Protein–RNA interactions for Protein: Q15811

ITSN1, Intersectin-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,721 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITSN1Q15811 AL009176.1-201ENST00000607876 650 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
ITSN1Q15811 ESR1-214ENST00000638569 132 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ITSN1Q15811 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ITSN1Q15811 AC022007.1-201ENST00000383808 1897 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ITSN1Q15811 DIRAS3-201ENST00000370981 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ITSN1Q15811 AGPAT3-218ENST00000546158 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ITSN1Q15811 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ITSN1Q15811 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ITSN1Q15811 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ITSN1Q15811 ENO2-211ENST00000541477 2549 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ITSN1Q15811 AC006450.3-201ENST00000453529 2146 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ITSN1Q15811 RNF167-201ENST00000262482 1915 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ITSN1Q15811 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ITSN1Q15811 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ITSN1Q15811 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ITSN1Q15811 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
ITSN1Q15811 FKBP4P8-201ENST00000610931 1369 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
ITSN1Q15811 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ITSN1Q15811 C11orf49-203ENST00000378618 1166 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ITSN1Q15811 FES-203ENST00000394302 2133 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ITSN1Q15811 SKA1-202ENST00000398452 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ITSN1Q15811 ACTBP14-201ENST00000411655 1089 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
ITSN1Q15811 AC087203.1-201ENST00000532111 1181 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
ITSN1Q15811 AC009779.3-204ENST00000549424 367 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ITSN1Q15811 BATF-202ENST00000555504 361 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ITSN1Q15811 AC016266.1-201ENST00000557558 729 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ITSN1Q15811 CES1P2-201ENST00000566467 1242 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
ITSN1Q15811 ACSM5-206ENST00000575584 1130 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ITSN1Q15811 RNF103-CHMP3-202ENST00000604011 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ITSN1Q15811 AP000769.1-203ENST00000637245 208 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
ITSN1Q15811 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ITSN1Q15811 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ITSN1Q15811 MSRA-201ENST00000317173 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ITSN1Q15811 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ITSN1Q15811 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ITSN1Q15811 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ITSN1Q15811 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ITSN1Q15811 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ITSN1Q15811 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ITSN1Q15811 PSMG2-201ENST00000317615 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ITSN1Q15811 PPARG-205ENST00000397010 2017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ITSN1Q15811 C12orf73-201ENST00000378090 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ITSN1Q15811 MORN2-201ENST00000340556 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ITSN1Q15811 HMGA1P1-201ENST00000415560 1062 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
ITSN1Q15811 LINC01656-201ENST00000415702 630 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ITSN1Q15811 AC012506.1-201ENST00000423706 525 ntTSL 4 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ITSN1Q15811 HNRNPA1P2-207ENST00000432375 960 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
ITSN1Q15811 AL356218.1-201ENST00000450864 353 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ITSN1Q15811 COQ10BP2-201ENST00000513804 724 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
ITSN1Q15811 AC026191.1-204ENST00000517846 608 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ITSN1Q15811 AC023968.2-201ENST00000560593 1049 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
ITSN1Q15811 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ITSN1Q15811 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ITSN1Q15811 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ITSN1Q15811 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
ITSN1Q15811 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ITSN1Q15811 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ITSN1Q15811 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ITSN1Q15811 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ITSN1Q15811 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ITSN1Q15811 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ITSN1Q15811 C16orf45-202ENST00000452191 1865 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ITSN1Q15811 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ITSN1Q15811 OR7E115P-201ENST00000382617 1024 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
ITSN1Q15811 AC099567.1-201ENST00000414418 931 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ITSN1Q15811 NME6-208ENST00000435684 599 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ITSN1Q15811 AC063952.3-201ENST00000467756 308 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
ITSN1Q15811 AP005212.2-201ENST00000584979 510 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
ITSN1Q15811 AP001029.1-201ENST00000589843 168 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ITSN1Q15811 UXT-AS1-202ENST00000591832 565 ntTSL 4 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ITSN1Q15811 AP003392.6-201ENST00000607709 325 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
ITSN1Q15811 CD79B-201ENST00000006750 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ITSN1Q15811 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ITSN1Q15811 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ITSN1Q15811 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ITSN1Q15811 TOR2A-202ENST00000373281 2477 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ITSN1Q15811 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ITSN1Q15811 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ITSN1Q15811 SELENOV-202ENST00000423711 1701 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ITSN1Q15811 CSRP1-202ENST00000367306 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ITSN1Q15811 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ITSN1Q15811 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ITSN1Q15811 CMBL-201ENST00000296658 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ITSN1Q15811 SC5D-201ENST00000264027 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ITSN1Q15811 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ITSN1Q15811 WAC-AS1-202ENST00000528337 2608 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ITSN1Q15811 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ITSN1Q15811 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ITSN1Q15811 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ITSN1Q15811 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ITSN1Q15811 AC004754.1-201ENST00000600536 2242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ITSN1Q15811 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ITSN1Q15811 DPEP2-202ENST00000393847 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ITSN1Q15811 EPPIN-201ENST00000336443 1217 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ITSN1Q15811 RPRD2-201ENST00000369067 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ITSN1Q15811 HIST1H4B-201ENST00000377745 438 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ITSN1Q15811 UPK1A-202ENST00000379013 1016 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ITSN1Q15811 AP001628.2-201ENST00000420273 784 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ITSN1Q15811 RN7SL351P-201ENST00000469306 248 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
ITSN1Q15811 MRPS36-204ENST00000512880 1200 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms