Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJ99

CDH22, Cadherin-22, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH22Q9UJ99 RPL19-207ENST00000582193 792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDH22Q9UJ99 MIR4522-201ENST00000584932 87 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CDH22Q9UJ99 ZNF286A-219ENST00000585194 607 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDH22Q9UJ99 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDH22Q9UJ99 IRF3-225ENST00000600022 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDH22Q9UJ99 CUTA-215ENST00000611509 1199 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDH22Q9UJ99 AL161773.1-201ENST00000624845 863 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CDH22Q9UJ99 CYP4B1-215ENST00000640628 969 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDH22Q9UJ99 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDH22Q9UJ99 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDH22Q9UJ99 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDH22Q9UJ99 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDH22Q9UJ99 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDH22Q9UJ99 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDH22Q9UJ99 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDH22Q9UJ99 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDH22Q9UJ99 CNPY1-203ENST00000636372 2259 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDH22Q9UJ99 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDH22Q9UJ99 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDH22Q9UJ99 TRAF3-202ENST00000351691 2239 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDH22Q9UJ99 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDH22Q9UJ99 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDH22Q9UJ99 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDH22Q9UJ99 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDH22Q9UJ99 RASSF6-202ENST00000335049 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDH22Q9UJ99 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDH22Q9UJ99 FAM90A2P-201ENST00000511144 1395 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CDH22Q9UJ99 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDH22Q9UJ99 FAM90A25P-201ENST00000528404 1395 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CDH22Q9UJ99 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDH22Q9UJ99 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDH22Q9UJ99 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDH22Q9UJ99 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDH22Q9UJ99 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDH22Q9UJ99 SLC11A2-204ENST00000541174 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDH22Q9UJ99 CGB1-201ENST00000301407 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDH22Q9UJ99 CNR1-201ENST00000362094 1252 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDH22Q9UJ99 SOD2-202ENST00000367054 815 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDH22Q9UJ99 AL118508.1-202ENST00000411595 709 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDH22Q9UJ99 AL391119.1-201ENST00000416563 271 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDH22Q9UJ99 AC097065.1-201ENST00000425737 517 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CDH22Q9UJ99 AL008733.1-201ENST00000440516 469 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDH22Q9UJ99 CICP12-201ENST00000455801 843 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CDH22Q9UJ99 SIAH2-AS1-201ENST00000461943 441 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDH22Q9UJ99 SHBG-207ENST00000570547 801 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDH22Q9UJ99 MIR4649-201ENST00000582839 64 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CDH22Q9UJ99 MIR6756-201ENST00000616240 63 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CDH22Q9UJ99 DDX5-235ENST00000630471 473 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDH22Q9UJ99 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDH22Q9UJ99 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDH22Q9UJ99 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDH22Q9UJ99 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDH22Q9UJ99 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDH22Q9UJ99 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDH22Q9UJ99 EYA4-205ENST00000430974 2364 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDH22Q9UJ99 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDH22Q9UJ99 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDH22Q9UJ99 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDH22Q9UJ99 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDH22Q9UJ99 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDH22Q9UJ99 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDH22Q9UJ99 LINC01165-201ENST00000445190 1623 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CDH22Q9UJ99 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDH22Q9UJ99 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDH22Q9UJ99 MIR22HG-201ENST00000334146 1383 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDH22Q9UJ99 LINC00334-203ENST00000638500 1377 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDH22Q9UJ99 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDH22Q9UJ99 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDH22Q9UJ99 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDH22Q9UJ99 AL024498.2-201ENST00000480294 1589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDH22Q9UJ99 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDH22Q9UJ99 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDH22Q9UJ99 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDH22Q9UJ99 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDH22Q9UJ99 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDH22Q9UJ99 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDH22Q9UJ99 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDH22Q9UJ99 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDH22Q9UJ99 ASGR1-201ENST00000269299 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDH22Q9UJ99 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDH22Q9UJ99 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDH22Q9UJ99 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDH22Q9UJ99 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDH22Q9UJ99 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDH22Q9UJ99 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDH22Q9UJ99 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDH22Q9UJ99 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDH22Q9UJ99 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDH22Q9UJ99 TMEM208-201ENST00000304800 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDH22Q9UJ99 RASSF3-202ENST00000336061 1030 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDH22Q9UJ99 PPIE-202ENST00000356511 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDH22Q9UJ99 ASNA1-201ENST00000357332 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDH22Q9UJ99 FMR1NB-201ENST00000370467 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDH22Q9UJ99 AC012362.1-201ENST00000434906 739 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CDH22Q9UJ99 UBXN7-AS1-201ENST00000442941 386 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDH22Q9UJ99 RN7SL258P-201ENST00000478664 300 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CDH22Q9UJ99 AC006122.1-201ENST00000493323 440 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CDH22Q9UJ99 AC008723.1-201ENST00000506922 207 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CDH22Q9UJ99 TMEM231-206ENST00000565067 1078 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDH22Q9UJ99 ERVK13-1-204ENST00000566343 567 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.1 ms