Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZC1

CELF4, CUGBP Elav-like family member 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 486 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CELF4Q9BZC1 COMMD4-201ENST00000267935 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CELF4Q9BZC1 MAP2K3-201ENST00000316920 1246 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CELF4Q9BZC1 COMMD4-202ENST00000338995 722 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CELF4Q9BZC1 ALG1L-201ENST00000340333 805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CELF4Q9BZC1 APRT-201ENST00000378364 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CELF4Q9BZC1 GGCT-203ENST00000409144 836 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CELF4Q9BZC1 HINT2P1-201ENST00000419438 481 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CELF4Q9BZC1 MAGEA5-201ENST00000446757 942 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CELF4Q9BZC1 GUSBP1-202ENST00000508260 1012 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CELF4Q9BZC1 AC008406.1-201ENST00000509530 541 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CELF4Q9BZC1 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CELF4Q9BZC1 GATD1-205ENST00000524550 995 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CELF4Q9BZC1 AC090857.1-201ENST00000527400 390 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CELF4Q9BZC1 GGCT-201ENST00000005374 1032 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CELF4Q9BZC1 COMMD4-211ENST00000564815 639 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CELF4Q9BZC1 CENPX-208ENST00000584347 799 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CELF4Q9BZC1 GEMIN7-204ENST00000591747 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CELF4Q9BZC1 AC020922.3-201ENST00000595064 547 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CELF4Q9BZC1 ALG1L-202ENST00000611639 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CELF4Q9BZC1 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CELF4Q9BZC1 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CELF4Q9BZC1 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CELF4Q9BZC1 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CELF4Q9BZC1 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CELF4Q9BZC1 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CELF4Q9BZC1 ZFP36-203ENST00000597629 1786 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CELF4Q9BZC1 RCSD1-202ENST00000367854 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CELF4Q9BZC1 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CELF4Q9BZC1 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CELF4Q9BZC1 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CELF4Q9BZC1 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CELF4Q9BZC1 PPP1R12A-AS1-201ENST00000552885 3234 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CELF4Q9BZC1 FAH-201ENST00000261755 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CELF4Q9BZC1 MYADM-202ENST00000391768 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CELF4Q9BZC1 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CELF4Q9BZC1 FAM186B-201ENST00000257894 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CELF4Q9BZC1 FAM163A-201ENST00000341785 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CELF4Q9BZC1 MSR1-201ENST00000262101 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CELF4Q9BZC1 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CELF4Q9BZC1 CASP6-202ENST00000352981 1347 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CELF4Q9BZC1 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CELF4Q9BZC1 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CELF4Q9BZC1 CSRP1-201ENST00000340006 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CELF4Q9BZC1 SMARCE1-205ENST00000431889 1569 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CELF4Q9BZC1 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CELF4Q9BZC1 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CELF4Q9BZC1 ARHGAP4-203ENST00000370028 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CELF4Q9BZC1 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CELF4Q9BZC1 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CELF4Q9BZC1 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CELF4Q9BZC1 USP38-202ENST00000510377 4135 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CELF4Q9BZC1 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CELF4Q9BZC1 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CELF4Q9BZC1 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CELF4Q9BZC1 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CELF4Q9BZC1 C6orf136-202ENST00000376471 614 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CELF4Q9BZC1 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CELF4Q9BZC1 AC078875.1-201ENST00000431907 724 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CELF4Q9BZC1 AL591684.1-201ENST00000434533 234 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CELF4Q9BZC1 AL645933.1-201ENST00000440087 609 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CELF4Q9BZC1 AL353637.1-201ENST00000451571 732 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CELF4Q9BZC1 AL136982.2-201ENST00000451760 234 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CELF4Q9BZC1 AC105362.1-201ENST00000511234 564 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CELF4Q9BZC1 LINC01848-201ENST00000523446 518 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CELF4Q9BZC1 AP001547.1-201ENST00000527440 374 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CELF4Q9BZC1 TP53AIP1-204ENST00000530777 363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CELF4Q9BZC1 PSORS1C1-206ENST00000547221 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CELF4Q9BZC1 AC103988.2-201ENST00000561804 725 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CELF4Q9BZC1 NDUFB5-216ENST00000611971 951 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CELF4Q9BZC1 AL353770.1-201ENST00000614915 403 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CELF4Q9BZC1 LINC01517-203ENST00000616194 908 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CELF4Q9BZC1 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CELF4Q9BZC1 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CELF4Q9BZC1 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CELF4Q9BZC1 ID2-203ENST00000396290 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CELF4Q9BZC1 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CELF4Q9BZC1 CDCA2-201ENST00000330560 3731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CELF4Q9BZC1 SOX7-201ENST00000304501 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CELF4Q9BZC1 PDE9A-208ENST00000398225 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CELF4Q9BZC1 SLC41A3-211ENST00000508835 1480 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CELF4Q9BZC1 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CELF4Q9BZC1 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CELF4Q9BZC1 CCDC51-201ENST00000395694 1560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CELF4Q9BZC1 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CELF4Q9BZC1 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CELF4Q9BZC1 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CELF4Q9BZC1 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CELF4Q9BZC1 LTBP3-221ENST00000532932 3327 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CELF4Q9BZC1 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CELF4Q9BZC1 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CELF4Q9BZC1 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CELF4Q9BZC1 CD48-203ENST00000613788 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CELF4Q9BZC1 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CELF4Q9BZC1 PSD-209ENST00000611678 3382 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CELF4Q9BZC1 RHOXF1-201ENST00000217999 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CELF4Q9BZC1 GAD1-203ENST00000375272 1252 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CELF4Q9BZC1 CAMKMT-203ENST00000403853 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CELF4Q9BZC1 CD8A-204ENST00000409781 597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CELF4Q9BZC1 BX284668.5-201ENST00000422124 406 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CELF4Q9BZC1 AL451042.2-201ENST00000424774 904 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms