Protein–RNA interactions for Protein: P42166

TMPO, Lamina-associated polypeptide 2, isoform alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 694 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPOP42166 CHMP4BP1-201ENST00000556017 588 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
TMPOP42166 AL161670.2-201ENST00000557650 1227 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
TMPOP42166 AC129507.4-201ENST00000570501 411 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TMPOP42166 ITGA9-AS1-213ENST00000614028 913 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TMPOP42166 AC138627.1-207ENST00000641560 1006 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
TMPOP42166 PBX3-201ENST00000342287 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TMPOP42166 CD1E-206ENST00000368161 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TMPOP42166 MINPP1-202ENST00000371996 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TMPOP42166 RNF122-201ENST00000256257 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TMPOP42166 WAC-AS1-202ENST00000528337 2608 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TMPOP42166 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TMPOP42166 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TMPOP42166 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TMPOP42166 TKT-201ENST00000296289 1931 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TMPOP42166 FGFR3-203ENST00000352904 3733 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TMPOP42166 LINC00334-203ENST00000638500 1377 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TMPOP42166 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TMPOP42166 ALDOA-203ENST00000395248 2447 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TMPOP42166 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TMPOP42166 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TMPOP42166 NAXD-201ENST00000309957 2659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TMPOP42166 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TMPOP42166 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TMPOP42166 RNA5SP359-201ENST00000364838 113 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
TMPOP42166 NCR3-202ENST00000376071 541 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TMPOP42166 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TMPOP42166 TEX33-202ENST00000402860 986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TMPOP42166 PDIA3P2-201ENST00000428073 158 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
TMPOP42166 LINC01006-204ENST00000435354 545 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TMPOP42166 AC073150.1-201ENST00000450406 1084 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
TMPOP42166 IGHJ2P-201ENST00000454480 60 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
TMPOP42166 CD164-210ENST00000512821 964 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TMPOP42166 AC104561.3-201ENST00000518590 715 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TMPOP42166 ZNF419-208ENST00000518999 746 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TMPOP42166 PLA2G15-209ENST00000566188 1203 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TMPOP42166 AC145207.3-201ENST00000576784 529 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TMPOP42166 AL022334.2-201ENST00000610000 484 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
TMPOP42166 ALKBH2-208ENST00000619381 895 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TMPOP42166 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TMPOP42166 ELP4-201ENST00000350638 1907 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TMPOP42166 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TMPOP42166 SPERT-204ENST00000610924 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TMPOP42166 AL022326.1-201ENST00000434516 1778 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TMPOP42166 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
TMPOP42166 ARHGAP4-203ENST00000370028 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TMPOP42166 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TMPOP42166 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TMPOP42166 SDCBP2-AS1-201ENST00000446423 1811 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TMPOP42166 CCNH-201ENST00000256897 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TMPOP42166 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TMPOP42166 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TMPOP42166 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TMPOP42166 EFHC1-227ENST00000637089 2133 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TMPOP42166 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TMPOP42166 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TMPOP42166 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TMPOP42166 PLA1A-204ENST00000488919 1456 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TMPOP42166 ZCCHC17-207ENST00000616859 1458 ntTSL 4 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TMPOP42166 ZCCHC17-208ENST00000618216 1489 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TMPOP42166 AC016397.2-201ENST00000624848 1985 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
TMPOP42166 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TMPOP42166 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TMPOP42166 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TMPOP42166 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TMPOP42166 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TMPOP42166 CYP1A1-210ENST00000617691 2521 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TMPOP42166 DYDC2-204ENST00000372199 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TMPOP42166 ZNF77-201ENST00000314531 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TMPOP42166 ZCCHC13-201ENST00000339534 842 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TMPOP42166 MAD2L2-206ENST00000376672 1002 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TMPOP42166 UBE2I-206ENST00000403747 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TMPOP42166 DMKN-204ENST00000408915 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TMPOP42166 COPS7B-205ENST00000409295 1009 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TMPOP42166 NME6-203ENST00000415644 849 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TMPOP42166 DMAC2-203ENST00000417807 1065 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TMPOP42166 LINC00441-201ENST00000433480 1143 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TMPOP42166 AL133523.1-201ENST00000554537 331 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TMPOP42166 AC140658.4-201ENST00000561990 352 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
TMPOP42166 AC243967.2-201ENST00000601409 567 ntTSL 4 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TMPOP42166 LINC01668-201ENST00000635001 513 ntTSL 4 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TMPOP42166 C2orf68-201ENST00000306336 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TMPOP42166 GGACT-201ENST00000376250 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TMPOP42166 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TMPOP42166 ZNF362-205ENST00000539719 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TMPOP42166 ZNF785-202ENST00000470110 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TMPOP42166 TIGD1-201ENST00000408957 2625 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TMPOP42166 RASGEF1C-202ENST00000393371 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TMPOP42166 WDR5-201ENST00000358625 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TMPOP42166 UBE2A-202ENST00000371558 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TMPOP42166 EPN2-210ENST00000571254 1883 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TMPOP42166 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TMPOP42166 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TMPOP42166 GCKR-201ENST00000264717 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TMPOP42166 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TMPOP42166 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TMPOP42166 BTBD8-201ENST00000342818 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TMPOP42166 GREM1-202ENST00000560830 2648 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TMPOP42166 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TMPOP42166 SP6-201ENST00000342234 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TMPOP42166 TAF9-202ENST00000328663 1461 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92 ms