Protein–RNA interactions for Protein: P02649

APOE, Apolipoprotein E, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOEP02649 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
APOEP02649 AC015712.6-201ENST00000431060 5068 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
APOEP02649 BBS2-201ENST00000245157 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
APOEP02649 PIDD1-201ENST00000347755 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
APOEP02649 IGHA2-202ENST00000497872 1320 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
APOEP02649 CCNB1-201ENST00000256442 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
APOEP02649 CYTH3-201ENST00000350796 4505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
APOEP02649 CYTH3-202ENST00000396741 4508 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
APOEP02649 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
APOEP02649 GPR83-201ENST00000243673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
APOEP02649 OSCP1-204ENST00000433045 1381 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
APOEP02649 RPGRIP1-210ENST00000556336 2955 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
APOEP02649 C20orf203-202ENST00000608990 5076 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
APOEP02649 BIRC2-214ENST00000621637 3331 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
APOEP02649 POLR2E-213ENST00000615234 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
APOEP02649 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
APOEP02649 CDCA2-201ENST00000330560 3731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
APOEP02649 VPS36-207ENST00000611132 4607 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
APOEP02649 LINC01230-201ENST00000625222 3017 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
APOEP02649 STYXL1-201ENST00000248600 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
APOEP02649 CCP110-203ENST00000396212 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
APOEP02649 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
APOEP02649 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
APOEP02649 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
APOEP02649 ENO2-211ENST00000541477 2549 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
APOEP02649 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
APOEP02649 MRPL34-201ENST00000252602 968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
APOEP02649 RDH5-201ENST00000257895 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
APOEP02649 KLK8-204ENST00000391806 1051 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
APOEP02649 MIR1908-201ENST00000410394 80 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
APOEP02649 LINC01840-201ENST00000421870 571 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
APOEP02649 ALG1L2-201ENST00000425059 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
APOEP02649 AL451065.1-201ENST00000428958 238 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
APOEP02649 Z94721.1-201ENST00000444102 385 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
APOEP02649 HSPB1P2-201ENST00000448722 546 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
APOEP02649 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
APOEP02649 AC006487.1-201ENST00000514506 1221 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
APOEP02649 TPD52L1-208ENST00000528193 789 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
APOEP02649 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
APOEP02649 RDH5-204ENST00000548082 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
APOEP02649 AC008537.4-201ENST00000595728 1103 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
APOEP02649 KLK3-211ENST00000597483 810 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
APOEP02649 AC114737.3-201ENST00000636708 570 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
APOEP02649 ATE1-203ENST00000369043 4900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
APOEP02649 ELK4-202ENST00000357992 10239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
APOEP02649 PPRC1-203ENST00000413464 4580 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
APOEP02649 INHBA-205ENST00000638023 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
APOEP02649 CEP131-203ENST00000450824 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
APOEP02649 ZNF84-215ENST00000543758 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
APOEP02649 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
APOEP02649 LINC01184-204ENST00000501702 2977 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
APOEP02649 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
APOEP02649 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
APOEP02649 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
APOEP02649 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
APOEP02649 COL4A3-202ENST00000396578 8097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
APOEP02649 SAFB-201ENST00000292123 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
APOEP02649 CTBP1-AS2-206ENST00000581398 5652 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
APOEP02649 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
APOEP02649 ZEB2-225ENST00000558170 4012 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
APOEP02649 DPY19L2P2-201ENST00000312132 4078 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
APOEP02649 RCSD1-202ENST00000367854 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
APOEP02649 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
APOEP02649 B3GAT2-201ENST00000230053 6565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
APOEP02649 PPIL6-202ENST00000424445 4031 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
APOEP02649 TRAF3-202ENST00000351691 2239 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
APOEP02649 HTR3A-206ENST00000506841 2221 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
APOEP02649 ATP2A3-202ENST00000352011 3274 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
APOEP02649 LINC00174-204ENST00000421767 4702 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
APOEP02649 RNF123-202ENST00000432042 2670 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
APOEP02649 JARID2-202ENST00000397311 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
APOEP02649 ACSF2-202ENST00000427954 2251 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
APOEP02649 UBA6-202ENST00000420827 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
APOEP02649 ZNF576-203ENST00000525771 2327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
APOEP02649 GCLC-201ENST00000229416 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
APOEP02649 NEU2-201ENST00000233840 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
APOEP02649 EMC4-201ENST00000249209 852 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
APOEP02649 RPS3-201ENST00000278572 907 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
APOEP02649 TRMT112-201ENST00000308774 561 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
APOEP02649 RBM38-204ENST00000371219 760 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
APOEP02649 TREM2-203ENST00000373122 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
APOEP02649 HIST1H2AH-201ENST00000377459 387 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
APOEP02649 THAP4-202ENST00000402136 785 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
APOEP02649 AC010141.1-201ENST00000411585 623 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
APOEP02649 RBM24-203ENST00000425446 1034 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
APOEP02649 RPL35A-205ENST00000448864 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
APOEP02649 AC004471.1-201ENST00000456035 582 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
APOEP02649 ATP6V0CP2-201ENST00000469409 207 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
APOEP02649 STARD4-205ENST00000505803 803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
APOEP02649 STARD4-207ENST00000509887 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
APOEP02649 PLXNB3-209ENST00000538966 6377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
APOEP02649 CD63-214ENST00000552692 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
APOEP02649 AC025154.1-201ENST00000552806 560 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
APOEP02649 NIP7-208ENST00000569637 1099 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
APOEP02649 AC008403.1-201ENST00000595676 443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
APOEP02649 CR381653.1-201ENST00000622961 812 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
APOEP02649 PRRC2B-210ENST00000638390 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
APOEP02649 GPANK1-205ENST00000375906 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
APOEP02649 ACIN1-203ENST00000357481 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
APOEP02649 IL21R-AS1-201ENST00000563191 2615 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52 ms