Protein–RNA interactions for Protein: O43731

KDELR3, ER lumen protein-retaining receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDELR3O43731 AC090386.2-201ENST00000623010 1039 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
KDELR3O43731 AC100757.4-201ENST00000626934 759 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
KDELR3O43731 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
KDELR3O43731 SGCE-202ENST00000415788 1871 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
KDELR3O43731 FAM149A-203ENST00000389354 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
KDELR3O43731 TRIM45-202ENST00000369461 2415 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
KDELR3O43731 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
KDELR3O43731 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
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KDELR3O43731 DOK1-202ENST00000340004 1722 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
KDELR3O43731 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
KDELR3O43731 TINF2-215ENST00000626689 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
KDELR3O43731 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
KDELR3O43731 DDX50-206ENST00000610822 2510 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
KDELR3O43731 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
KDELR3O43731 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
KDELR3O43731 LINC00905-203ENST00000588838 1414 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
KDELR3O43731 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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KDELR3O43731 AC012617.1-204ENST00000586340 2305 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
KDELR3O43731 ANXA9-201ENST00000368947 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
KDELR3O43731 PAK1IP1-201ENST00000379568 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
KDELR3O43731 FAM76A-203ENST00000373949 2273 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
KDELR3O43731 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
KDELR3O43731 ELL-201ENST00000262809 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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KDELR3O43731 NRM-202ENST00000376420 1228 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
KDELR3O43731 C1orf159-201ENST00000379319 1097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
KDELR3O43731 SMARCE1-204ENST00000400122 1263 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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KDELR3O43731 AC005920.3-202ENST00000512717 789 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
KDELR3O43731 CPLX2-209ENST00000515094 576 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.76□□□□□ -0.05
KDELR3O43731 AKIP1-210ENST00000534147 1022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
KDELR3O43731 AC117500.3-201ENST00000537032 666 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
KDELR3O43731 AL135838.1-202ENST00000556411 441 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
KDELR3O43731 ANP32A-210ENST00000560303 724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
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KDELR3O43731 SMARCE1-216ENST00000580419 1228 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
KDELR3O43731 AP005264.1-201ENST00000586226 733 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
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KDELR3O43731 C20orf141-202ENST00000603872 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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KDELR3O43731 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
KDELR3O43731 ZNF239-203ENST00000426961 2027 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
KDELR3O43731 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
KDELR3O43731 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
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KDELR3O43731 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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KDELR3O43731 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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KDELR3O43731 AGAP9-201ENST00000452145 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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KDELR3O43731 FAM45A-201ENST00000361432 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
KDELR3O43731 SSR4-203ENST00000370086 643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
KDELR3O43731 TMEM52-203ENST00000378602 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
KDELR3O43731 CRYBA2-202ENST00000392096 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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KDELR3O43731 LINC00163-201ENST00000434081 2155 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
KDELR3O43731 CDCA2-201ENST00000330560 3731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
KDELR3O43731 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
KDELR3O43731 KCNJ11-204ENST00000528731 2146 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
KDELR3O43731 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
KDELR3O43731 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
KDELR3O43731 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
KDELR3O43731 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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KDELR3O43731 AC020910.6-201ENST00000623084 1459 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
KDELR3O43731 SIPA1-203ENST00000527525 3235 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
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