Protein–RNA interactions for Protein: A4FU01

MTMR11, Myotubularin-related protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 709 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTMR11A4FU01 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MTMR11A4FU01 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MTMR11A4FU01 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MTMR11A4FU01 FAM76A-203ENST00000373949 2273 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MTMR11A4FU01 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
MTMR11A4FU01 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
MTMR11A4FU01 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
MTMR11A4FU01 ATL3-203ENST00000538786 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
MTMR11A4FU01 RBM4B-206ENST00000531036 1646 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
MTMR11A4FU01 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
MTMR11A4FU01 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
MTMR11A4FU01 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
MTMR11A4FU01 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
MTMR11A4FU01 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
MTMR11A4FU01 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
MTMR11A4FU01 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
MTMR11A4FU01 UBASH3A-203ENST00000398367 1733 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
MTMR11A4FU01 HIF3A-206ENST00000472815 1709 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
MTMR11A4FU01 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
MTMR11A4FU01 GJB1-203ENST00000374029 1587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
MTMR11A4FU01 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
MTMR11A4FU01 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
MTMR11A4FU01 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
MTMR11A4FU01 MICB-201ENST00000252229 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
MTMR11A4FU01 NDUFB8-201ENST00000299166 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
MTMR11A4FU01 LAIR2-201ENST00000301202 699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
MTMR11A4FU01 ZNF226-203ENST00000413984 716 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
MTMR11A4FU01 AL807761.2-201ENST00000422849 729 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
MTMR11A4FU01 AL592076.1-201ENST00000424448 303 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
MTMR11A4FU01 RHBDD2-203ENST00000428119 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
MTMR11A4FU01 TAC3-208ENST00000441881 731 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
MTMR11A4FU01 AL606489.1-201ENST00000443515 486 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
MTMR11A4FU01 KRT8P1-201ENST00000557533 1207 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
MTMR11A4FU01 PPCDC-205ENST00000563393 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
MTMR11A4FU01 PPCDC-208ENST00000567336 892 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
MTMR11A4FU01 AC007326.1-201ENST00000604539 458 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
MTMR11A4FU01 AC073352.2-201ENST00000609385 439 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
MTMR11A4FU01 TAC3-211ENST00000615887 1120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
MTMR11A4FU01 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
MTMR11A4FU01 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
MTMR11A4FU01 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
MTMR11A4FU01 ORMDL3-202ENST00000394169 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
MTMR11A4FU01 LACTB2-201ENST00000276590 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
MTMR11A4FU01 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
MTMR11A4FU01 OR6A2-201ENST00000332601 1373 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.02
MTMR11A4FU01 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
MTMR11A4FU01 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
MTMR11A4FU01 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
MTMR11A4FU01 DIAPH2-202ENST00000355827 3782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
MTMR11A4FU01 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MTMR11A4FU01 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MTMR11A4FU01 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MTMR11A4FU01 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MTMR11A4FU01 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MTMR11A4FU01 AC064801.2-201ENST00000625052 1303 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
MTMR11A4FU01 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MTMR11A4FU01 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MTMR11A4FU01 ALDOA-209ENST00000563060 1550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MTMR11A4FU01 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MTMR11A4FU01 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MTMR11A4FU01 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MTMR11A4FU01 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MTMR11A4FU01 AC007603.1-201ENST00000563124 2085 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MTMR11A4FU01 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MTMR11A4FU01 SIPA1-203ENST00000527525 3235 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MTMR11A4FU01 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MTMR11A4FU01 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MTMR11A4FU01 CABP1-203ENST00000351200 770 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MTMR11A4FU01 AC131097.2-203ENST00000401641 507 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MTMR11A4FU01 AC060234.1-201ENST00000422966 474 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MTMR11A4FU01 LINC00642-202ENST00000442515 670 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MTMR11A4FU01 UBXN7-AS1-201ENST00000442941 386 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MTMR11A4FU01 MYL7-209ENST00000458240 791 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MTMR11A4FU01 TPT1P11-201ENST00000458482 498 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
MTMR11A4FU01 RN7SL181P-201ENST00000462921 277 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
MTMR11A4FU01 HOXB-AS3-206ENST00000474040 741 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MTMR11A4FU01 LINC00461-207ENST00000506978 564 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MTMR11A4FU01 CD164-210ENST00000512821 964 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MTMR11A4FU01 SMIM23-202ENST00000523047 573 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MTMR11A4FU01 TALDO1-203ENST00000528097 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MTMR11A4FU01 FOS-204ENST00000554617 796 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MTMR11A4FU01 MIR3147-201ENST00000577811 66 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
MTMR11A4FU01 WDR7-208ENST00000589935 544 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MTMR11A4FU01 AC005632.3-201ENST00000605544 308 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
MTMR11A4FU01 AC104506.1-201ENST00000609247 429 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
MTMR11A4FU01 NR2F2-AS1-215ENST00000620029 1223 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MTMR11A4FU01 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MTMR11A4FU01 CD59-201ENST00000351554 1775 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MTMR11A4FU01 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MTMR11A4FU01 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MTMR11A4FU01 GMEB1-202ENST00000361872 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MTMR11A4FU01 PROSER3-202ENST00000396908 2149 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MTMR11A4FU01 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MTMR11A4FU01 METAP2-205ENST00000546753 1862 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MTMR11A4FU01 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MTMR11A4FU01 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MTMR11A4FU01 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MTMR11A4FU01 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MTMR11A4FU01 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MTMR11A4FU01 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms