00000444643 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
VAMP3Q15836 ANXA11-201ENST00000265447 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
VAMP3Q15836 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
VAMP3Q15836 NKTR-201ENST00000232978 7343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
VAMP3Q15836 GEMIN4-207ENST00000576778 4729 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
VAMP3Q15836 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
VAMP3Q15836 GRIK1-206ENST00000399913 3234 ntTSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
VAMP3Q15836 STX16-205ENST00000361830 4318 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
VAMP3Q15836 ACTN2-201ENST00000366578 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
VAMP3Q15836 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
VAMP3Q15836 SRP54-201ENST00000216774 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
VAMP3Q15836 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
VAMP3Q15836 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
VAMP3Q15836 RAPGEF3-202ENST00000395358 4092 ntTSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
VAMP3Q15836 WDR92-201ENST00000295121 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
VAMP3Q15836 COL11A1-202ENST00000358392 7327 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
VAMP3Q15836 GSN-205ENST00000373823 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
VAMP3Q15836 EPHB6-211ENST00000619012 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
VAMP3Q15836 APOL3-205ENST00000397293 2214 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
VAMP3Q15836 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
VAMP3Q15836 FBXO44-202ENST00000251547 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
VAMP3Q15836 RPH3A-201ENST00000389385 4679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
VAMP3Q15836 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
VAMP3Q15836 MAT2B-204ENST00000518095 3409 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
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