Protein–RNA interactions for Protein: O00559

EBAG9, Receptor-binding cancer antigen expressed on SiSo cells, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EBAG9O00559 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
EBAG9O00559 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
EBAG9O00559 AC004623.1-201ENST00000624592 2127 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
EBAG9O00559 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
EBAG9O00559 TLL2-201ENST00000357947 6756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
EBAG9O00559 LENG8-201ENST00000326764 3991 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
EBAG9O00559 DAO-201ENST00000228476 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
EBAG9O00559 RPA2-203ENST00000373912 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
EBAG9O00559 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
EBAG9O00559 COPS7B-201ENST00000350033 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
EBAG9O00559 BUB1B-PAK6-201ENST00000441369 2767 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
EBAG9O00559 KLC2-206ENST00000417856 3015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
EBAG9O00559 ENOX2-204ENST00000394363 4174 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
EBAG9O00559 DNM1-213ENST00000628346 3835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
EBAG9O00559 TBC1D3P2-203ENST00000581291 2088 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
EBAG9O00559 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
EBAG9O00559 NOS3-201ENST00000297494 4388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
EBAG9O00559 ZBTB11-201ENST00000312938 6020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
EBAG9O00559 ARHGAP35-206ENST00000614079 7696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
EBAG9O00559 ALPL-206ENST00000539907 2241 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
EBAG9O00559 PPP1R11-205ENST00000376772 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
EBAG9O00559 HLA-E-201ENST00000376630 2601 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
EBAG9O00559 CMIP-208ENST00000566462 3512 ntTSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
EBAG9O00559 LOXL4-201ENST00000260702 3653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
EBAG9O00559 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
EBAG9O00559 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
EBAG9O00559 ENDOV-203ENST00000517795 2548 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
EBAG9O00559 VENTX-201ENST00000325980 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
EBAG9O00559 TMPRSS4-211ENST00000522307 1634 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
EBAG9O00559 FNIP1-205ENST00000615660 6589 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
EBAG9O00559 SEMA4D-212ENST00000450295 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
EBAG9O00559 PDE4DIP-227ENST00000529945 8824 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
EBAG9O00559 POU2F2-204ENST00000526816 3218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
EBAG9O00559 PLAT-203ENST00000429089 2599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
EBAG9O00559 NCOR2-204ENST00000405201 8533 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
EBAG9O00559 FGFR1-207ENST00000397103 2953 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
EBAG9O00559 LINC00339-208ENST00000634934 1518 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
EBAG9O00559 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
EBAG9O00559 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
EBAG9O00559 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
EBAG9O00559 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
EBAG9O00559 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
EBAG9O00559 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
EBAG9O00559 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
EBAG9O00559 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
EBAG9O00559 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
EBAG9O00559 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
EBAG9O00559 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
EBAG9O00559 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
EBAG9O00559 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
EBAG9O00559 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
EBAG9O00559 ILF3-201ENST00000250241 3035 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
EBAG9O00559 ZDHHC11-201ENST00000283441 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
EBAG9O00559 TGM2-201ENST00000361475 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
EBAG9O00559 BEND6-202ENST00000370746 2379 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
EBAG9O00559 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
EBAG9O00559 RNFT2-201ENST00000257575 3882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
EBAG9O00559 CHRND-206ENST00000543200 2918 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
EBAG9O00559 MYH16-204ENST00000452010 1599 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
EBAG9O00559 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
EBAG9O00559 CDK5RAP1-202ENST00000346416 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
EBAG9O00559 KCNJ11-201ENST00000339994 2801 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
EBAG9O00559 CACNA1G-222ENST00000510366 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
EBAG9O00559 BAIAP3-207ENST00000562208 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
EBAG9O00559 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
EBAG9O00559 LOXL3-204ENST00000409549 2897 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
EBAG9O00559 CCT6P3-201ENST00000419314 3702 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
EBAG9O00559 GREB1-206ENST00000396123 5296 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
EBAG9O00559 NT5DC4-201ENST00000327581 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
EBAG9O00559 CLN8-204ENST00000519254 1769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
EBAG9O00559 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
EBAG9O00559 PLEKHB2-206ENST00000409612 2210 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
EBAG9O00559 GUCY2D-201ENST00000254854 3698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
EBAG9O00559 FGGY-201ENST00000303721 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
EBAG9O00559 HNRNPH1-216ENST00000510411 2105 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
EBAG9O00559 PTPRN-202ENST00000409251 3622 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
EBAG9O00559 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
EBAG9O00559 GMEB2-201ENST00000266068 4559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
EBAG9O00559 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
EBAG9O00559 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
EBAG9O00559 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
EBAG9O00559 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
EBAG9O00559 FAM102A-202ENST00000373084 3352 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
EBAG9O00559 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
EBAG9O00559 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
EBAG9O00559 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
EBAG9O00559 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
EBAG9O00559 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
EBAG9O00559 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
EBAG9O00559 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
EBAG9O00559 SLC1A2-208ENST00000606205 1890 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
EBAG9O00559 AC124319.4-201ENST00000622931 2161 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
EBAG9O00559 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
EBAG9O00559 PARP10-205ENST00000525773 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
EBAG9O00559 IFT172-202ENST00000359466 2207 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
EBAG9O00559 DDX54-202ENST00000314045 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
EBAG9O00559 TNFSF8-201ENST00000223795 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
EBAG9O00559 LINC00846-201ENST00000334165 1778 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
EBAG9O00559 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
EBAG9O00559 FLT4-201ENST00000261937 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms