Protein–RNA interactions for Protein: O43365

HOXA3, Homeobox protein Hox-A3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 443 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA3O43365 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
HOXA3O43365 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
HOXA3O43365 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
HOXA3O43365 MTMR6-201ENST00000381801 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
HOXA3O43365 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
HOXA3O43365 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
HOXA3O43365 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
HOXA3O43365 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
HOXA3O43365 CCDC51-201ENST00000395694 1560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
HOXA3O43365 NRXN1-222ENST00000625672 8113 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
HOXA3O43365 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
HOXA3O43365 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
HOXA3O43365 SEZ6-201ENST00000317338 4471 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
HOXA3O43365 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
HOXA3O43365 PCM1-202ENST00000327578 8287 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
HOXA3O43365 SRC-202ENST00000373558 4304 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
HOXA3O43365 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
HOXA3O43365 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
HOXA3O43365 SLC12A5-211ENST00000616933 6166 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
HOXA3O43365 C6orf52-201ENST00000259983 619 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
HOXA3O43365 ALKBH2-201ENST00000343075 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
HOXA3O43365 DPCD-202ENST00000370151 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
HOXA3O43365 MIR33B-201ENST00000385104 96 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
HOXA3O43365 AC245369.1-201ENST00000390634 434 ntAPPRIS P1 BASIC11.8□□□□□ -0.52
HOXA3O43365 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
HOXA3O43365 TEX33-202ENST00000402860 986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
HOXA3O43365 PARVG-202ENST00000415224 999 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
HOXA3O43365 AL391832.2-201ENST00000418557 889 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
HOXA3O43365 AC131097.3-203ENST00000420272 1193 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
HOXA3O43365 AC078875.1-201ENST00000431907 724 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
HOXA3O43365 AL157407.1-201ENST00000435784 904 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
HOXA3O43365 AP000356.1-201ENST00000438893 364 ntTSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.52
HOXA3O43365 AC073150.1-201ENST00000450406 1084 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
HOXA3O43365 WSPAR-201ENST00000513561 683 ntTSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.52
HOXA3O43365 CCNC-217ENST00000523985 958 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
HOXA3O43365 EEF1D-218ENST00000526838 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
HOXA3O43365 IFITM1-204ENST00000528780 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.52
HOXA3O43365 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
HOXA3O43365 SNHG14-213ENST00000551077 638 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
HOXA3O43365 C14orf132-202ENST00000553782 536 ntTSL 4 BASIC11.8□□□□□ -0.52
HOXA3O43365 SLIRP-210ENST00000557431 725 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
HOXA3O43365 MIR4722-201ENST00000578292 60 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
HOXA3O43365 CROCCP3-204ENST00000590118 574 ntTSL 4 BASIC11.8□□□□□ -0.52
HOXA3O43365 FAAP24-204ENST00000590179 784 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
HOXA3O43365 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
HOXA3O43365 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
HOXA3O43365 TP53I11-201ENST00000308212 3683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
HOXA3O43365 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
HOXA3O43365 TRIM13-202ENST00000378182 7249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
HOXA3O43365 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
HOXA3O43365 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
HOXA3O43365 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
HOXA3O43365 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
HOXA3O43365 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
HOXA3O43365 SPERT-204ENST00000610924 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
HOXA3O43365 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
HOXA3O43365 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
HOXA3O43365 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC11.8□□□□□ -0.52
HOXA3O43365 GAK-201ENST00000314167 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
HOXA3O43365 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
HOXA3O43365 SPIN3-204ENST00000638257 4835 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
HOXA3O43365 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
HOXA3O43365 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
HOXA3O43365 SYMPK-213ENST00000599460 5449 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
HOXA3O43365 MBD1-212ENST00000585672 2532 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
HOXA3O43365 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
HOXA3O43365 GABRG3-208ENST00000615808 10768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
HOXA3O43365 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
HOXA3O43365 WASHC2A-202ENST00000314664 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
HOXA3O43365 AL022326.1-201ENST00000434516 1778 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
HOXA3O43365 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
HOXA3O43365 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
HOXA3O43365 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
HOXA3O43365 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
HOXA3O43365 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
HOXA3O43365 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
HOXA3O43365 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
HOXA3O43365 NELFE-201ENST00000375425 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
HOXA3O43365 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
HOXA3O43365 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
HOXA3O43365 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
HOXA3O43365 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
HOXA3O43365 SLC8B1-202ENST00000546737 1656 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
HOXA3O43365 AC144522.1-201ENST00000625111 1658 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
HOXA3O43365 KRT8P21-201ENST00000430398 1491 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
HOXA3O43365 PRICKLE1-201ENST00000345127 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
HOXA3O43365 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
HOXA3O43365 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
HOXA3O43365 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
HOXA3O43365 KCP-206ENST00000613019 4853 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
HOXA3O43365 TMEM256-201ENST00000302422 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
HOXA3O43365 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
HOXA3O43365 AC239868.1-201ENST00000369385 493 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
HOXA3O43365 ESD-202ENST00000378720 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
HOXA3O43365 ANKDD1A-203ENST00000395723 1250 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
HOXA3O43365 MPV17-204ENST00000399052 749 ntTSL 4 BASIC11.79□□□□□ -0.52
HOXA3O43365 AC073316.1-202ENST00000402115 988 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
HOXA3O43365 DMAC2-203ENST00000417807 1065 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
HOXA3O43365 BX284668.5-201ENST00000422124 406 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
HOXA3O43365 AP1B1P1-201ENST00000432373 827 ntTSL 3 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms