Protein–RNA interactions for Protein: P08F94

PKHD1, Fibrocystin, humanhuman

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Length 4,074 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKHD1P08F94 GRAPL-204ENST00000577213 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9□□□□□ -0.97
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PKHD1P08F94 ZNF571-AS1-204ENST00000587121 822 ntTSL 3 BASIC9□□□□□ -0.97
PKHD1P08F94 MTUS1-229ENST00000634613 1193 ntTSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
PKHD1P08F94 HMOX2-201ENST00000219700 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
PKHD1P08F94 AC015688.4-201ENST00000580780 1647 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
PKHD1P08F94 AL117190.1-201ENST00000637474 1985 ntTSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
PKHD1P08F94 SEPT10-208ENST00000437928 1782 ntTSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
PKHD1P08F94 LCMT1-203ENST00000399069 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
PKHD1P08F94 ADK-205ENST00000539909 1866 ntTSL 2 BASIC8.99□□□□□ -0.97
PKHD1P08F94 GPM6B-202ENST00000355135 1673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
PKHD1P08F94 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
PKHD1P08F94 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.99□□□□□ -0.97
PKHD1P08F94 ATP6V1C1-205ENST00000521514 1484 ntTSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
PKHD1P08F94 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
PKHD1P08F94 ABCD1P4-201ENST00000399687 604 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
PKHD1P08F94 IGFL1-201ENST00000437936 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
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PKHD1P08F94 PMFBP1-208ENST00000537792 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.99□□□□□ -0.97
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PKHD1P08F94 ORMDL2-205ENST00000552672 760 ntTSL 2 BASIC8.99□□□□□ -0.97
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PKHD1P08F94 AC026470.4-201ENST00000565812 308 ntTSL 3 BASIC8.99□□□□□ -0.97
PKHD1P08F94 KRTAP10-4-202ENST00000616689 597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
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PKHD1P08F94 AL445363.1-201ENST00000623749 952 ntTSL 2 BASIC8.99□□□□□ -0.97
PKHD1P08F94 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
PKHD1P08F94 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
PKHD1P08F94 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
PKHD1P08F94 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
PKHD1P08F94 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
PKHD1P08F94 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.99□□□□□ -0.97
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PKHD1P08F94 VKORC1-203ENST00000354895 901 ntTSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
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PKHD1P08F94 MUC1-208ENST00000368393 937 ntTSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
PKHD1P08F94 C6orf48-202ENST00000375635 610 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.99□□□□□ -0.97
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PKHD1P08F94 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
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PKHD1P08F94 CEP76-201ENST00000262127 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
PKHD1P08F94 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
PKHD1P08F94 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
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PKHD1P08F94 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
PKHD1P08F94 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
PKHD1P08F94 FAM133B-204ENST00000445716 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
PKHD1P08F94 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.98□□□□□ -0.97
PKHD1P08F94 SEC61B-201ENST00000223641 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
PKHD1P08F94 FTHL17-201ENST00000359202 813 ntAPPRIS P1 BASIC8.98□□□□□ -0.97
PKHD1P08F94 AL359182.1-201ENST00000435915 469 ntTSL 3 BASIC8.98□□□□□ -0.97
PKHD1P08F94 NALT1-202ENST00000450304 437 ntTSL 3 BASIC8.98□□□□□ -0.97
PKHD1P08F94 PSME2P2-201ENST00000453033 700 ntBASIC8.98□□□□□ -0.97
PKHD1P08F94 GIMAP6-202ENST00000493969 876 ntTSL 2 BASIC8.98□□□□□ -0.97
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