Protein–RNA interactions for Protein: Q15543

TAF13, Transcription initiation factor TFIID subunit 13, humanhuman

Predictions only

Length 124 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF13Q15543 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
TAF13Q15543 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
TAF13Q15543 AC007920.1-201ENST00000356133 2674 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
TAF13Q15543 CAMK2D-204ENST00000394522 2696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
TAF13Q15543 FRMD8-202ENST00000355991 3514 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
TAF13Q15543 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
TAF13Q15543 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
TAF13Q15543 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
TAF13Q15543 MAPK10-262ENST00000641051 5738 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
TAF13Q15543 MLXIPL-203ENST00000354613 3215 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
TAF13Q15543 SNX33-201ENST00000308527 8008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
TAF13Q15543 AL354702.1-201ENST00000442006 1960 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
TAF13Q15543 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
TAF13Q15543 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
TAF13Q15543 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
TAF13Q15543 AC007603.1-201ENST00000563124 2085 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
TAF13Q15543 SLC39A8-203ENST00000424970 4032 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
TAF13Q15543 CENPP-203ENST00000375587 8766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
TAF13Q15543 SEMA4B-201ENST00000332496 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
TAF13Q15543 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
TAF13Q15543 ZNF747-202ENST00000395094 3504 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
TAF13Q15543 ALDH8A1-204ENST00000367847 1587 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
TAF13Q15543 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TAF13Q15543 P4HA1-205ENST00000440381 2790 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
TAF13Q15543 FAM160A2-202ENST00000449352 3354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TAF13Q15543 KLHL13-207ENST00000540167 3396 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
TAF13Q15543 LINC00475-202ENST00000416438 2506 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
TAF13Q15543 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TAF13Q15543 CILP2-201ENST00000291495 4199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TAF13Q15543 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
TAF13Q15543 ZW10-201ENST00000200135 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TAF13Q15543 EMILIN1-201ENST00000380320 3943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TAF13Q15543 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
TAF13Q15543 SREBF1-205ENST00000395757 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
TAF13Q15543 WDR26-201ENST00000414423 6872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TAF13Q15543 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
TAF13Q15543 FES-203ENST00000394302 2133 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
TAF13Q15543 ITSN1-208ENST00000399349 5191 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TAF13Q15543 MLXIPL-205ENST00000429400 3173 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TAF13Q15543 RAB6B-201ENST00000285208 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TAF13Q15543 CORO7-201ENST00000251166 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TAF13Q15543 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TAF13Q15543 DHX37-201ENST00000308736 4550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TAF13Q15543 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TAF13Q15543 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TAF13Q15543 AC004754.1-201ENST00000600536 2242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
TAF13Q15543 PDE7B-203ENST00000615259 5234 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TAF13Q15543 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TAF13Q15543 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TAF13Q15543 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
TAF13Q15543 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
TAF13Q15543 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
TAF13Q15543 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
TAF13Q15543 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
TAF13Q15543 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC13.15□□□□□ -0.3
TAF13Q15543 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
TAF13Q15543 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TAF13Q15543 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC13.15□□□□□ -0.3
TAF13Q15543 STK32B-201ENST00000282908 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TAF13Q15543 ADCY7-202ENST00000394697 6213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
TAF13Q15543 EP400NL-206ENST00000446190 3697 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
TAF13Q15543 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TAF13Q15543 ADCY7-208ENST00000566433 2535 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
TAF13Q15543 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
TAF13Q15543 TGM6-202ENST00000381423 2158 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TAF13Q15543 TTC39A-202ENST00000262676 6287 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
TAF13Q15543 KIAA1683-201ENST00000392413 4402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TAF13Q15543 FAAP100-201ENST00000327787 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TAF13Q15543 SPOUT1-201ENST00000361256 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TAF13Q15543 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TAF13Q15543 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
TAF13Q15543 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC13.15□□□□□ -0.31
TAF13Q15543 THBS4-201ENST00000350881 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
TAF13Q15543 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TAF13Q15543 TPRX1-202ENST00000535759 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TAF13Q15543 APLP2-203ENST00000338167 3270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TAF13Q15543 ZNF79-202ENST00000543471 2194 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TAF13Q15543 ZNF79-203ENST00000612342 2192 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TAF13Q15543 LBH-201ENST00000395323 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TAF13Q15543 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TAF13Q15543 DNMT3B-202ENST00000328111 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TAF13Q15543 GAS2L2-202ENST00000604641 3014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TAF13Q15543 ZNF790-207ENST00000614179 2361 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TAF13Q15543 SLC4A7-214ENST00000455077 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TAF13Q15543 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TAF13Q15543 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TAF13Q15543 AMOTL2-212ENST00000514516 4521 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TAF13Q15543 GPT2-201ENST00000340124 3984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TAF13Q15543 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TAF13Q15543 ARHGEF10-207ENST00000520359 5472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TAF13Q15543 NFKB2-204ENST00000428099 3416 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TAF13Q15543 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TAF13Q15543 HSPA7-201ENST00000445535 1927 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
TAF13Q15543 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TAF13Q15543 KDELR2-201ENST00000258739 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TAF13Q15543 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TAF13Q15543 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TAF13Q15543 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TAF13Q15543 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TAF13Q15543 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.9 ms