Protein–RNA interactions for Protein: P35638

DDIT3, DNA damage-inducible transcript 3 protein, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDIT3P35638 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
DDIT3P35638 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
DDIT3P35638 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
DDIT3P35638 KLF3-AS1-207ENST00000620339 558 ntTSL 4 BASIC17.09■□□□□ 0.33
DDIT3P35638 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
DDIT3P35638 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
DDIT3P35638 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
DDIT3P35638 PPP1R1B-203ENST00000394267 1504 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
DDIT3P35638 LRIF1-202ENST00000485275 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
DDIT3P35638 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
DDIT3P35638 PRAME-202ENST00000398743 2196 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
DDIT3P35638 CD300LB-202ENST00000392621 2286 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
DDIT3P35638 NEK4-207ENST00000535191 2452 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
DDIT3P35638 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
DDIT3P35638 NCSTN-201ENST00000294785 2936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
DDIT3P35638 TRIM46-205ENST00000392451 3195 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
DDIT3P35638 SMIM12-206ENST00000521580 3454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
DDIT3P35638 GUSBP11-206ENST00000455485 3816 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
DDIT3P35638 FOXRED2-201ENST00000216187 3933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
DDIT3P35638 LRRC8D-201ENST00000337338 3950 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
DDIT3P35638 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
DDIT3P35638 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
DDIT3P35638 B3GAT1-202ENST00000392580 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
DDIT3P35638 BICDL2-204ENST00000573514 3519 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
DDIT3P35638 PSIP1-203ENST00000380733 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
DDIT3P35638 GFPT2-201ENST00000253778 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
DDIT3P35638 CDH16-201ENST00000299752 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
DDIT3P35638 RNF26-201ENST00000311413 2787 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.33
DDIT3P35638 RPUSD4-201ENST00000298317 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
DDIT3P35638 SAP30BP-202ENST00000355423 2439 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
DDIT3P35638 GCOM1-214ENST00000587652 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
DDIT3P35638 FOS-201ENST00000303562 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
DDIT3P35638 SERPINI1-201ENST00000295777 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
DDIT3P35638 AC026271.4-201ENST00000578214 1833 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
DDIT3P35638 PORCN-204ENST00000361988 1672 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
DDIT3P35638 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
DDIT3P35638 AC024075.2-201ENST00000598112 1473 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
DDIT3P35638 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
DDIT3P35638 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
DDIT3P35638 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
DDIT3P35638 MYH14-201ENST00000262269 3848 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
DDIT3P35638 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
DDIT3P35638 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
DDIT3P35638 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
DDIT3P35638 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
DDIT3P35638 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
DDIT3P35638 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
DDIT3P35638 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
DDIT3P35638 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
DDIT3P35638 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
DDIT3P35638 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
DDIT3P35638 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
DDIT3P35638 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
DDIT3P35638 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
DDIT3P35638 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
DDIT3P35638 CCDC117-202ENST00000421503 3766 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
DDIT3P35638 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
DDIT3P35638 ASAP3-202ENST00000437606 2865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
DDIT3P35638 POC5-202ENST00000428202 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
DDIT3P35638 VPS26B-201ENST00000281187 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
DDIT3P35638 PRAME-205ENST00000405655 2179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
DDIT3P35638 INPP5E-201ENST00000371712 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
DDIT3P35638 CSRP1-201ENST00000340006 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
DDIT3P35638 MTF2-202ENST00000370303 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
DDIT3P35638 PCDHB18P-202ENST00000526308 3197 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
DDIT3P35638 SPOCK3-218ENST00000511531 2908 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
DDIT3P35638 TMEM41A-203ENST00000421852 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
DDIT3P35638 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
DDIT3P35638 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
DDIT3P35638 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
DDIT3P35638 MKNK1-203ENST00000371945 2618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
DDIT3P35638 TNFRSF1B-201ENST00000376259 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
DDIT3P35638 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
DDIT3P35638 COL4A2-AS2-201ENST00000458403 1522 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
DDIT3P35638 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
DDIT3P35638 CCNE2-205ENST00000520509 3330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
DDIT3P35638 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
DDIT3P35638 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
DDIT3P35638 MEAF6-204ENST00000373075 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
DDIT3P35638 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
DDIT3P35638 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
DDIT3P35638 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
DDIT3P35638 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
DDIT3P35638 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
DDIT3P35638 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
DDIT3P35638 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
DDIT3P35638 MVK-217ENST00000639206 367 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
DDIT3P35638 CACNA1C-231ENST00000616390 2833 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
DDIT3P35638 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
DDIT3P35638 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
DDIT3P35638 NFYC-215ENST00000456393 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
DDIT3P35638 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
DDIT3P35638 SRSF8-201ENST00000587424 4028 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
DDIT3P35638 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
DDIT3P35638 LIG1-203ENST00000536218 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
DDIT3P35638 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
DDIT3P35638 KANK2-205ENST00000589359 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
DDIT3P35638 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
DDIT3P35638 MDM1-201ENST00000303145 2918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
DDIT3P35638 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.8 ms