Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3F1

Putative TAP2-associated 6.5 kDa polypeptide, humanhuman

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Length 56 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9Y3F1 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q9Y3F1 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q9Y3F1 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q9Y3F1 OR3A2-205ENST00000641164 2033 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q9Y3F1 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q9Y3F1 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q9Y3F1 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q9Y3F1 LINC00115-201ENST00000473798 1317 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Q9Y3F1 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q9Y3F1 AMT-256ENST00000638063 1783 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q9Y3F1 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q9Y3F1 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Q9Y3F1 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q9Y3F1 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q9Y3F1 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q9Y3F1 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q9Y3F1 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q9Y3F1 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q9Y3F1 FAM149A-203ENST00000389354 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q9Y3F1 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q9Y3F1 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q9Y3F1 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q9Y3F1 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q9Y3F1 PYGM-202ENST00000377432 2611 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q9Y3F1 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q9Y3F1 PRIMPOL-211ENST00000515774 2007 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q9Y3F1 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q9Y3F1 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q9Y3F1 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q9Y3F1 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q9Y3F1 EMP1-211ENST00000544053 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q9Y3F1 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q9Y3F1 CRYGC-201ENST00000282141 629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q9Y3F1 NHP2-202ENST00000314397 599 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q9Y3F1 CUTA-203ENST00000374500 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q9Y3F1 FAM92A-202ENST00000423990 914 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q9Y3F1 KRT18P15-201ENST00000458108 1291 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Q9Y3F1 TP53AIP1-201ENST00000458238 777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q9Y3F1 AC006529.1-201ENST00000459978 637 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Q9Y3F1 LINC02063-201ENST00000503415 566 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q9Y3F1 AC026410.1-201ENST00000507366 1101 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Q9Y3F1 C8orf31-207ENST00000524181 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q9Y3F1 CMC2-204ENST00000562713 573 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q9Y3F1 CMC2-209ENST00000565108 399 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q9Y3F1 AC011444.1-201ENST00000587836 639 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q9Y3F1 ZNF677-204ENST00000594681 935 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q9Y3F1 AC005759.1-202ENST00000599416 415 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q9Y3F1 AL118522.1-201ENST00000611368 560 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Q9Y3F1 MIR6746-201ENST00000620971 63 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Q9Y3F1 AL137793.2-201ENST00000632635 659 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q9Y3F1 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q9Y3F1 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q9Y3F1 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q9Y3F1 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q9Y3F1 COX4I1-208ENST00000564903 1481 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q9Y3F1 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q9Y3F1 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q9Y3F1 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q9Y3F1 AC019109.1-201ENST00000401725 1874 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Q9Y3F1 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q9Y3F1 MSANTD2P1-201ENST00000445341 1368 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Q9Y3F1 AL513315.1-201ENST00000640756 1370 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q9Y3F1 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q9Y3F1 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Q9Y3F1 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q9Y3F1 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q9Y3F1 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q9Y3F1 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q9Y3F1 FAM163B-201ENST00000356873 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q9Y3F1 CYB561D1-203ENST00000393709 620 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q9Y3F1 ORMDL1-204ENST00000409519 1223 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q9Y3F1 FTCDNL1-203ENST00000420922 772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q9Y3F1 CXorf40A-205ENST00000423540 1208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q9Y3F1 AC004889.1-205ENST00000493248 531 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q9Y3F1 RAMP3-203ENST00000496212 543 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q9Y3F1 OR2A1-AS1-210ENST00000496968 531 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Q9Y3F1 AC093909.3-201ENST00000504783 336 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Q9Y3F1 AC108474.1-201ENST00000507776 421 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q9Y3F1 AC105390.1-201ENST00000511330 560 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q9Y3F1 DNAJB13-203ENST00000537753 912 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q9Y3F1 SOCS2-AS1-204ENST00000551626 618 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q9Y3F1 AC020636.2-201ENST00000569170 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q9Y3F1 RN7SL455P-201ENST00000580629 282 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Q9Y3F1 MIR4265-201ENST00000582152 99 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Q9Y3F1 AC091769.1-201ENST00000619576 568 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Q9Y3F1 CSAG3-203ENST00000638835 793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q9Y3F1 CSAG2-204ENST00000640702 793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q9Y3F1 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q9Y3F1 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q9Y3F1 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q9Y3F1 AC022007.1-201ENST00000383808 1897 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q9Y3F1 TSPAN3-205ENST00000558745 1340 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q9Y3F1 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q9Y3F1 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q9Y3F1 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q9Y3F1 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q9Y3F1 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q9Y3F1 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q9Y3F1 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q9Y3F1 FAM90A21P-201ENST00000510875 1396 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
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