Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6R4

MAP3K4, Mitogen-activated protein kinase kinase kinase 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,608 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP3K4Q9Y6R4 AC091132.6-201ENST00000586411 826 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MAP3K4Q9Y6R4 SNX20-205ENST00000610485 557 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MAP3K4Q9Y6R4 BARX1-AS1-201ENST00000453045 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MAP3K4Q9Y6R4 NAP1L1-226ENST00000552342 1526 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MAP3K4Q9Y6R4 RAPGEFL1-202ENST00000456989 1582 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MAP3K4Q9Y6R4 SLC20A2-207ENST00000520179 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MAP3K4Q9Y6R4 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MAP3K4Q9Y6R4 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MAP3K4Q9Y6R4 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MAP3K4Q9Y6R4 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MAP3K4Q9Y6R4 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MAP3K4Q9Y6R4 NEK3-210ENST00000620675 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MAP3K4Q9Y6R4 ELF3-202ENST00000367283 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MAP3K4Q9Y6R4 AC093797.1-201ENST00000411847 1789 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MAP3K4Q9Y6R4 LYPLA1-202ENST00000343231 1308 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MAP3K4Q9Y6R4 PMM1-201ENST00000216259 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MAP3K4Q9Y6R4 TAMM41-201ENST00000273037 1297 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MAP3K4Q9Y6R4 SUMO1-206ENST00000409368 1187 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MAP3K4Q9Y6R4 OR7E155P-201ENST00000412208 1014 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
MAP3K4Q9Y6R4 DLX6-203ENST00000555308 666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MAP3K4Q9Y6R4 MIR8071-1-201ENST00000616769 65 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
MAP3K4Q9Y6R4 MIR8071-2-201ENST00000616772 65 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
MAP3K4Q9Y6R4 AC079331.1-201ENST00000623200 1200 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
MAP3K4Q9Y6R4 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MAP3K4Q9Y6R4 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MAP3K4Q9Y6R4 MKRN2-201ENST00000170447 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MAP3K4Q9Y6R4 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MAP3K4Q9Y6R4 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MAP3K4Q9Y6R4 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MAP3K4Q9Y6R4 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MAP3K4Q9Y6R4 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MAP3K4Q9Y6R4 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MAP3K4Q9Y6R4 CYB5D2-203ENST00000575251 1588 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MAP3K4Q9Y6R4 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MAP3K4Q9Y6R4 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MAP3K4Q9Y6R4 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MAP3K4Q9Y6R4 FAM83A-AS1-202ENST00000520576 1347 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MAP3K4Q9Y6R4 CSRP2-201ENST00000311083 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MAP3K4Q9Y6R4 NPPA-202ENST00000376480 855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MAP3K4Q9Y6R4 HNRNPA3P12-201ENST00000437410 1063 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
MAP3K4Q9Y6R4 AC022784.6-202ENST00000523246 674 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MAP3K4Q9Y6R4 AC073896.3-201ENST00000546789 437 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MAP3K4Q9Y6R4 CSRP2-203ENST00000547435 632 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MAP3K4Q9Y6R4 SMIM28-201ENST00000573100 855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MAP3K4Q9Y6R4 AC116025.1-201ENST00000575404 415 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MAP3K4Q9Y6R4 NPPA-203ENST00000610706 849 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MAP3K4Q9Y6R4 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MAP3K4Q9Y6R4 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MAP3K4Q9Y6R4 CPPED1-201ENST00000261660 1898 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
MAP3K4Q9Y6R4 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.02
MAP3K4Q9Y6R4 APBB3-201ENST00000354402 1810 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
MAP3K4Q9Y6R4 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
MAP3K4Q9Y6R4 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
MAP3K4Q9Y6R4 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
MAP3K4Q9Y6R4 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
MAP3K4Q9Y6R4 PSMC5-212ENST00000581882 1474 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
MAP3K4Q9Y6R4 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MAP3K4Q9Y6R4 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MAP3K4Q9Y6R4 NBAT1-201ENST00000566912 1940 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
MAP3K4Q9Y6R4 NRG1-211ENST00000520502 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MAP3K4Q9Y6R4 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
MAP3K4Q9Y6R4 RNF181-201ENST00000306368 569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MAP3K4Q9Y6R4 PDLIM5-203ENST00000359265 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MAP3K4Q9Y6R4 FUNDC1-201ENST00000378045 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MAP3K4Q9Y6R4 WDR54-202ENST00000409791 854 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
MAP3K4Q9Y6R4 AL359182.1-201ENST00000435915 469 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
MAP3K4Q9Y6R4 RPSAP69-201ENST00000445739 546 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
MAP3K4Q9Y6R4 AC079250.1-201ENST00000456046 531 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
MAP3K4Q9Y6R4 ALDOAP1-201ENST00000491506 1078 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
MAP3K4Q9Y6R4 IQSEC2-205ENST00000498281 673 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
MAP3K4Q9Y6R4 AC090282.1-201ENST00000572821 534 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
MAP3K4Q9Y6R4 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MAP3K4Q9Y6R4 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MAP3K4Q9Y6R4 CA2-201ENST00000285379 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MAP3K4Q9Y6R4 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
MAP3K4Q9Y6R4 GNG4-201ENST00000366597 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MAP3K4Q9Y6R4 PRIMPOL-211ENST00000515774 2007 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MAP3K4Q9Y6R4 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MAP3K4Q9Y6R4 WNT8A-202ENST00000398754 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MAP3K4Q9Y6R4 NAAA-203ENST00000505594 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MAP3K4Q9Y6R4 SNAPC2-206ENST00000597584 1413 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MAP3K4Q9Y6R4 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MAP3K4Q9Y6R4 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MAP3K4Q9Y6R4 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MAP3K4Q9Y6R4 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
MAP3K4Q9Y6R4 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MAP3K4Q9Y6R4 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MAP3K4Q9Y6R4 THY1-206ENST00000528522 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MAP3K4Q9Y6R4 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MAP3K4Q9Y6R4 TFG-208ENST00000490574 1696 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MAP3K4Q9Y6R4 DUOXA1-205ENST00000558422 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MAP3K4Q9Y6R4 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MAP3K4Q9Y6R4 AC103592.1-201ENST00000394513 664 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
MAP3K4Q9Y6R4 CYCS-203ENST00000409764 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MAP3K4Q9Y6R4 C9orf135-205ENST00000527647 748 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MAP3K4Q9Y6R4 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MAP3K4Q9Y6R4 RHD-209ENST00000568195 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MAP3K4Q9Y6R4 SPAG1-205ENST00000520508 1796 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MAP3K4Q9Y6R4 GSTCD-206ENST00000507281 2091 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MAP3K4Q9Y6R4 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 126.1 ms