Protein–RNA interactions for Protein: Q14258

TRIM25, E3 ubiquitin/ISG15 ligase TRIM25, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 630 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM25Q14258 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
TRIM25Q14258 SORD2P-201ENST00000558556 1069 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
TRIM25Q14258 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
TRIM25Q14258 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
TRIM25Q14258 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
TRIM25Q14258 CLN8-204ENST00000519254 1769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
TRIM25Q14258 CIT-219ENST00000612548 1799 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
TRIM25Q14258 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
TRIM25Q14258 OLFML2A-203ENST00000373580 6425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
TRIM25Q14258 SUCO-201ENST00000263688 5556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
TRIM25Q14258 SNCAIP-203ENST00000379538 2588 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
TRIM25Q14258 CBLB-204ENST00000405772 3237 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
TRIM25Q14258 MSTO1-202ENST00000368341 2245 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
TRIM25Q14258 RTFDC1-201ENST00000023939 1745 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
TRIM25Q14258 C12orf73-201ENST00000378090 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
TRIM25Q14258 SSTR5-AS1-204ENST00000569832 2864 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
TRIM25Q14258 POLD1-214ENST00000613923 3542 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
TRIM25Q14258 CENPL-202ENST00000356198 2357 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
TRIM25Q14258 WASHC5-202ENST00000517845 3667 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
TRIM25Q14258 PCDHB18P-202ENST00000526308 3197 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
TRIM25Q14258 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
TRIM25Q14258 FASN-206ENST00000634990 8407 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
TRIM25Q14258 LHFPL2-201ENST00000380345 5043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
TRIM25Q14258 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
TRIM25Q14258 COG3-206ENST00000617493 1809 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
TRIM25Q14258 NEU3-201ENST00000294064 6728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
TRIM25Q14258 MRPL17-201ENST00000288937 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
TRIM25Q14258 CLCN7-203ENST00000448525 4151 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
TRIM25Q14258 CACNA1G-233ENST00000515765 6981 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
TRIM25Q14258 PSAP-202ENST00000394936 2872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
TRIM25Q14258 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
TRIM25Q14258 HMGCL-203ENST00000374490 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
TRIM25Q14258 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
TRIM25Q14258 GEM-201ENST00000297596 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
TRIM25Q14258 NFATC2-203ENST00000414705 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
TRIM25Q14258 ZNF721-205ENST00000511833 2966 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.94□□□□□ -0.18
TRIM25Q14258 RAB40A-202ENST00000372633 3126 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
TRIM25Q14258 RNF216-202ENST00000389902 3293 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
TRIM25Q14258 METAP1D-201ENST00000315796 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
TRIM25Q14258 USP2-201ENST00000260187 3732 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
TRIM25Q14258 ACAP2-201ENST00000326793 7160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
TRIM25Q14258 SLC1A6-201ENST00000221742 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
TRIM25Q14258 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
TRIM25Q14258 OTP-201ENST00000306422 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
TRIM25Q14258 KDELR1-201ENST00000330720 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
TRIM25Q14258 CDK5RAP3-201ENST00000338399 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
TRIM25Q14258 B4GALT3-202ENST00000367998 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
TRIM25Q14258 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
TRIM25Q14258 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
TRIM25Q14258 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
TRIM25Q14258 MED15-204ENST00000406969 3210 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
TRIM25Q14258 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
TRIM25Q14258 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
TRIM25Q14258 THRB-AS1-202ENST00000438096 702 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
TRIM25Q14258 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
TRIM25Q14258 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
TRIM25Q14258 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
TRIM25Q14258 AP006333.2-201ENST00000544948 732 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
TRIM25Q14258 AC103988.2-201ENST00000561804 725 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
TRIM25Q14258 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
TRIM25Q14258 SATB2-211ENST00000614512 4972 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
TRIM25Q14258 TP73-211ENST00000604074 4806 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
TRIM25Q14258 ENO2-201ENST00000229277 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
TRIM25Q14258 TBCE-207ENST00000543662 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
TRIM25Q14258 SYNE3-201ENST00000334258 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
TRIM25Q14258 SCARB2-227ENST00000640957 3255 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
TRIM25Q14258 KBTBD7-201ENST00000379483 4734 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
TRIM25Q14258 DHCR24-201ENST00000371269 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
TRIM25Q14258 ZNF772-204ENST00000427512 5130 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
TRIM25Q14258 RUFY4-201ENST00000344321 2352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
TRIM25Q14258 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
TRIM25Q14258 RCAN3-207ENST00000538532 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
TRIM25Q14258 BRPF1-205ENST00000433861 4304 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
TRIM25Q14258 LINC01257-201ENST00000376678 2473 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
TRIM25Q14258 TRIM69-206ENST00000559390 2486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
TRIM25Q14258 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
TRIM25Q14258 HHEX-202ENST00000472590 1605 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
TRIM25Q14258 PDE2A-203ENST00000418754 2855 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
TRIM25Q14258 PLCD4-202ENST00000417849 2738 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
TRIM25Q14258 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
TRIM25Q14258 AMPD2-219ENST00000528667 3134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
TRIM25Q14258 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
TRIM25Q14258 AAR2-202ENST00000373932 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
TRIM25Q14258 CBX3-201ENST00000337620 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
TRIM25Q14258 MAP7-201ENST00000354570 4152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
TRIM25Q14258 CALB1-201ENST00000265431 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
TRIM25Q14258 LIMD1-202ENST00000440097 2773 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
TRIM25Q14258 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
TRIM25Q14258 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
TRIM25Q14258 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
TRIM25Q14258 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC13.93□□□□□ -0.18
TRIM25Q14258 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC13.93□□□□□ -0.18
TRIM25Q14258 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
TRIM25Q14258 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
TRIM25Q14258 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
TRIM25Q14258 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
TRIM25Q14258 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
TRIM25Q14258 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
TRIM25Q14258 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
TRIM25Q14258 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.5 ms