Protein–RNA interactions for Protein: Q13573

SNW1, SNW domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 536 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNW1Q13573 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SNW1Q13573 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SNW1Q13573 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SNW1Q13573 VPS18-202ENST00000558474 873 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SNW1Q13573 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SNW1Q13573 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SNW1Q13573 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SNW1Q13573 LIG1-202ENST00000427526 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SNW1Q13573 MAN2B2-202ENST00000504248 2968 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SNW1Q13573 AC020910.5-201ENST00000623668 1865 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
SNW1Q13573 PML-201ENST00000268058 4508 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SNW1Q13573 ZNF718-202ENST00000609714 2772 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SNW1Q13573 CERKL-206ENST00000410087 3208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SNW1Q13573 FERMT1-201ENST00000217289 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SNW1Q13573 RAB11FIP1-206ENST00000524118 1959 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SNW1Q13573 PAK3-208ENST00000446737 2550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SNW1Q13573 ATRN-202ENST00000446916 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SNW1Q13573 GCFC2-211ENST00000541687 4318 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SNW1Q13573 GCNT7-201ENST00000243913 2064 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SNW1Q13573 AC026992.2-202ENST00000565312 1934 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SNW1Q13573 CYP1B1-AS1-201ENST00000413828 1781 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SNW1Q13573 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SNW1Q13573 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SNW1Q13573 KDM1B-201ENST00000297792 3811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SNW1Q13573 ZFYVE28-211ENST00000515312 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SNW1Q13573 MAGEA4-201ENST00000276344 1724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SNW1Q13573 NR1H3-221ENST00000481889 1704 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SNW1Q13573 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SNW1Q13573 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SNW1Q13573 LINC01305-201ENST00000420866 3123 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SNW1Q13573 SPAG9-222ENST00000618113 8246 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SNW1Q13573 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SNW1Q13573 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SNW1Q13573 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SNW1Q13573 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SNW1Q13573 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SNW1Q13573 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SNW1Q13573 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
SNW1Q13573 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SNW1Q13573 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
SNW1Q13573 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SNW1Q13573 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SNW1Q13573 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SNW1Q13573 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SNW1Q13573 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
SNW1Q13573 AC012574.2-201ENST00000520375 443 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SNW1Q13573 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SNW1Q13573 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SNW1Q13573 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
SNW1Q13573 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SNW1Q13573 IL17RD-201ENST00000296318 8720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SNW1Q13573 IRF9-202ENST00000396864 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SNW1Q13573 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SNW1Q13573 SYNGAP1-203ENST00000428982 4339 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SNW1Q13573 NXPH1-201ENST00000405863 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SNW1Q13573 SNX30-201ENST00000374232 7622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SNW1Q13573 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
SNW1Q13573 ARID3B-201ENST00000346246 4271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SNW1Q13573 TEX44-201ENST00000313965 1383 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SNW1Q13573 ELP4-201ENST00000350638 1907 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SNW1Q13573 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SNW1Q13573 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SNW1Q13573 ACSM2A-202ENST00000396104 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SNW1Q13573 LIMS1-215ENST00000544547 4461 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SNW1Q13573 KIFC3-204ENST00000465878 3225 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SNW1Q13573 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SNW1Q13573 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SNW1Q13573 HMOX2-216ENST00000613539 1703 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SNW1Q13573 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
SNW1Q13573 NTN4-201ENST00000343702 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SNW1Q13573 AL358216.1-201ENST00000451601 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SNW1Q13573 CSNK1D-202ENST00000314028 3712 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SNW1Q13573 PHTF1-203ENST00000369600 3075 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SNW1Q13573 ISLR-202ENST00000395118 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SNW1Q13573 TAF8-202ENST00000372978 794 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SNW1Q13573 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SNW1Q13573 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SNW1Q13573 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SNW1Q13573 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SNW1Q13573 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SNW1Q13573 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SNW1Q13573 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SNW1Q13573 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SNW1Q13573 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SNW1Q13573 NOP2-211ENST00000540228 668 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SNW1Q13573 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SNW1Q13573 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SNW1Q13573 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SNW1Q13573 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SNW1Q13573 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SNW1Q13573 AC026790.1-201ENST00000399760 2941 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SNW1Q13573 TMEM63C-201ENST00000298351 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SNW1Q13573 VPS26B-201ENST00000281187 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SNW1Q13573 NUTM2A-202ENST00000381707 3290 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SNW1Q13573 NUTM2B-203ENST00000429828 3292 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SNW1Q13573 NMBR-201ENST00000258042 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SNW1Q13573 SLC9B1-201ENST00000296422 1879 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SNW1Q13573 INTS14-201ENST00000313182 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SNW1Q13573 KLHL13-207ENST00000540167 3396 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SNW1Q13573 NLRX1-204ENST00000409991 3716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 115.7 ms