Protein–RNA interactions for Protein: P68133

ACTA1, Actin, alpha skeletal muscle, humanhuman

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTA1P68133 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
ACTA1P68133 LRSAM1-204ENST00000373324 3044 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
ACTA1P68133 CRTC1-202ENST00000338797 6929 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ACTA1P68133 PRKAB1-201ENST00000229328 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ACTA1P68133 POTEM-201ENST00000547889 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ACTA1P68133 PBRM1-204ENST00000394830 5071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ACTA1P68133 TKFC-201ENST00000394900 4696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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ACTA1P68133 SFXN3-201ENST00000224807 3089 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
ACTA1P68133 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ACTA1P68133 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
ACTA1P68133 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
ACTA1P68133 KIAA1161-201ENST00000297625 6398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ACTA1P68133 RNF14-201ENST00000347642 4213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
ACTA1P68133 NPR1-202ENST00000368680 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ACTA1P68133 SOAT1-204ENST00000540564 6861 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ACTA1P68133 MEGF8-201ENST00000251268 9549 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
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ACTA1P68133 CAMK2B-217ENST00000457475 4142 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
ACTA1P68133 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
ACTA1P68133 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ACTA1P68133 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
ACTA1P68133 CABLES2-201ENST00000279101 3785 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
ACTA1P68133 CR382287.2-201ENST00000623370 1942 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
ACTA1P68133 AMOTL2-212ENST00000514516 4521 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
ACTA1P68133 KCNAB2-219ENST00000602612 2396 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
ACTA1P68133 LARP4-201ENST00000293618 6296 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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ACTA1P68133 TMBIM6-203ENST00000423828 3254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
ACTA1P68133 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ACTA1P68133 CBX3-201ENST00000337620 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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ACTA1P68133 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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ACTA1P68133 GP6-202ENST00000333884 2210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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ACTA1P68133 GDAP1L1-207ENST00000612599 2585 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
ACTA1P68133 SSTR1-201ENST00000267377 4295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
ACTA1P68133 TCOF1-207ENST00000504761 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
ACTA1P68133 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
ACTA1P68133 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
ACTA1P68133 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
ACTA1P68133 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
ACTA1P68133 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
ACTA1P68133 ISY1-203ENST00000393295 3842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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