Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQS7

INCENP, Inner centromere protein, humanhuman

Predictions only

Length 918 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
INCENPQ9NQS7 INPP5E-201ENST00000371712 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
INCENPQ9NQS7 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
INCENPQ9NQS7 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
INCENPQ9NQS7 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
INCENPQ9NQS7 TRAFD1-201ENST00000257604 3178 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
INCENPQ9NQS7 KLHDC8A-202ENST00000367156 3177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
INCENPQ9NQS7 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
INCENPQ9NQS7 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
INCENPQ9NQS7 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
INCENPQ9NQS7 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
INCENPQ9NQS7 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
INCENPQ9NQS7 GABPB1-202ENST00000359031 1633 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
INCENPQ9NQS7 HTR7-202ENST00000336152 3126 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
INCENPQ9NQS7 SCFD2-201ENST00000388940 2221 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
INCENPQ9NQS7 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
INCENPQ9NQS7 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
INCENPQ9NQS7 GGACT-201ENST00000376250 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
INCENPQ9NQS7 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
INCENPQ9NQS7 ARHGAP4-203ENST00000370028 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
INCENPQ9NQS7 TJP3-202ENST00000541714 3350 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
INCENPQ9NQS7 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
INCENPQ9NQS7 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
INCENPQ9NQS7 VAMP4-202ENST00000367740 1193 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
INCENPQ9NQS7 LAMA4-209ENST00000453937 645 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
INCENPQ9NQS7 SNHG14-209ENST00000456576 544 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
INCENPQ9NQS7 TUBB8P8-201ENST00000458717 1058 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
INCENPQ9NQS7 ZNF385A-213ENST00000551771 1111 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
INCENPQ9NQS7 AC007376.2-201ENST00000556271 540 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
INCENPQ9NQS7 PSENEN-203ENST00000591949 833 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
INCENPQ9NQS7 AL023803.2-201ENST00000620080 638 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
INCENPQ9NQS7 FRZB-201ENST00000295113 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
INCENPQ9NQS7 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
INCENPQ9NQS7 ACE-201ENST00000290863 2479 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
INCENPQ9NQS7 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
INCENPQ9NQS7 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
INCENPQ9NQS7 RPUSD2-201ENST00000315616 2358 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
INCENPQ9NQS7 ALAS2-202ENST00000335854 1795 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
INCENPQ9NQS7 BBS1-202ENST00000393994 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
INCENPQ9NQS7 CHD4-201ENST00000357008 6496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
INCENPQ9NQS7 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
INCENPQ9NQS7 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
INCENPQ9NQS7 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
INCENPQ9NQS7 CCND3-201ENST00000372987 2233 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
INCENPQ9NQS7 GOSR2-203ENST00000415811 2171 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
INCENPQ9NQS7 RFTN1-203ENST00000432519 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
INCENPQ9NQS7 WSCD1-202ENST00000539421 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
INCENPQ9NQS7 SMOC2-201ENST00000354536 3150 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
INCENPQ9NQS7 SMPDL3B-201ENST00000373888 1548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
INCENPQ9NQS7 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
INCENPQ9NQS7 BBS2-201ENST00000245157 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
INCENPQ9NQS7 VDAC1-201ENST00000265333 1953 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
INCENPQ9NQS7 ZNF417-203ENST00000595559 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
INCENPQ9NQS7 MYADM-202ENST00000391768 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
INCENPQ9NQS7 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
INCENPQ9NQS7 SGCE-204ENST00000428696 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
INCENPQ9NQS7 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
INCENPQ9NQS7 C1orf228-218ENST00000458657 1818 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
INCENPQ9NQS7 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
INCENPQ9NQS7 HELZ2-204ENST00000467148 8064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
INCENPQ9NQS7 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
INCENPQ9NQS7 LRIF1-202ENST00000485275 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
INCENPQ9NQS7 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
INCENPQ9NQS7 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
INCENPQ9NQS7 TPRKB-202ENST00000318190 819 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
INCENPQ9NQS7 SDCCAG3P2-201ENST00000326105 1023 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
INCENPQ9NQS7 UNC5A-201ENST00000329542 3812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
INCENPQ9NQS7 CSH2-201ENST00000336844 1173 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
INCENPQ9NQS7 CSH2-202ENST00000345366 598 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
INCENPQ9NQS7 CSH2-203ENST00000392886 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
INCENPQ9NQS7 ATP5J-205ENST00000400094 589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
INCENPQ9NQS7 BX284668.5-201ENST00000422124 406 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
INCENPQ9NQS7 AL035414.1-201ENST00000451327 857 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
INCENPQ9NQS7 AKR7A2P1-201ENST00000460134 915 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
INCENPQ9NQS7 FAM86B1-218ENST00000534520 808 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
INCENPQ9NQS7 CSH2-206ENST00000560142 749 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
INCENPQ9NQS7 RN7SL163P-201ENST00000583100 276 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
INCENPQ9NQS7 SELENOW-204ENST00000595615 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
INCENPQ9NQS7 AC084346.2-201ENST00000607097 949 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
INCENPQ9NQS7 AC090164.2-201ENST00000611487 516 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
INCENPQ9NQS7 SELENOW-216ENST00000612212 875 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
INCENPQ9NQS7 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
INCENPQ9NQS7 OGFOD1-209ENST00000568397 1681 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
INCENPQ9NQS7 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
INCENPQ9NQS7 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
INCENPQ9NQS7 STK17B-201ENST00000263955 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
INCENPQ9NQS7 CBX6-201ENST00000216083 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
INCENPQ9NQS7 SPAG9-201ENST00000262013 8273 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
INCENPQ9NQS7 DUS2-201ENST00000358896 1933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
INCENPQ9NQS7 SP6-201ENST00000342234 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
INCENPQ9NQS7 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
INCENPQ9NQS7 GPSM3-209ENST00000487761 1460 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
INCENPQ9NQS7 RHOH-220ENST00000615083 2156 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
INCENPQ9NQS7 TMPRSS2-202ENST00000398585 3240 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
INCENPQ9NQS7 LRRC34-208ENST00000522830 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
INCENPQ9NQS7 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
INCENPQ9NQS7 FOXD4L5-201ENST00000377420 3109 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
INCENPQ9NQS7 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
INCENPQ9NQS7 INHBA-205ENST00000638023 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
INCENPQ9NQS7 UROD-201ENST00000246337 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
INCENPQ9NQS7 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.1 ms