Protein–RNA interactions for Protein: Q01094

E2F1, Transcription factor E2F1, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F1Q01094 AC136475.1-202ENST00000602429 1151 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
E2F1Q01094 LINC00116-203ENST00000611969 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
E2F1Q01094 AC026904.3-201ENST00000636550 1530 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
E2F1Q01094 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
E2F1Q01094 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
E2F1Q01094 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
E2F1Q01094 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
E2F1Q01094 GLI2-203ENST00000361492 6768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
E2F1Q01094 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
E2F1Q01094 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
E2F1Q01094 SYBU-206ENST00000424158 3007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
E2F1Q01094 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
E2F1Q01094 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
E2F1Q01094 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
E2F1Q01094 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
E2F1Q01094 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
E2F1Q01094 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
E2F1Q01094 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
E2F1Q01094 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
E2F1Q01094 LRP10-203ENST00000546834 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
E2F1Q01094 PPM1A-203ENST00000395076 8184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
E2F1Q01094 AC245100.1-201ENST00000452996 1331 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
E2F1Q01094 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
E2F1Q01094 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
E2F1Q01094 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
E2F1Q01094 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
E2F1Q01094 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
E2F1Q01094 MSR1-201ENST00000262101 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
E2F1Q01094 MUC1-203ENST00000342482 537 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
E2F1Q01094 AP000356.3-201ENST00000382243 753 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
E2F1Q01094 CRYBB3-202ENST00000404334 601 ntTSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
E2F1Q01094 AL391119.1-201ENST00000416563 271 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
E2F1Q01094 AL589843.1-201ENST00000423924 425 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
E2F1Q01094 LINC00313-205ENST00000427188 967 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
E2F1Q01094 SAP30L-203ENST00000440364 792 ntTSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
E2F1Q01094 AC079112.1-201ENST00000454972 939 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
E2F1Q01094 UBE3B-206ENST00000536398 1120 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
E2F1Q01094 VPS18-202ENST00000558474 873 ntTSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
E2F1Q01094 REC114-202ENST00000560581 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
E2F1Q01094 HS3ST3A1-202ENST00000578576 750 ntTSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
E2F1Q01094 MIR3188-201ENST00000583494 85 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
E2F1Q01094 AC133540.1-201ENST00000620845 1019 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
E2F1Q01094 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
E2F1Q01094 GTF2IRD1-205ENST00000476977 5868 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
E2F1Q01094 AC144522.1-201ENST00000625111 1658 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
E2F1Q01094 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
E2F1Q01094 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
E2F1Q01094 AKNA-206ENST00000374088 5464 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
E2F1Q01094 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
E2F1Q01094 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
E2F1Q01094 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
E2F1Q01094 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
E2F1Q01094 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
E2F1Q01094 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
E2F1Q01094 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
E2F1Q01094 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
E2F1Q01094 BX005266.2-201ENST00000450704 1549 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
E2F1Q01094 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
E2F1Q01094 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
E2F1Q01094 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC14.21□□□□□ -0.13
E2F1Q01094 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
E2F1Q01094 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
E2F1Q01094 DDX39A-201ENST00000242776 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
E2F1Q01094 PLA1A-204ENST00000488919 1456 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
E2F1Q01094 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
E2F1Q01094 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
E2F1Q01094 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
E2F1Q01094 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC14.21□□□□□ -0.13
E2F1Q01094 AL355334.1-201ENST00000417713 215 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
E2F1Q01094 UBXN7-AS1-201ENST00000442941 386 ntTSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
E2F1Q01094 BUD31-205ENST00000456893 512 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
E2F1Q01094 LINC02417-201ENST00000542449 515 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
E2F1Q01094 AC133919.1-201ENST00000562203 416 ntTSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
E2F1Q01094 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC14.21□□□□□ -0.13
E2F1Q01094 HIST1H3C-201ENST00000612966 411 ntAPPRIS P1 BASIC14.21□□□□□ -0.13
E2F1Q01094 AL157813.1-201ENST00000612996 587 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
E2F1Q01094 AP001065.2-201ENST00000617205 644 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
E2F1Q01094 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
E2F1Q01094 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
E2F1Q01094 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
E2F1Q01094 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
E2F1Q01094 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
E2F1Q01094 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
E2F1Q01094 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
E2F1Q01094 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
E2F1Q01094 SLC35G2-201ENST00000393079 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
E2F1Q01094 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.14
E2F1Q01094 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.14
E2F1Q01094 ZCCHC17-204ENST00000546109 1705 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.14
E2F1Q01094 UNC13A-202ENST00000519716 9838 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.14
E2F1Q01094 USP19-205ENST00000398898 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.14
E2F1Q01094 CCDC51-202ENST00000412398 1385 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.14
E2F1Q01094 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC14.21□□□□□ -0.14
E2F1Q01094 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
E2F1Q01094 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
E2F1Q01094 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
E2F1Q01094 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
E2F1Q01094 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
E2F1Q01094 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
E2F1Q01094 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.6 ms