Protein–RNA interactions for Protein: P23470

PTPRG, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase gamma, humanhuman

Predictions only

Length 1,445 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRGP23470 SVOPL-202ENST00000419765 1523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTPRGP23470 CES1-203ENST00000422046 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTPRGP23470 SLC20A2-207ENST00000520179 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTPRGP23470 CACNA1A-211ENST00000592864 1623 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTPRGP23470 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTPRGP23470 TMEM14B-201ENST00000379530 787 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTPRGP23470 AL773545.2-201ENST00000442149 472 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
PTPRGP23470 ALG1L15P-201ENST00000482834 794 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
PTPRGP23470 AP003031.2-205ENST00000531263 683 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTPRGP23470 ALG10B-203ENST00000551464 571 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTPRGP23470 AC016582.2-202ENST00000587765 1094 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
PTPRGP23470 ATF7-212ENST00000591397 860 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTPRGP23470 AL353622.2-201ENST00000605846 425 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
PTPRGP23470 AC048382.6-201ENST00000621980 1223 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
PTPRGP23470 HPSE2-206ENST00000628193 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTPRGP23470 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTPRGP23470 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTPRGP23470 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTPRGP23470 ERP29-202ENST00000455836 1333 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTPRGP23470 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTPRGP23470 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTPRGP23470 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTPRGP23470 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTPRGP23470 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTPRGP23470 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTPRGP23470 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTPRGP23470 FADS1-206ENST00000460649 1559 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTPRGP23470 SNRPC-202ENST00000374017 1054 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTPRGP23470 AC092810.2-201ENST00000431570 362 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
PTPRGP23470 AL365500.1-201ENST00000442783 868 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTPRGP23470 CDK4P1-201ENST00000454213 828 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
PTPRGP23470 RN7SL846P-201ENST00000467429 292 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
PTPRGP23470 C10orf91-203ENST00000490765 462 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTPRGP23470 AC011431.1-201ENST00000512971 230 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
PTPRGP23470 AL512310.5-201ENST00000551999 515 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
PTPRGP23470 ZFP1-207ENST00000567481 493 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTPRGP23470 KRT8P34-201ENST00000577607 1044 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
PTPRGP23470 LINC01029-202ENST00000578833 366 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTPRGP23470 ZNF671-203ENST00000596939 977 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTPRGP23470 Metazoa_SRP.128-201ENST00000620543 314 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
PTPRGP23470 AC245369.7-201ENST00000631386 350 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
PTPRGP23470 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTPRGP23470 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTPRGP23470 PRIMPOL-211ENST00000515774 2007 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTPRGP23470 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTPRGP23470 ARMCX6-208ENST00000539247 1928 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTPRGP23470 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTPRGP23470 AC215219.1-201ENST00000400706 1817 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
PTPRGP23470 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTPRGP23470 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTPRGP23470 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTPRGP23470 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTPRGP23470 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTPRGP23470 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTPRGP23470 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTPRGP23470 SALL4P6-201ENST00000429385 1691 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
PTPRGP23470 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTPRGP23470 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTPRGP23470 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTPRGP23470 CHRNA1-205ENST00000409542 1460 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTPRGP23470 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTPRGP23470 HLF-202ENST00000430986 1385 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTPRGP23470 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTPRGP23470 IFNA2-201ENST00000380206 1135 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTPRGP23470 MOCS1-207ENST00000432280 1071 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTPRGP23470 TIMM10-202ENST00000525158 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTPRGP23470 NPAS3-209ENST00000551008 1002 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTPRGP23470 USP32P3-202ENST00000583574 611 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTPRGP23470 AC005746.3-201ENST00000614751 393 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
PTPRGP23470 TPPP3-205ENST00000564104 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTPRGP23470 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTPRGP23470 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTPRGP23470 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTPRGP23470 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTPRGP23470 ADPRH-205ENST00000478927 1501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTPRGP23470 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
PTPRGP23470 APOBEC3A-201ENST00000249116 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTPRGP23470 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTPRGP23470 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTPRGP23470 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTPRGP23470 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTPRGP23470 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTPRGP23470 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTPRGP23470 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTPRGP23470 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTPRGP23470 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTPRGP23470 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTPRGP23470 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTPRGP23470 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTPRGP23470 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTPRGP23470 FLAD1-202ENST00000295530 1211 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTPRGP23470 DHRS7C-201ENST00000330255 1006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTPRGP23470 AIFM1-203ENST00000346424 1200 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTPRGP23470 AC103592.1-201ENST00000394513 664 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
PTPRGP23470 RPL10-203ENST00000406022 748 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTPRGP23470 LINC01885-201ENST00000414300 609 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTPRGP23470 PRKCZ-AS1-202ENST00000444529 622 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTPRGP23470 AF274856.1-202ENST00000509345 871 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTPRGP23470 CHTF8-207ENST00000520529 475 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTPRGP23470 AC004923.3-201ENST00000527532 355 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
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