Protein–RNA interactions for Protein: P30049

ATP5D, ATP synthase subunit delta, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 168 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5DP30049 TRAFD1-201ENST00000257604 3178 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATP5DP30049 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATP5DP30049 SC5D-201ENST00000264027 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATP5DP30049 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATP5DP30049 NEFH-201ENST00000310624 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATP5DP30049 CR382287.2-201ENST00000623370 1942 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATP5DP30049 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATP5DP30049 PCDH8-201ENST00000338862 3708 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATP5DP30049 TTLL4-212ENST00000457313 3723 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATP5DP30049 TSPEAR-AS2-202ENST00000354333 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATP5DP30049 GCM2-201ENST00000379491 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATP5DP30049 DUSP28-202ENST00000405954 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATP5DP30049 PTK7-203ENST00000345201 4071 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATP5DP30049 ZNF641-201ENST00000301042 4544 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATP5DP30049 FAM168B-202ENST00000409185 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATP5DP30049 CYP26B1-201ENST00000001146 4732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATP5DP30049 BEAN1-201ENST00000299694 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATP5DP30049 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATP5DP30049 LIPA-202ENST00000336233 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATP5DP30049 GPT2-201ENST00000340124 3984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATP5DP30049 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATP5DP30049 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATP5DP30049 TATDN3-201ENST00000366973 2321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATP5DP30049 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATP5DP30049 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATP5DP30049 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
ATP5DP30049 TRPV4-202ENST00000418703 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATP5DP30049 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATP5DP30049 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
ATP5DP30049 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATP5DP30049 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
ATP5DP30049 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATP5DP30049 TRIM11-204ENST00000493030 5774 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATP5DP30049 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATP5DP30049 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATP5DP30049 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATP5DP30049 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATP5DP30049 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATP5DP30049 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
ATP5DP30049 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATP5DP30049 MFSD11-217ENST00000590514 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATP5DP30049 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
ATP5DP30049 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
ATP5DP30049 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
ATP5DP30049 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATP5DP30049 GMCL1-201ENST00000282570 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATP5DP30049 ZNF251-201ENST00000292562 2807 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATP5DP30049 FAM156A-221ENST00000622447 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATP5DP30049 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATP5DP30049 IGF2BP1-201ENST00000290341 8274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATP5DP30049 DISC1-221ENST00000620189 6689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATP5DP30049 DSN1-207ENST00000448110 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATP5DP30049 MYADML-201ENST00000474610 2147 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
ATP5DP30049 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATP5DP30049 AC215219.1-201ENST00000400706 1817 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
ATP5DP30049 LINC01864-201ENST00000587218 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATP5DP30049 RARG-203ENST00000425354 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATP5DP30049 ZBTB20-215ENST00000481632 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATP5DP30049 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATP5DP30049 SGSM1-206ENST00000610372 5991 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATP5DP30049 ATP13A1-202ENST00000357324 3861 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATP5DP30049 ACAP2-201ENST00000326793 7160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATP5DP30049 USP22-201ENST00000261497 5220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATP5DP30049 DDX59-206ENST00000447706 2900 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATP5DP30049 TICRR-201ENST00000268138 6775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATP5DP30049 SMG8-201ENST00000300917 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATP5DP30049 RBBP4-204ENST00000414241 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATP5DP30049 DDX41-208ENST00000507955 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATP5DP30049 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATP5DP30049 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATP5DP30049 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATP5DP30049 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
ATP5DP30049 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
ATP5DP30049 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATP5DP30049 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
ATP5DP30049 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATP5DP30049 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATP5DP30049 WASH3P-204ENST00000558784 1644 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATP5DP30049 TP73-207ENST00000378290 1831 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATP5DP30049 MPZ-204ENST00000491222 1824 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATP5DP30049 ZFP64-203ENST00000361387 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATP5DP30049 DENND1C-202ENST00000543576 2395 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATP5DP30049 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATP5DP30049 RMDN3-201ENST00000260385 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATP5DP30049 CALML3-201ENST00000315238 2763 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATP5DP30049 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATP5DP30049 SUSD6-201ENST00000342745 5388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATP5DP30049 NUP160-201ENST00000378460 5376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATP5DP30049 ACSM2A-209ENST00000573854 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATP5DP30049 GLIS3-201ENST00000324333 6667 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ATP5DP30049 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ATP5DP30049 LRSAM1-204ENST00000373324 3044 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ATP5DP30049 C19orf66-202ENST00000397881 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ATP5DP30049 MPP2-214ENST00000523501 2121 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ATP5DP30049 HNRNPLL-209ENST00000449105 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ATP5DP30049 XG-201ENST00000381174 2315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ATP5DP30049 OCRL-201ENST00000357121 5138 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ATP5DP30049 ISY1-203ENST00000393295 3842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ATP5DP30049 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ATP5DP30049 CFAP157-206ENST00000614677 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms