Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHA4

LAMTOR3, Ragulator complex protein LAMTOR3, humanhuman

Predictions only

Length 124 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMTOR3Q9UHA4 B4GALT6-201ENST00000237019 2128 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
LAMTOR3Q9UHA4 ARHGEF9-230ENST00000637178 2145 ntTSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
LAMTOR3Q9UHA4 KIAA0368-202ENST00000338205 7078 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
LAMTOR3Q9UHA4 POLD1-214ENST00000613923 3542 ntTSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
LAMTOR3Q9UHA4 EGR2-201ENST00000242480 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
LAMTOR3Q9UHA4 NINL-203ENST00000422516 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
LAMTOR3Q9UHA4 METTL13-203ENST00000367737 2865 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
LAMTOR3Q9UHA4 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
LAMTOR3Q9UHA4 GNB5-201ENST00000261837 8906 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
LAMTOR3Q9UHA4 TMPRSS12-202ENST00000551456 3336 ntTSL 2 BASIC9.53□□□□□ -0.88
LAMTOR3Q9UHA4 TIGD1-201ENST00000408957 2625 ntAPPRIS P1 BASIC9.52□□□□□ -0.88
LAMTOR3Q9UHA4 HFE-202ENST00000317896 1922 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
LAMTOR3Q9UHA4 MANBAL-201ENST00000373605 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.88
LAMTOR3Q9UHA4 RGPD2-201ENST00000398146 6931 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
LAMTOR3Q9UHA4 PGAP2-201ENST00000278243 2062 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
LAMTOR3Q9UHA4 KCND3-203ENST00000369697 7396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
LAMTOR3Q9UHA4 AL356258.1-201ENST00000605929 2246 ntTSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.88
LAMTOR3Q9UHA4 PHF21B-201ENST00000313237 3671 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
LAMTOR3Q9UHA4 GPR176-201ENST00000299092 3844 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
LAMTOR3Q9UHA4 ZBTB42-201ENST00000342537 3800 ntAPPRIS P1 BASIC9.52□□□□□ -0.88
LAMTOR3Q9UHA4 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
LAMTOR3Q9UHA4 SLC36A4-201ENST00000326402 6012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
LAMTOR3Q9UHA4 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
LAMTOR3Q9UHA4 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.88
LAMTOR3Q9UHA4 SMOC2-202ENST00000356284 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
LAMTOR3Q9UHA4 SYNE3-201ENST00000334258 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
LAMTOR3Q9UHA4 NT5C3A-213ENST00000610140 1670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
LAMTOR3Q9UHA4 AC068075.1-201ENST00000519714 1832 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
LAMTOR3Q9UHA4 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC9.52□□□□□ -0.89
LAMTOR3Q9UHA4 EPS8L3-202ENST00000361965 1971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
LAMTOR3Q9UHA4 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.89
LAMTOR3Q9UHA4 RHOH-224ENST00000622175 2254 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC9.52□□□□□ -0.89
LAMTOR3Q9UHA4 EPN3-201ENST00000268933 4071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.89
LAMTOR3Q9UHA4 ARMC9-215ENST00000614261 4975 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
LAMTOR3Q9UHA4 PKP1-201ENST00000263946 5447 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
LAMTOR3Q9UHA4 BARD1-212ENST00000617164 5449 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
LAMTOR3Q9UHA4 CHFR-201ENST00000266880 11133 ntTSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.89
LAMTOR3Q9UHA4 SPOCD1-201ENST00000257100 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.89
LAMTOR3Q9UHA4 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
LAMTOR3Q9UHA4 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC9.52□□□□□ -0.89
LAMTOR3Q9UHA4 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
LAMTOR3Q9UHA4 ZDHHC6-202ENST00000369405 2170 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
LAMTOR3Q9UHA4 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
LAMTOR3Q9UHA4 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
LAMTOR3Q9UHA4 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.89
LAMTOR3Q9UHA4 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.89
LAMTOR3Q9UHA4 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC9.52□□□□□ -0.89
LAMTOR3Q9UHA4 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
