Protein–RNA interactions for Protein: P50542

PEX5, Peroxisomal targeting signal 1 receptor, humanhuman

Predictions only

Length 639 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX5P50542 SYNRG-231ENST00000622045 3859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PEX5P50542 HIF3A-206ENST00000472815 1709 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PEX5P50542 COL6A4P2-202ENST00000504443 2753 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
PEX5P50542 ZBTB2-201ENST00000325144 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PEX5P50542 CAMK2D-205ENST00000394524 5294 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PEX5P50542 EBP-205ENST00000495186 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PEX5P50542 SLFNL1-204ENST00000372613 2654 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PEX5P50542 CARHSP1-220ENST00000619881 2849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PEX5P50542 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PEX5P50542 CHD4-201ENST00000357008 6496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PEX5P50542 ENDOD1-201ENST00000278505 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PEX5P50542 AC138028.2-202ENST00000567968 4528 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PEX5P50542 LIG1-202ENST00000427526 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PEX5P50542 LINC00882-204ENST00000484698 2718 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PEX5P50542 ACSF2-202ENST00000427954 2251 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PEX5P50542 POTEM-201ENST00000547889 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PEX5P50542 RPRD1A-202ENST00000399022 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PEX5P50542 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PEX5P50542 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PEX5P50542 CGB7-203ENST00000597853 3386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PEX5P50542 RAB6C-201ENST00000410061 3075 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PEX5P50542 ZNF362-201ENST00000373428 2936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PEX5P50542 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PEX5P50542 RBM47-203ENST00000381795 4473 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PEX5P50542 TMEM30B-202ENST00000555868 4471 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PEX5P50542 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PEX5P50542 ANKRD36BP2-202ENST00000421951 1899 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PEX5P50542 PRKD1-209ENST00000616995 3498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PEX5P50542 PLEKHB2-206ENST00000409612 2210 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PEX5P50542 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PEX5P50542 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PEX5P50542 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PEX5P50542 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PEX5P50542 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PEX5P50542 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PEX5P50542 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PEX5P50542 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PEX5P50542 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PEX5P50542 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PEX5P50542 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PEX5P50542 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PEX5P50542 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PEX5P50542 KIFC3-204ENST00000465878 3225 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PEX5P50542 CENPO-202ENST00000380834 4386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PEX5P50542 SOX21-AS1-201ENST00000438290 3287 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PEX5P50542 SDC1-201ENST00000254351 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PEX5P50542 RPS6KA4-201ENST00000334205 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PEX5P50542 PLPPR1-201ENST00000374874 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PEX5P50542 FGFR1-204ENST00000356207 3824 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PEX5P50542 SLC26A1-201ENST00000361661 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PEX5P50542 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PEX5P50542 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PEX5P50542 PRDM15-201ENST00000269844 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PEX5P50542 MROH1-207ENST00000528919 5234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PEX5P50542 TRIT1-214ENST00000537440 2026 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PEX5P50542 INTS14-201ENST00000313182 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PEX5P50542 POMK-201ENST00000331373 1865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PEX5P50542 PAPSS2-201ENST00000361175 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PEX5P50542 CDC25B-205ENST00000439880 3096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PEX5P50542 PDE8B-203ENST00000340978 3426 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PEX5P50542 VPS36-207ENST00000611132 4607 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PEX5P50542 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PEX5P50542 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PEX5P50542 ABCC10-201ENST00000244533 5088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PEX5P50542 MARVELD2-203ENST00000436532 1563 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PEX5P50542 PUF60-209ENST00000527197 1559 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PEX5P50542 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PEX5P50542 AL157996.1-201ENST00000624684 2299 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PEX5P50542 CFAP157-206ENST00000614677 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PEX5P50542 PIP5K1B-208ENST00000541509 2664 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PEX5P50542 ETV4-202ENST00000393664 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PEX5P50542 KIAA1468-202ENST00000398130 6178 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PEX5P50542 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PEX5P50542 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PEX5P50542 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PEX5P50542 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PEX5P50542 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PEX5P50542 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PEX5P50542 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PEX5P50542 RN7SKP175-201ENST00000408472 289 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PEX5P50542 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PEX5P50542 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PEX5P50542 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PEX5P50542 PUDPP3-201ENST00000445368 636 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PEX5P50542 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PEX5P50542 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PEX5P50542 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PEX5P50542 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PEX5P50542 AC138123.2-203ENST00000552451 653 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PEX5P50542 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PEX5P50542 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PEX5P50542 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PEX5P50542 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PEX5P50542 NATD1-201ENST00000611551 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PEX5P50542 TRIM23-202ENST00000274327 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PEX5P50542 TMUB2-211ENST00000589184 1837 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PEX5P50542 DSN1-203ENST00000373750 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PEX5P50542 PHTF2-206ENST00000422959 3525 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PEX5P50542 MAN2B2-202ENST00000504248 2968 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PEX5P50542 SAMD4B-201ENST00000314471 4519 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.4 ms