Protein–RNA interactions for Protein: P32243

OTX2, Homeobox protein OTX2, humanhuman

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTX2P32243 GPAT4-201ENST00000396987 6298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
OTX2P32243 CPA5-201ENST00000393213 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
OTX2P32243 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
OTX2P32243 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
OTX2P32243 IDH3B-212ENST00000613370 1400 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
OTX2P32243 AL590440.2-201ENST00000641973 1595 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
OTX2P32243 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
OTX2P32243 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
OTX2P32243 PAIP2-202ENST00000394795 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
OTX2P32243 RNF8-202ENST00000373479 5631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
OTX2P32243 AC139712.1-201ENST00000378256 1875 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
OTX2P32243 AHCYP4-201ENST00000419201 1315 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
OTX2P32243 CLEC12A-AS1-201ENST00000420905 3956 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
OTX2P32243 AJUBA-201ENST00000262713 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
OTX2P32243 SLIT1-201ENST00000266058 7925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
OTX2P32243 GPSM3-209ENST00000487761 1460 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
OTX2P32243 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
OTX2P32243 COLEC11-203ENST00000382062 1633 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
OTX2P32243 LINC01165-201ENST00000445190 1623 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
OTX2P32243 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
OTX2P32243 RREB1-202ENST00000349384 7440 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
OTX2P32243 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
OTX2P32243 CRTC1-202ENST00000338797 6929 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
OTX2P32243 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
OTX2P32243 MLF1-201ENST00000355893 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
OTX2P32243 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
OTX2P32243 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
OTX2P32243 B3GAT2-201ENST00000230053 6565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
OTX2P32243 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
OTX2P32243 SLC6A20-202ENST00000358525 5423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
OTX2P32243 ERGIC3-203ENST00000357394 1357 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
OTX2P32243 SMPDL3B-201ENST00000373888 1548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
OTX2P32243 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
OTX2P32243 NLRX1-204ENST00000409991 3716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
OTX2P32243 FECH-201ENST00000262093 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
OTX2P32243 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
OTX2P32243 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
OTX2P32243 EIF4G1-201ENST00000342981 5667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
OTX2P32243 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
OTX2P32243 GCKR-201ENST00000264717 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
OTX2P32243 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
OTX2P32243 TPM1-202ENST00000288398 1295 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
OTX2P32243 NDUFB8-201ENST00000299166 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
OTX2P32243 NUP98-201ENST00000324932 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
OTX2P32243 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
OTX2P32243 RNA5SP359-201ENST00000364838 113 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
OTX2P32243 TSPO2-201ENST00000373158 718 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
OTX2P32243 CITED1-202ENST00000373619 886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
OTX2P32243 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
OTX2P32243 ARL16-201ENST00000397498 1227 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
OTX2P32243 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
OTX2P32243 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
OTX2P32243 NOC2LP1-201ENST00000450578 752 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
OTX2P32243 LAMA4-209ENST00000453937 645 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
OTX2P32243 RN7SL258P-201ENST00000478664 300 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
OTX2P32243 AC084346.1-201ENST00000520962 528 ntTSL 4 BASIC13.6□□□□□ -0.23
OTX2P32243 NEU3-205ENST00000531619 582 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
OTX2P32243 HSD17B6-207ENST00000555805 1722 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
OTX2P32243 REC114-202ENST00000560581 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
OTX2P32243 AC135983.1-201ENST00000562108 1097 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
OTX2P32243 AC026803.1-201ENST00000569130 274 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
OTX2P32243 SHBG-207ENST00000570547 801 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
OTX2P32243 HS3ST3A1-202ENST00000578576 750 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
OTX2P32243 MIR5572-201ENST00000583188 137 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
OTX2P32243 ZNF286A-219ENST00000585194 607 ntTSL 4 BASIC13.6□□□□□ -0.23
OTX2P32243 SMIM22-209ENST00000591870 355 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
OTX2P32243 ALKBH7-202ENST00000596657 603 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
OTX2P32243 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
OTX2P32243 DYRK1B-208ENST00000601972 772 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
OTX2P32243 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
OTX2P32243 MEG3_2.1-201ENST00000611456 105 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
OTX2P32243 ROPN1-211ENST00000620893 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
OTX2P32243 ARL16-214ENST00000621051 1181 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
OTX2P32243 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
OTX2P32243 TBC1D1-201ENST00000261439 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
OTX2P32243 SUOX-204ENST00000394115 2394 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
OTX2P32243 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
OTX2P32243 GOPC-201ENST00000052569 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
OTX2P32243 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
OTX2P32243 HIGD1A-202ENST00000418900 1322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
OTX2P32243 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
OTX2P32243 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
OTX2P32243 NBPF26-208ENST00000620612 4602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
OTX2P32243 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
OTX2P32243 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
OTX2P32243 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
OTX2P32243 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
OTX2P32243 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
OTX2P32243 KCNN3-202ENST00000358505 1658 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
OTX2P32243 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
OTX2P32243 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
OTX2P32243 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
OTX2P32243 LTB4R-203ENST00000396789 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
OTX2P32243 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
OTX2P32243 MAGEA2-203ENST00000611557 2024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
OTX2P32243 C3-201ENST00000245907 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
OTX2P32243 POMK-201ENST00000331373 1865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
OTX2P32243 CDK5RAP3-201ENST00000338399 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
OTX2P32243 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
OTX2P32243 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms