Protein–RNA interactions for Protein: P53609

PGGT1B, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, humanhuman

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP53609 KCNK16-205ENST00000507712 889 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PGGT1BP53609 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
PGGT1BP53609 MSC-AS1-204ENST00000518916 864 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PGGT1BP53609 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PGGT1BP53609 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PGGT1BP53609 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PGGT1BP53609 SORD2P-201ENST00000558556 1069 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
PGGT1BP53609 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PGGT1BP53609 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
PGGT1BP53609 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PGGT1BP53609 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
PGGT1BP53609 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PGGT1BP53609 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PGGT1BP53609 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PGGT1BP53609 ARRB1-202ENST00000420843 3336 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PGGT1BP53609 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PGGT1BP53609 FAM200B-201ENST00000422728 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PGGT1BP53609 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PGGT1BP53609 CENPBD1-201ENST00000314994 2744 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PGGT1BP53609 POLM-202ENST00000335195 2444 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
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PGGT1BP53609 AC008429.1-202ENST00000518818 2067 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
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PGGT1BP53609 DUS2-201ENST00000358896 1933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
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PGGT1BP53609 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
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PGGT1BP53609 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PGGT1BP53609 NMBR-201ENST00000258042 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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PGGT1BP53609 FGR-204ENST00000399173 2483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PGGT1BP53609 STK3-218ENST00000617590 2485 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PGGT1BP53609 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PGGT1BP53609 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PGGT1BP53609 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PGGT1BP53609 AL355390.1-201ENST00000325811 2328 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PGGT1BP53609 PRKAR2A-202ENST00000296446 3318 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PGGT1BP53609 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
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