Protein–RNA interactions for Protein: Q05D32

CTDSPL2, CTD small phosphatase-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSPL2Q05D32 WSCD1-202ENST00000539421 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CTDSPL2Q05D32 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CTDSPL2Q05D32 AC022400.6-201ENST00000603027 5818 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CTDSPL2Q05D32 ANXA6-202ENST00000377751 1430 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CTDSPL2Q05D32 IDH3B-212ENST00000613370 1400 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CTDSPL2Q05D32 TRAFD1-201ENST00000257604 3178 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CTDSPL2Q05D32 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CTDSPL2Q05D32 ARHGAP4-203ENST00000370028 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CTDSPL2Q05D32 AGAP9-201ENST00000452145 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CTDSPL2Q05D32 WARS-203ENST00000358655 2466 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CTDSPL2Q05D32 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CTDSPL2Q05D32 TMEM40-201ENST00000264728 984 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CTDSPL2Q05D32 TXNRD3NB-202ENST00000383572 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CTDSPL2Q05D32 HNRNPA1P41-201ENST00000397777 928 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
CTDSPL2Q05D32 AL161932.2-201ENST00000435436 679 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
CTDSPL2Q05D32 SEPT7P2-209ENST00000450436 601 ntTSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CTDSPL2Q05D32 TCEAL4-208ENST00000472484 1273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CTDSPL2Q05D32 PGAM1P5-201ENST00000548011 764 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
CTDSPL2Q05D32 AL135838.1-202ENST00000556411 441 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CTDSPL2Q05D32 CHRNA5-203ENST00000559554 1051 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CTDSPL2Q05D32 AC005586.2-201ENST00000563946 837 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
CTDSPL2Q05D32 RN7SL774P-201ENST00000577467 290 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
CTDSPL2Q05D32 LGALS3BP-202ENST00000585407 936 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CTDSPL2Q05D32 NDUFV2P1-201ENST00000596415 907 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
CTDSPL2Q05D32 MIR6074-201ENST00000612054 107 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
CTDSPL2Q05D32 AL157813.1-201ENST00000612996 587 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
CTDSPL2Q05D32 HIST1H4A-201ENST00000617569 312 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CTDSPL2Q05D32 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CTDSPL2Q05D32 NICN1-201ENST00000273598 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CTDSPL2Q05D32 NUP54-217ENST00000514987 1563 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CTDSPL2Q05D32 BPI-201ENST00000262865 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CTDSPL2Q05D32 CTNND2-202ENST00000458100 1962 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CTDSPL2Q05D32 TTC8-203ENST00000346301 2058 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CTDSPL2Q05D32 TLE3-203ENST00000451782 2356 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CTDSPL2Q05D32 PRKAG2-215ENST00000492843 2699 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CTDSPL2Q05D32 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CTDSPL2Q05D32 CHIA-206ENST00000430615 1320 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CTDSPL2Q05D32 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CTDSPL2Q05D32 LDHA-203ENST00000379412 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CTDSPL2Q05D32 KIF19-202ENST00000389916 3643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CTDSPL2Q05D32 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CTDSPL2Q05D32 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CTDSPL2Q05D32 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CTDSPL2Q05D32 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CTDSPL2Q05D32 CACNA2D4-220ENST00000585732 2566 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CTDSPL2Q05D32 UPB1-201ENST00000326010 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CTDSPL2Q05D32 AC092506.1-201ENST00000634580 2275 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CTDSPL2Q05D32 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CTDSPL2Q05D32 G6PD-201ENST00000369620 1799 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CTDSPL2Q05D32 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CTDSPL2Q05D32 APBB1-220ENST00000609331 1574 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CTDSPL2Q05D32 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CTDSPL2Q05D32 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CTDSPL2Q05D32 FOXO4-201ENST00000341558 1353 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CTDSPL2Q05D32 ZNF815P-201ENST00000421890 1352 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CTDSPL2Q05D32 AC090515.2-201ENST00000500929 1396 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CTDSPL2Q05D32 VAMP4-202ENST00000367740 1193 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CTDSPL2Q05D32 IGHV3-13-201ENST00000390602 430 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CTDSPL2Q05D32 IYD-204ENST00000392255 1180 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CTDSPL2Q05D32 XBP1P1-201ENST00000436573 652 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
CTDSPL2Q05D32 FKBP11-202ENST00000444214 630 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CTDSPL2Q05D32 PABPC5-AS1-201ENST00000456187 426 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CTDSPL2Q05D32 AL392046.1-202ENST00000457255 521 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CTDSPL2Q05D32 ADM-202ENST00000524948 584 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CTDSPL2Q05D32 AC117500.3-201ENST00000537032 666 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CTDSPL2Q05D32 AL928654.3-201ENST00000552675 445 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CTDSPL2Q05D32 TCL1A-208ENST00000556450 872 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CTDSPL2Q05D32 AC124068.2-202ENST00000562356 612 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CTDSPL2Q05D32 SSTR5-AS1-201ENST00000565992 575 ntTSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CTDSPL2Q05D32 SYT17-208ENST00000568433 812 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CTDSPL2Q05D32 AC124068.2-201ENST00000569473 1109 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
CTDSPL2Q05D32 PAM16-211ENST00000575848 518 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CTDSPL2Q05D32 PAM16-214ENST00000576217 493 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CTDSPL2Q05D32 AL645941.3-201ENST00000580587 577 ntTSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CTDSPL2Q05D32 FAM236A-201ENST00000593662 453 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CTDSPL2Q05D32 FAM236B-201ENST00000596535 465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CTDSPL2Q05D32 AL805961.1-203ENST00000641078 1258 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
CTDSPL2Q05D32 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CTDSPL2Q05D32 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CTDSPL2Q05D32 GREM1-202ENST00000560830 2648 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CTDSPL2Q05D32 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CTDSPL2Q05D32 KIAA1257-204ENST00000511438 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CTDSPL2Q05D32 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CTDSPL2Q05D32 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CTDSPL2Q05D32 HIF3A-206ENST00000472815 1709 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CTDSPL2Q05D32 GPX3-201ENST00000388825 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CTDSPL2Q05D32 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
CTDSPL2Q05D32 PLPPR1-201ENST00000374874 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
CTDSPL2Q05D32 AC117489.1-201ENST00000625169 3217 ntBASIC17.21■□□□□ 0.34
CTDSPL2Q05D32 FOXD4L5-201ENST00000377420 3109 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.34
CTDSPL2Q05D32 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
CTDSPL2Q05D32 CNOT10-201ENST00000328834 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CTDSPL2Q05D32 ABI2-215ENST00000430418 1676 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CTDSPL2Q05D32 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CTDSPL2Q05D32 RNF123-202ENST00000432042 2670 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CTDSPL2Q05D32 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CTDSPL2Q05D32 C3orf33-205ENST00000534941 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CTDSPL2Q05D32 GGACT-201ENST00000376250 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CTDSPL2Q05D32 MAX-201ENST00000246163 897 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CTDSPL2Q05D32 HIST1H2AJ-201ENST00000333151 387 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.9 ms