Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY11

PACSIN1, Protein kinase C and casein kinase substrate in neurons protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN1Q9BY11 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PACSIN1Q9BY11 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PACSIN1Q9BY11 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PACSIN1Q9BY11 ALG3P1-201ENST00000508806 1114 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PACSIN1Q9BY11 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PACSIN1Q9BY11 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PACSIN1Q9BY11 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PACSIN1Q9BY11 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PACSIN1Q9BY11 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PACSIN1Q9BY11 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PACSIN1Q9BY11 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PACSIN1Q9BY11 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PACSIN1Q9BY11 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PACSIN1Q9BY11 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PACSIN1Q9BY11 ZNF77-201ENST00000314531 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PACSIN1Q9BY11 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PACSIN1Q9BY11 CICP8-201ENST00000455800 2813 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PACSIN1Q9BY11 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PACSIN1Q9BY11 MYD88-201ENST00000396334 2850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PACSIN1Q9BY11 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PACSIN1Q9BY11 TRIM71-201ENST00000383763 8685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PACSIN1Q9BY11 VAC14-AS1-201ENST00000398177 2145 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PACSIN1Q9BY11 TRPV6-201ENST00000359396 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PACSIN1Q9BY11 CFAP157-206ENST00000614677 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PACSIN1Q9BY11 SRP54-202ENST00000546080 2187 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PACSIN1Q9BY11 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PACSIN1Q9BY11 TMUB2-211ENST00000589184 1837 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PACSIN1Q9BY11 GRIN2C-201ENST00000293190 4261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PACSIN1Q9BY11 VWA8-201ENST00000281496 3475 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PACSIN1Q9BY11 ESPN-201ENST00000377828 3531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PACSIN1Q9BY11 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PACSIN1Q9BY11 NCBP2-204ENST00000427641 1946 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
PACSIN1Q9BY11 KCNAB2-219ENST00000602612 2396 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
PACSIN1Q9BY11 PPT1-213ENST00000641319 2388 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
PACSIN1Q9BY11 THUMPD3-AS1-202ENST00000468186 3253 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PACSIN1Q9BY11 PCDH8-201ENST00000338862 3708 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PACSIN1Q9BY11 HIST2H2BF-201ENST00000369167 1954 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.09
PACSIN1Q9BY11 PATL2-201ENST00000434130 1950 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
PACSIN1Q9BY11 AC010247.2-201ENST00000559786 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PACSIN1Q9BY11 SHPK-201ENST00000225519 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PACSIN1Q9BY11 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PACSIN1Q9BY11 AL022313.4-201ENST00000562756 2046 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
PACSIN1Q9BY11 MAP3K3-203ENST00000577395 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PACSIN1Q9BY11 DNAJB6-201ENST00000262177 2527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PACSIN1Q9BY11 PXDNL-201ENST00000356297 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PACSIN1Q9BY11 GK-204ENST00000378945 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PACSIN1Q9BY11 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PACSIN1Q9BY11 LINC01750-202ENST00000438293 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PACSIN1Q9BY11 PRMT3-202ENST00000331079 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PACSIN1Q9BY11 KATNB1-201ENST00000379661 2664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PACSIN1Q9BY11 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PACSIN1Q9BY11 CCND3-201ENST00000372987 2233 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PACSIN1Q9BY11 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PACSIN1Q9BY11 MBD6-201ENST00000355673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PACSIN1Q9BY11 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PACSIN1Q9BY11 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PACSIN1Q9BY11 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PACSIN1Q9BY11 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PACSIN1Q9BY11 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PACSIN1Q9BY11 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PACSIN1Q9BY11 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PACSIN1Q9BY11 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PACSIN1Q9BY11 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PACSIN1Q9BY11 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PACSIN1Q9BY11 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PACSIN1Q9BY11 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
PACSIN1Q9BY11 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PACSIN1Q9BY11 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PACSIN1Q9BY11 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PACSIN1Q9BY11 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PACSIN1Q9BY11 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PACSIN1Q9BY11 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
PACSIN1Q9BY11 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PACSIN1Q9BY11 WIZ-203ENST00000545156 4466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PACSIN1Q9BY11 TUBB8P4-201ENST00000511806 1324 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
PACSIN1Q9BY11 ITGB3-201ENST00000559488 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PACSIN1Q9BY11 WASHC2A-202ENST00000314664 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PACSIN1Q9BY11 BAX-201ENST00000293288 1358 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PACSIN1Q9BY11 ARPC4-TTLL3-201ENST00000397256 2466 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PACSIN1Q9BY11 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PACSIN1Q9BY11 NFYC-215ENST00000456393 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PACSIN1Q9BY11 ASH2L-201ENST00000343823 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PACSIN1Q9BY11 FGFRL1-201ENST00000264748 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PACSIN1Q9BY11 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PACSIN1Q9BY11 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PACSIN1Q9BY11 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
PACSIN1Q9BY11 ZCCHC7-209ENST00000534928 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PACSIN1Q9BY11 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PACSIN1Q9BY11 KIRREL2-203ENST00000360202 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PACSIN1Q9BY11 AC114689.3-201ENST00000583687 2991 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PACSIN1Q9BY11 TRMT2B-203ENST00000372939 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PACSIN1Q9BY11 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PACSIN1Q9BY11 OPRL1-203ENST00000355631 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PACSIN1Q9BY11 SFSWAP-210ENST00000541286 3219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PACSIN1Q9BY11 ALOX15B-201ENST00000380173 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PACSIN1Q9BY11 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PACSIN1Q9BY11 MCRIP1-207ENST00000574190 2775 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PACSIN1Q9BY11 SVIL-AS1-204ENST00000427063 2025 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PACSIN1Q9BY11 VPS26B-201ENST00000281187 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PACSIN1Q9BY11 MTA3-203ENST00000406652 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.5 ms