Protein–RNA interactions for Protein: P0C875

FAM228B, Protein FAM228B, humanhuman

Predictions only

Length 321 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM228BP0C875 RTEL1-203ENST00000360203 4623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FAM228BP0C875 CASP8-202ENST00000264275 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FAM228BP0C875 HNRNPH1-203ENST00000393432 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FAM228BP0C875 CDK3-201ENST00000425876 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FAM228BP0C875 CDK3-202ENST00000448471 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FAM228BP0C875 AC015909.5-201ENST00000624336 2266 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
FAM228BP0C875 FARP2-201ENST00000264042 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FAM228BP0C875 AC010247.2-201ENST00000559786 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FAM228BP0C875 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FAM228BP0C875 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FAM228BP0C875 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FAM228BP0C875 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FAM228BP0C875 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FAM228BP0C875 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FAM228BP0C875 GLIS3-AS1-201ENST00000451340 734 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FAM228BP0C875 RASA3-IT1-201ENST00000454005 380 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FAM228BP0C875 SNHG14-209ENST00000456576 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FAM228BP0C875 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FAM228BP0C875 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FAM228BP0C875 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FAM228BP0C875 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FAM228BP0C875 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FAM228BP0C875 AC104506.1-201ENST00000609247 429 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
FAM228BP0C875 AP000229.1-202ENST00000609365 559 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FAM228BP0C875 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FAM228BP0C875 AC002472.3-201ENST00000640124 621 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
FAM228BP0C875 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FAM228BP0C875 DIS3L2-205ENST00000409401 2048 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FAM228BP0C875 AL365209.1-201ENST00000624418 6473 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
FAM228BP0C875 TSPEAR-AS2-202ENST00000354333 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FAM228BP0C875 C2orf68-201ENST00000306336 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FAM228BP0C875 MTA3-203ENST00000406652 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FAM228BP0C875 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FAM228BP0C875 TCL1A-203ENST00000554012 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FAM228BP0C875 LINC02486-201ENST00000604157 3000 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
FAM228BP0C875 ACOT7-203ENST00000377845 1432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FAM228BP0C875 FAM153A-220ENST00000513554 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FAM228BP0C875 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FAM228BP0C875 CLPB-209ENST00000538039 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FAM228BP0C875 DDX17-202ENST00000396821 4791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FAM228BP0C875 AC082651.4-201ENST00000483023 1852 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FAM228BP0C875 EPN2-210ENST00000571254 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FAM228BP0C875 ITGB3-201ENST00000559488 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FAM228BP0C875 ADAM33-207ENST00000619289 3195 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FAM228BP0C875 RAPGEF3-218ENST00000548919 2776 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
FAM228BP0C875 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
FAM228BP0C875 ZCCHC7-209ENST00000534928 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
FAM228BP0C875 COL4A2-AS2-201ENST00000458403 1522 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
FAM228BP0C875 ZFP2-201ENST00000361362 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
FAM228BP0C875 RAB43-202ENST00000393304 4230 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.09
FAM228BP0C875 PPM1F-201ENST00000263212 5143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
FAM228BP0C875 C7orf72-201ENST00000297001 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
FAM228BP0C875 PSIP1-204ENST00000380738 3364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
FAM228BP0C875 SLC37A4-216ENST00000538950 2032 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
FAM228BP0C875 AC067750.1-201ENST00000608826 6545 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
FAM228BP0C875 CAMK2D-205ENST00000394524 5294 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
FAM228BP0C875 LRRC8D-201ENST00000337338 3950 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
FAM228BP0C875 AFAP1-203ENST00000382543 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
FAM228BP0C875 KIFC3-202ENST00000421376 3128 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
FAM228BP0C875 SRP54-202ENST00000546080 2187 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
FAM228BP0C875 LETMD1-235ENST00000552739 1713 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
FAM228BP0C875 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
FAM228BP0C875 GRIN2C-201ENST00000293190 4261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
FAM228BP0C875 SEMA4B-201ENST00000332496 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
FAM228BP0C875 AP1G2-201ENST00000308724 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
FAM228BP0C875 HADH-202ENST00000403312 1752 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
FAM228BP0C875 PPM1M-203ENST00000409502 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
FAM228BP0C875 ATE1-202ENST00000369040 4803 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
FAM228BP0C875 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
FAM228BP0C875 SNRPC-202ENST00000374017 1054 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
FAM228BP0C875 IFITM1-204ENST00000528780 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
FAM228BP0C875 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
FAM228BP0C875 HSP90AA1-201ENST00000216281 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
FAM228BP0C875 RPRD1A-202ENST00000399022 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
FAM228BP0C875 MED12L-202ENST00000309237 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
FAM228BP0C875 KCNAB2-219ENST00000602612 2396 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
FAM228BP0C875 PPT1-213ENST00000641319 2388 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
FAM228BP0C875 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
FAM228BP0C875 SLC20A2-208ENST00000520262 2992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
FAM228BP0C875 TRIM45-201ENST00000256649 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
FAM228BP0C875 NBPF26-208ENST00000620612 4602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
FAM228BP0C875 DUS2-201ENST00000358896 1933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
FAM228BP0C875 FXR1-214ENST00000480918 1996 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
FAM228BP0C875 AC009093.10-201ENST00000641956 1442 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
FAM228BP0C875 TRPV4-202ENST00000418703 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
FAM228BP0C875 SP6-202ENST00000536300 3848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
FAM228BP0C875 CYP1B1-205ENST00000610745 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
FAM228BP0C875 FBXO34-201ENST00000313833 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
FAM228BP0C875 CCNJ-201ENST00000265992 4115 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
FAM228BP0C875 CRHR2-202ENST00000348438 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FAM228BP0C875 SLC13A5-202ENST00000381074 1738 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FAM228BP0C875 FXYD6-207ENST00000527717 1799 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FAM228BP0C875 STARD8-202ENST00000374597 4820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FAM228BP0C875 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FAM228BP0C875 AP000552.1-203ENST00000416615 1930 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FAM228BP0C875 PRSS16-203ENST00000421826 1949 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FAM228BP0C875 CENPBD1-201ENST00000314994 2744 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FAM228BP0C875 DIRAS3-201ENST00000370981 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FAM228BP0C875 PML-203ENST00000354026 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FAM228BP0C875 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.9 ms