Protein–RNA interactions for Protein: P19875

CXCL2, C-X-C motif chemokine 2, humanhuman

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Length 107 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL2P19875 C12orf76-205ENST00000548191 2204 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
CXCL2P19875 EPB42-210ENST00000622454 2227 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
CXCL2P19875 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
CXCL2P19875 APLP2-202ENST00000278756 3687 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
CXCL2P19875 SLC28A1-201ENST00000286749 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
CXCL2P19875 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
CXCL2P19875 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
CXCL2P19875 CDIP1-201ENST00000399599 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
CXCL2P19875 RIC1-203ENST00000414202 6774 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
CXCL2P19875 VCP-201ENST00000358901 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
CXCL2P19875 CYP2J2-201ENST00000371204 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
CXCL2P19875 PDLIM2-201ENST00000265810 4592 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
CXCL2P19875 FAM230C-201ENST00000623511 1970 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
CXCL2P19875 ITGA2B-201ENST00000262407 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
CXCL2P19875 ACO1-203ENST00000541043 3618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
CXCL2P19875 GNAL-203ENST00000423027 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
CXCL2P19875 DQX1-202ENST00000404568 2689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
CXCL2P19875 NRXN1-259ENST00000637511 3651 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
CXCL2P19875 OPA1-205ENST00000361908 6439 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
CXCL2P19875 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
CXCL2P19875 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
CXCL2P19875 IL10-202ENST00000423557 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
CXCL2P19875 ACAN-202ENST00000439576 8840 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
CXCL2P19875 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
CXCL2P19875 TNFSF8-201ENST00000223795 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
CXCL2P19875 ELF3-202ENST00000367283 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
CXCL2P19875 CDK5RAP1-202ENST00000346416 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
CXCL2P19875 LINC00638-201ENST00000555578 2518 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
CXCL2P19875 NDRG4-201ENST00000258187 3324 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
CXCL2P19875 ZNF200-205ENST00000431561 3348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
CXCL2P19875 AP3M2-202ENST00000396926 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
CXCL2P19875 NTRK2-203ENST00000323115 3708 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
CXCL2P19875 IFT122-204ENST00000349441 3569 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
CXCL2P19875 SLC13A4-201ENST00000354042 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
CXCL2P19875 NAALADL1-201ENST00000340252 2376 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
CXCL2P19875 NDUFAF7-201ENST00000002125 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
CXCL2P19875 MDM1-205ENST00000430606 2170 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
CXCL2P19875 AL117190.1-201ENST00000637474 1985 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
CXCL2P19875 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
CXCL2P19875 POM121-201ENST00000358357 5320 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
CXCL2P19875 ACVR1C-204ENST00000409680 1786 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
CXCL2P19875 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
CXCL2P19875 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
CXCL2P19875 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
CXCL2P19875 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
CXCL2P19875 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
CXCL2P19875 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
CXCL2P19875 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
CXCL2P19875 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
CXCL2P19875 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
CXCL2P19875 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
CXCL2P19875 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
CXCL2P19875 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC12.11□□□□□ -0.47
CXCL2P19875 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
CXCL2P19875 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC12.11□□□□□ -0.47
CXCL2P19875 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.11□□□□□ -0.47
CXCL2P19875 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
CXCL2P19875 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.11□□□□□ -0.47
CXCL2P19875 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC12.11□□□□□ -0.47
CXCL2P19875 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC12.11□□□□□ -0.47
CXCL2P19875 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC12.11□□□□□ -0.47
CXCL2P19875 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
CXCL2P19875 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC12.11□□□□□ -0.47
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CXCL2P19875 ST5-256ENST00000534127 4545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
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CXCL2P19875 NXPH3-202ENST00000513748 1530 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
CXCL2P19875 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
CXCL2P19875 KIRREL1-204ENST00000368173 7519 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
CXCL2P19875 KCNMA1-216ENST00000457953 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
CXCL2P19875 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
CXCL2P19875 TNS2-203ENST00000379902 4737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
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CXCL2P19875 LOXHD1-203ENST00000398686 1958 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
CXCL2P19875 ADPRHL1-204ENST00000612156 9759 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
CXCL2P19875 TOX2-203ENST00000372999 2519 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
CXCL2P19875 NXPE3-201ENST00000273347 3941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
CXCL2P19875 AAMP-202ENST00000420660 1761 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
CXCL2P19875 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
CXCL2P19875 TTC39B-201ENST00000297615 3053 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
CXCL2P19875 PCID2-205ENST00000375477 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
CXCL2P19875 PRKAB1-205ENST00000540121 1673 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
CXCL2P19875 PRPF8-205ENST00000572621 7445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
CXCL2P19875 LINC01749-202ENST00000607802 3408 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
CXCL2P19875 GFRA2-202ENST00000517328 2104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
CXCL2P19875 TMPRSS2-201ENST00000332149 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
CXCL2P19875 EDC3-201ENST00000315127 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
CXCL2P19875 SFI1-229ENST00000540643 4226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
CXCL2P19875 RTN4-202ENST00000337526 4790 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
CXCL2P19875 DDX49-214ENST00000629999 1912 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
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