Protein–RNA interactions for Protein: Q13620

CUL4B, Cullin-4B, humanhuman

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Length 913 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4BQ13620 DCUN1D3-201ENST00000324344 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CUL4BQ13620 LCMT1-203ENST00000399069 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CUL4BQ13620 AC010547.4-201ENST00000561754 1378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CUL4BQ13620 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CUL4BQ13620 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CUL4BQ13620 ZNF70-201ENST00000341976 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CUL4BQ13620 SMARCA2-214ENST00000450198 5602 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CUL4BQ13620 FBXL7-203ENST00000510662 1758 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CUL4BQ13620 LINC01667-202ENST00000623919 1422 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CUL4BQ13620 SRSF2-203ENST00000392485 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CUL4BQ13620 GPR68-203ENST00000531499 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CUL4BQ13620 AC027288.3-202ENST00000550268 1820 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CUL4BQ13620 DDC-213ENST00000617822 1809 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CUL4BQ13620 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CUL4BQ13620 PRKAB1-201ENST00000229328 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CUL4BQ13620 NCKAP5L-201ENST00000335999 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CUL4BQ13620 CCT7-201ENST00000258091 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CUL4BQ13620 AP000552.1-203ENST00000416615 1930 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CUL4BQ13620 PHAX-201ENST00000297540 4288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CUL4BQ13620 FRMD8-202ENST00000355991 3514 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CUL4BQ13620 MEF2D-201ENST00000348159 5965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CUL4BQ13620 SFSWAP-201ENST00000261674 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CUL4BQ13620 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CUL4BQ13620 LRP5L-202ENST00000402859 1661 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CUL4BQ13620 GTF2IRD1-205ENST00000476977 5868 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CUL4BQ13620 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CUL4BQ13620 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CUL4BQ13620 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CUL4BQ13620 MAP2K4-201ENST00000353533 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CUL4BQ13620 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CUL4BQ13620 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CUL4BQ13620 ATP6V1E1-202ENST00000399796 1208 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CUL4BQ13620 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CUL4BQ13620 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CUL4BQ13620 SNHG14-209ENST00000456576 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CUL4BQ13620 AC106047.1-202ENST00000467484 482 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CUL4BQ13620 RPL23A-206ENST00000496182 636 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CUL4BQ13620 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CUL4BQ13620 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CUL4BQ13620 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CUL4BQ13620 ZNF720-210ENST00000534369 791 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CUL4BQ13620 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CUL4BQ13620 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CUL4BQ13620 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CUL4BQ13620 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CUL4BQ13620 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CUL4BQ13620 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CUL4BQ13620 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CUL4BQ13620 CHD1L-211ENST00000639534 1144 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CUL4BQ13620 CYP4B1-215ENST00000640628 969 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CUL4BQ13620 HIPK3-201ENST00000303296 7408 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CUL4BQ13620 BLK-201ENST00000259089 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CUL4BQ13620 AAK1-202ENST00000409068 2606 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CUL4BQ13620 CALCR-203ENST00000394441 1774 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CUL4BQ13620 TRIM23-202ENST00000274327 1829 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CUL4BQ13620 NEAT1-201ENST00000499732 1811 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CUL4BQ13620 RRP1B-201ENST00000340648 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CUL4BQ13620 RASGEF1A-202ENST00000374459 3264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CUL4BQ13620 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CUL4BQ13620 ZNF516-201ENST00000443185 8118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CUL4BQ13620 SLCO4C1-201ENST00000310954 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CUL4BQ13620 POLM-202ENST00000335195 2444 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CUL4BQ13620 JPH1-201ENST00000342232 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CUL4BQ13620 SEPT7-201ENST00000350320 4350 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CUL4BQ13620 RILPL1-202ENST00000376874 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CUL4BQ13620 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CUL4BQ13620 AC090643.2-201ENST00000623442 2029 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CUL4BQ13620 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CUL4BQ13620 MROH1-207ENST00000528919 5234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CUL4BQ13620 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CUL4BQ13620 AC012184.2-203ENST00000443119 2110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CUL4BQ13620 TRIM17-203ENST00000366697 2652 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CUL4BQ13620 PRPH-201ENST00000257860 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CUL4BQ13620 MLXIPL-204ENST00000414749 3224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CUL4BQ13620 TINF2-215ENST00000626689 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CUL4BQ13620 TBC1D24-205ENST00000567020 6673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CUL4BQ13620 ASB3-202ENST00000394717 1734 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CUL4BQ13620 FGD5-206ENST00000543601 5768 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CUL4BQ13620 DDX59-206ENST00000447706 2900 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CUL4BQ13620 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CUL4BQ13620 ZBTB7B-202ENST00000368426 3594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CUL4BQ13620 UBTF-205ENST00000526094 2459 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CUL4BQ13620 BRD1-205ENST00000457780 4997 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CUL4BQ13620 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CUL4BQ13620 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CUL4BQ13620 AL136309.1-201ENST00000403917 691 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CUL4BQ13620 ERBB3-202ENST00000411731 1027 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CUL4BQ13620 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CUL4BQ13620 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CUL4BQ13620 CHMP1AP1-201ENST00000445563 662 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CUL4BQ13620 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CUL4BQ13620 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CUL4BQ13620 ANO1-AS2-202ENST00000533327 498 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CUL4BQ13620 NR2C2AP-207ENST00000544883 899 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CUL4BQ13620 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CUL4BQ13620 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CUL4BQ13620 KRT4-204ENST00000551956 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CUL4BQ13620 TTC28-AS1-207ENST00000428584 5859 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CUL4BQ13620 AL109910.1-201ENST00000452071 1330 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CUL4BQ13620 ATP2B3-204ENST00000370186 6742 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
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