Protein–RNA interactions for Protein: P39086

GRIK1, Glutamate receptor ionotropic, kainate 1, humanhuman

Predictions only

Length 918 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK1P39086 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GRIK1P39086 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GRIK1P39086 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GRIK1P39086 ARMCX1-201ENST00000372829 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GRIK1P39086 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GRIK1P39086 CCNA1-204ENST00000630422 1751 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GRIK1P39086 ZFP90-209ENST00000570495 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GRIK1P39086 PPP1CB-203ENST00000395366 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GRIK1P39086 LMNA-213ENST00000473598 2015 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GRIK1P39086 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
GRIK1P39086 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GRIK1P39086 PTPRU-205ENST00000460170 5337 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GRIK1P39086 TPCN1-214ENST00000550785 5345 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GRIK1P39086 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GRIK1P39086 ADCY6-201ENST00000307885 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GRIK1P39086 ZNRD1ASP-217ENST00000437417 1497 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GRIK1P39086 GPSM3-209ENST00000487761 1460 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GRIK1P39086 TNFRSF11A-202ENST00000586569 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GRIK1P39086 AC067750.1-201ENST00000608826 6545 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
GRIK1P39086 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GRIK1P39086 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GRIK1P39086 ZNF664-204ENST00000538932 4321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GRIK1P39086 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GRIK1P39086 DDX21-202ENST00000620315 4829 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GRIK1P39086 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GRIK1P39086 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GRIK1P39086 ID2-203ENST00000396290 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GRIK1P39086 HHEX-202ENST00000472590 1605 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GRIK1P39086 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GRIK1P39086 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GRIK1P39086 AP000550.1-201ENST00000420508 4833 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GRIK1P39086 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GRIK1P39086 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GRIK1P39086 SYCE2-201ENST00000293695 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GRIK1P39086 CRYBA4-201ENST00000354760 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GRIK1P39086 DUSP13-202ENST00000372700 781 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GRIK1P39086 LINC00431-201ENST00000440735 1189 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GRIK1P39086 AL133466.1-201ENST00000447582 150 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
GRIK1P39086 ZNF529-AS1-201ENST00000448373 1004 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GRIK1P39086 DUSP13-206ENST00000472493 920 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GRIK1P39086 TSACC-208ENST00000481479 741 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GRIK1P39086 PMP22-206ENST00000494511 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GRIK1P39086 AC129492.3-201ENST00000498285 460 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GRIK1P39086 AC090857.1-201ENST00000527400 390 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
GRIK1P39086 AC239802.2-201ENST00000532137 554 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GRIK1P39086 AC012322.1-201ENST00000561657 861 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GRIK1P39086 JMJD8-203ENST00000562824 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GRIK1P39086 CMTM3-215ENST00000568477 687 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GRIK1P39086 CU633904.3-201ENST00000624042 1029 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
GRIK1P39086 AC138627.1-207ENST00000641560 1006 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
GRIK1P39086 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GRIK1P39086 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GRIK1P39086 TMTC1-207ENST00000552618 3915 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GRIK1P39086 ALDH8A1-204ENST00000367847 1587 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GRIK1P39086 NAA60-203ENST00000414063 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GRIK1P39086 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GRIK1P39086 ATP6V1C1-202ENST00000518738 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GRIK1P39086 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GRIK1P39086 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GRIK1P39086 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GRIK1P39086 SRSF8-201ENST00000587424 4028 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GRIK1P39086 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GRIK1P39086 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GRIK1P39086 CSTB-201ENST00000291568 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GRIK1P39086 EPAS1-201ENST00000263734 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GRIK1P39086 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GRIK1P39086 AC008132.1-202ENST00000342005 1389 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
GRIK1P39086 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GRIK1P39086 AC026992.2-202ENST00000565312 1934 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GRIK1P39086 ASGR1-201ENST00000269299 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GRIK1P39086 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GRIK1P39086 SLC35C2-213ENST00000543605 5740 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GRIK1P39086 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GRIK1P39086 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GRIK1P39086 C15orf59-204ENST00000569673 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GRIK1P39086 FAM46C-201ENST00000369448 5751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GRIK1P39086 ARF5-201ENST00000000233 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GRIK1P39086 IER3-201ENST00000259874 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GRIK1P39086 EDF1-202ENST00000371648 809 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GRIK1P39086 HHIP-AS1-201ENST00000503066 897 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GRIK1P39086 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GRIK1P39086 CCNC-217ENST00000523985 958 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GRIK1P39086 TNNT1-203ENST00000536926 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GRIK1P39086 RERG-205ENST00000537647 935 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GRIK1P39086 NAA40-206ENST00000542163 1035 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GRIK1P39086 AL132639.2-202ENST00000553520 467 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GRIK1P39086 PAM16-211ENST00000575848 518 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GRIK1P39086 PAM16-214ENST00000576217 493 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GRIK1P39086 CCDC144NL-AS1-209ENST00000577860 884 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GRIK1P39086 NFIC-204ENST00000586919 1221 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GRIK1P39086 FAM236A-201ENST00000593662 453 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GRIK1P39086 L34079.1-201ENST00000594374 393 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GRIK1P39086 FAM236B-201ENST00000596535 465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GRIK1P39086 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GRIK1P39086 AC092299.1-201ENST00000632679 757 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
GRIK1P39086 LINC01668-201ENST00000635001 513 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GRIK1P39086 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GRIK1P39086 PCCB-215ENST00000482086 1436 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GRIK1P39086 MYL6-219ENST00000551589 1438 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GRIK1P39086 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms