Protein–RNA interactions for Protein: Q13635

PTCH1, Protein patched homolog 1, humanhuman

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Length 1,447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTCH1Q13635 FAM21EP-201ENST00000417804 985 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
PTCH1Q13635 CCDC12-202ENST00000425441 1097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
PTCH1Q13635 AC103702.2-203ENST00000425510 379 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
PTCH1Q13635 GNAT1-202ENST00000433068 1224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
PTCH1Q13635 FOXP4-AS1-205ENST00000454812 575 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
PTCH1Q13635 TAGLN3-203ENST00000455401 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PTCH1Q13635 AC092896.1-201ENST00000465850 380 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
PTCH1Q13635 IGHEP1-201ENST00000521393 651 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
PTCH1Q13635 ORMDL2-205ENST00000552672 760 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
PTCH1Q13635 HNRNPA1P5-201ENST00000558213 966 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
PTCH1Q13635 FAM192A-218ENST00000567439 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
PTCH1Q13635 TUBB6-214ENST00000592683 481 ntTSL 4 BASIC19.75■□□□□ 0.75
PTCH1Q13635 AL031673.1-201ENST00000611460 466 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
PTCH1Q13635 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PTCH1Q13635 TRMT10B-202ENST00000377753 2027 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
PTCH1Q13635 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
PTCH1Q13635 AC007952.5-201ENST00000572818 1486 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
PTCH1Q13635 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PTCH1Q13635 CHI3L1-201ENST00000255409 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PTCH1Q13635 TARBP2-202ENST00000394357 1402 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
PTCH1Q13635 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PTCH1Q13635 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
PTCH1Q13635 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PTCH1Q13635 ELP4-228ENST00000640954 1612 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
PTCH1Q13635 TRIM23-202ENST00000274327 1829 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PTCH1Q13635 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PTCH1Q13635 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PTCH1Q13635 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PTCH1Q13635 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
PTCH1Q13635 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
PTCH1Q13635 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PTCH1Q13635 ZNF614-202ENST00000356322 1293 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PTCH1Q13635 GALP-201ENST00000357330 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PTCH1Q13635 NSMCE1-201ENST00000361439 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PTCH1Q13635 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PTCH1Q13635 TRAPPC3-201ENST00000373159 590 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
PTCH1Q13635 LST1-204ENST00000376086 554 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PTCH1Q13635 GALP-202ENST00000440823 889 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
PTCH1Q13635 AC128689.1-202ENST00000459861 827 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
PTCH1Q13635 CD300LF-206ENST00000464910 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PTCH1Q13635 AC108471.2-201ENST00000533736 1061 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
PTCH1Q13635 C12orf57-204ENST00000540506 551 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
PTCH1Q13635 ANAPC11-206ENST00000571874 636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
PTCH1Q13635 FAM32A-204ENST00000588367 798 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
PTCH1Q13635 KXD1-211ENST00000599319 707 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
PTCH1Q13635 AP000356.3-203ENST00000614808 601 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
PTCH1Q13635 AL592295.3-201ENST00000637155 863 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
PTCH1Q13635 RPF1-201ENST00000370654 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PTCH1Q13635 VDAC2-202ENST00000313132 1467 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PTCH1Q13635 TBC1D27-202ENST00000424239 1573 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
PTCH1Q13635 DPEP2-202ENST00000393847 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PTCH1Q13635 CALCB-203ENST00000533448 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
PTCH1Q13635 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PTCH1Q13635 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
PTCH1Q13635 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PTCH1Q13635 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
PTCH1Q13635 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
PTCH1Q13635 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
PTCH1Q13635 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
PTCH1Q13635 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
PTCH1Q13635 AC006450.3-201ENST00000453529 2146 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
PTCH1Q13635 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
PTCH1Q13635 ALDOA-204ENST00000412304 1603 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PTCH1Q13635 BCCIP-203ENST00000368759 1433 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PTCH1Q13635 KLK4-201ENST00000324041 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PTCH1Q13635 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PTCH1Q13635 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
PTCH1Q13635 PDE8B-203ENST00000340978 3426 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PTCH1Q13635 LINC01662-201ENST00000342888 1859 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
PTCH1Q13635 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PTCH1Q13635 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PTCH1Q13635 RPL13AP3-202ENST00000494676 1473 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
PTCH1Q13635 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
PTCH1Q13635 PLA2G12B-201ENST00000373032 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PTCH1Q13635 COLEC11-204ENST00000402794 1134 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PTCH1Q13635 SIX3-AS1-201ENST00000419364 844 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
PTCH1Q13635 IQCF4-202ENST00000422896 745 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
PTCH1Q13635 AC093609.1-201ENST00000434020 952 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
PTCH1Q13635 AC005777.1-201ENST00000588332 187 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
PTCH1Q13635 ZNF737-204ENST00000596797 569 ntTSL 4 BASIC19.73■□□□□ 0.75
PTCH1Q13635 PTOV1-AS2-203ENST00000601893 719 ntTSL 4 BASIC19.73■□□□□ 0.75
PTCH1Q13635 AC005274.1-201ENST00000623460 802 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
PTCH1Q13635 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PTCH1Q13635 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
PTCH1Q13635 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
PTCH1Q13635 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PTCH1Q13635 INTS11-248ENST00000545578 2263 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
PTCH1Q13635 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
PTCH1Q13635 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
PTCH1Q13635 ZNF79-202ENST00000543471 2194 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
PTCH1Q13635 ZNF79-203ENST00000612342 2192 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
PTCH1Q13635 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PTCH1Q13635 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
PTCH1Q13635 MKRN2-202ENST00000411987 1436 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
PTCH1Q13635 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PTCH1Q13635 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PTCH1Q13635 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PTCH1Q13635 TMEM56-RWDD3-202ENST00000604534 1491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
PTCH1Q13635 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PTCH1Q13635 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
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