Protein–RNA interactions for Protein: O43541

SMAD6, Mothers against decapentaplegic homolog 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 496 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD6O43541 LRRC34-208ENST00000522830 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SMAD6O43541 SNRPN-203ENST00000400097 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SMAD6O43541 LINC01165-201ENST00000445190 1623 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
SMAD6O43541 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SMAD6O43541 CBX6-201ENST00000216083 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SMAD6O43541 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SMAD6O43541 LINC00665-205ENST00000585356 1557 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SMAD6O43541 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SMAD6O43541 AC015802.1-201ENST00000588104 1449 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
SMAD6O43541 ZNF174-201ENST00000268655 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SMAD6O43541 FCRLB-201ENST00000336830 1193 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SMAD6O43541 APRT-201ENST00000378364 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SMAD6O43541 TEX33-202ENST00000402860 986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SMAD6O43541 AC073150.1-201ENST00000450406 1084 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
SMAD6O43541 AL161670.2-201ENST00000557650 1227 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
SMAD6O43541 LINC02205-201ENST00000559752 239 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SMAD6O43541 AP007216.2-201ENST00000562094 299 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SMAD6O43541 CCDC144NL-AS1-209ENST00000577860 884 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SMAD6O43541 AL606495.2-201ENST00000605867 535 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
SMAD6O43541 MIR6074-201ENST00000612054 107 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
SMAD6O43541 PLEKHB2-211ENST00000628582 1297 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SMAD6O43541 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SMAD6O43541 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SMAD6O43541 STK26-204ENST00000481105 1835 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SMAD6O43541 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SMAD6O43541 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SMAD6O43541 ABI2-215ENST00000430418 1676 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SMAD6O43541 SPERT-204ENST00000610924 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SMAD6O43541 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SMAD6O43541 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
SMAD6O43541 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SMAD6O43541 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SMAD6O43541 CKMT1B-201ENST00000300283 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SMAD6O43541 CKMT1A-204ENST00000434505 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SMAD6O43541 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SMAD6O43541 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SMAD6O43541 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SMAD6O43541 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SMAD6O43541 GTF3C2-214ENST00000622534 1858 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SMAD6O43541 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SMAD6O43541 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SMAD6O43541 HIF3A-206ENST00000472815 1709 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SMAD6O43541 UBA1-201ENST00000335972 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SMAD6O43541 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SMAD6O43541 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SMAD6O43541 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SMAD6O43541 ABCB7-202ENST00000339447 2234 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SMAD6O43541 AL031280.1-201ENST00000436991 2224 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SMAD6O43541 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SMAD6O43541 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SMAD6O43541 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SMAD6O43541 CLK4-201ENST00000316308 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SMAD6O43541 ODF2L-204ENST00000370566 2155 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SMAD6O43541 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SMAD6O43541 AL138767.1-201ENST00000354527 744 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SMAD6O43541 AC239868.1-201ENST00000369385 493 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
SMAD6O43541 FAM177A1-202ENST00000382406 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SMAD6O43541 KNCN-202ENST00000396314 608 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SMAD6O43541 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SMAD6O43541 APOL3-207ENST00000424878 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SMAD6O43541 FOXP4-AS1-203ENST00000439386 404 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SMAD6O43541 AL160290.2-202ENST00000448671 574 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SMAD6O43541 GATD1-205ENST00000524550 995 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SMAD6O43541 NDUFC2-204ENST00000528164 561 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SMAD6O43541 AC010754.1-201ENST00000582300 1061 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SMAD6O43541 ACP7-202ENST00000594229 1149 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SMAD6O43541 LINC01233-203ENST00000601708 494 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SMAD6O43541 HIST2H2BB-202ENST00000609585 563 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SMAD6O43541 MEG3_2.1-201ENST00000611456 105 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
SMAD6O43541 LINC01517-203ENST00000616194 908 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SMAD6O43541 CU633904.3-201ENST00000624042 1029 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
SMAD6O43541 PPA1-206ENST00000625364 644 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SMAD6O43541 BSDC1-205ENST00000446293 1505 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SMAD6O43541 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SMAD6O43541 RASGEF1B-202ENST00000335927 1756 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SMAD6O43541 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SMAD6O43541 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SMAD6O43541 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SMAD6O43541 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SMAD6O43541 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SMAD6O43541 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SMAD6O43541 ADK-205ENST00000539909 1866 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SMAD6O43541 PCBP2-215ENST00000549863 1619 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SMAD6O43541 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SMAD6O43541 GNPNAT1-203ENST00000554230 2238 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SMAD6O43541 PPT1-205ENST00000449045 1957 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SMAD6O43541 C8orf49-201ENST00000525043 1968 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
SMAD6O43541 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SMAD6O43541 SUOX-202ENST00000356124 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SMAD6O43541 ZBED1-202ENST00000381222 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SMAD6O43541 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SMAD6O43541 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SMAD6O43541 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SMAD6O43541 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
SMAD6O43541 AP002353.1-201ENST00000528257 1599 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
SMAD6O43541 PML-208ENST00000436891 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SMAD6O43541 CDKL3-206ENST00000521118 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SMAD6O43541 IMPDH1-201ENST00000338791 2881 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SMAD6O43541 IMPDH1-217ENST00000626419 2862 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SMAD6O43541 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.7 ms