LAMTOR3Q9UHA4 ST3GAL5-203ENST00000393805 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
LAMTOR3Q9UHA4 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
LAMTOR3Q9UHA4 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
LAMTOR3Q9UHA4 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
LAMTOR3Q9UHA4 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.89
LAMTOR3Q9UHA4 ECHDC1-220ENST00000528402 1449 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
LAMTOR3Q9UHA4 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC9.52□□□□□ -0.89
LAMTOR3Q9UHA4 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
LAMTOR3Q9UHA4 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
LAMTOR3Q9UHA4 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC9.52□□□□□ -0.89
LAMTOR3Q9UHA4 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.89
LAMTOR3Q9UHA4 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC9.52□□□□□ -0.89
LAMTOR3Q9UHA4 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
LAMTOR3Q9UHA4 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
LAMTOR3Q9UHA4 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC9.52□□□□□ -0.89
LAMTOR3Q9UHA4 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
LAMTOR3Q9UHA4 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
LAMTOR3Q9UHA4 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
LAMTOR3Q9UHA4 SON-202ENST00000356577 8813 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
LAMTOR3Q9UHA4 CARMN-210ENST00000602964 8398 ntTSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.89
LAMTOR3Q9UHA4 PTPRS-201ENST00000262963 4766 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
LAMTOR3Q9UHA4 PTPRS-210ENST00000592099 4766 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
LAMTOR3Q9UHA4 NLRX1-201ENST00000292199 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
LAMTOR3Q9UHA4 FGFRL1-201ENST00000264748 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
LAMTOR3Q9UHA4 CALCB-203ENST00000533448 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.89
LAMTOR3Q9UHA4 AC007603.1-201ENST00000563124 2085 ntTSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.89
LAMTOR3Q9UHA4 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
LAMTOR3Q9UHA4 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
LAMTOR3Q9UHA4 DRAXIN-201ENST00000294485 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
LAMTOR3Q9UHA4 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
LAMTOR3Q9UHA4 LRRC34-208ENST00000522830 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
LAMTOR3Q9UHA4 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.89
LAMTOR3Q9UHA4 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC9.52□□□□□ -0.89
LAMTOR3Q9UHA4 ACTL7A-201ENST00000333999 1494 ntAPPRIS P1 BASIC9.52□□□□□ -0.89
LAMTOR3Q9UHA4 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
LAMTOR3Q9UHA4 SEC16A-206ENST00000431893 6465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
LAMTOR3Q9UHA4 PCDH20-201ENST00000409204 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
LAMTOR3Q9UHA4 KDM6A-201ENST00000377967 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
LAMTOR3Q9UHA4 ARHGAP4-201ENST00000350060 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
LAMTOR3Q9UHA4 AP002851.1-201ENST00000640504 2130 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
LAMTOR3Q9UHA4 MEGF8-203ENST00000378073 11034 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
LAMTOR3Q9UHA4 NLRP2-204ENST00000391721 3420 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.89
LAMTOR3Q9UHA4 STX16-NPEPL1-202ENST00000530122 3433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
LAMTOR3Q9UHA4 SMG8-201ENST00000300917 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
LAMTOR3Q9UHA4 SLC9B2-202ENST00000394785 3126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
LAMTOR3Q9UHA4 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
LAMTOR3Q9UHA4 C11orf21-201ENST00000381153 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
LAMTOR3Q9UHA4 AC134312.1-201ENST00000378417 3468 ntTSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
LAMTOR3Q9UHA4 DCAF8L2-203ENST00000545306 2013 ntAPPRIS P1 BASIC9.51□□□□□ -0.89
LAMTOR3Q9UHA4 PCTP-207ENST00000576183 2680 ntTSL 3 BASIC9.51□□□□□ -0.89
LAMTOR3Q9UHA4 IGSF9-201ENST00000361509 3996 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
LAMTOR3Q9UHA4 PCDHB18P-202ENST00000526308 3197 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.4 ms