Protein–RNA interactions for Protein: Q96GF1

RNF185, E3 ubiquitin-protein ligase RNF185, humanhuman

Predictions only

Length 192 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF185Q96GF1 SLC25A26-202ENST00000354883 2673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
RNF185Q96GF1 GSTM4-204ENST00000369836 1412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
RNF185Q96GF1 BIN3-205ENST00000519513 1431 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
RNF185Q96GF1 CMTR2-201ENST00000338099 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
RNF185Q96GF1 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
RNF185Q96GF1 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
RNF185Q96GF1 C20orf203-202ENST00000608990 5076 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
RNF185Q96GF1 TRIM23-202ENST00000274327 1829 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
RNF185Q96GF1 EGFR-206ENST00000454757 5464 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
RNF185Q96GF1 F2-205ENST00000530231 1849 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
RNF185Q96GF1 DYRK1B-202ENST00000348817 2448 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
RNF185Q96GF1 GDPD5-215ENST00000533805 2424 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.71
RNF185Q96GF1 MCF2L-204ENST00000375608 3648 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
RNF185Q96GF1 COL6A1-201ENST00000361866 4238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
RNF185Q96GF1 SMARCA2-214ENST00000450198 5602 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
RNF185Q96GF1 HIPK3-203ENST00000456517 7399 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.71
RNF185Q96GF1 RNF26-201ENST00000311413 2787 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.71
RNF185Q96GF1 AC092143.1-201ENST00000556922 2776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.71
RNF185Q96GF1 RPL15-213ENST00000611050 2363 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC10.65□□□□□ -0.71
RNF185Q96GF1 CD68-202ENST00000380498 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
RNF185Q96GF1 GJB1-203ENST00000374029 1587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
RNF185Q96GF1 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
RNF185Q96GF1 USP2-201ENST00000260187 3732 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
RNF185Q96GF1 ATP6V0A4-202ENST00000353492 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
RNF185Q96GF1 OSBPL9-201ENST00000361556 2721 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
RNF185Q96GF1 USP31-203ENST00000567975 2142 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
RNF185Q96GF1 PCDHGA11-201ENST00000398587 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
RNF185Q96GF1 SF1-205ENST00000377394 2854 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
RNF185Q96GF1 PJA1-203ENST00000374583 2692 ntAPPRIS P4 BASIC10.64□□□□□ -0.71
RNF185Q96GF1 SLC8A2-203ENST00000542837 3603 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
RNF185Q96GF1 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
RNF185Q96GF1 NGEF-201ENST00000264051 3215 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
RNF185Q96GF1 PRR26-202ENST00000441152 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
RNF185Q96GF1 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
RNF185Q96GF1 AL669831.1-201ENST00000506640 6432 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
RNF185Q96GF1 TRAPPC8-201ENST00000283351 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
RNF185Q96GF1 CARMIL2-202ENST00000545661 4119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
RNF185Q96GF1 AL162431.2-201ENST00000358073 2424 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
RNF185Q96GF1 SACM1L-201ENST00000389061 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
RNF185Q96GF1 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
RNF185Q96GF1 AMT-221ENST00000538581 2038 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
RNF185Q96GF1 LRRC32-201ENST00000260061 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
RNF185Q96GF1 PHF2-203ENST00000610682 2921 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
RNF185Q96GF1 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
RNF185Q96GF1 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
RNF185Q96GF1 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
RNF185Q96GF1 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
RNF185Q96GF1 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
RNF185Q96GF1 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
RNF185Q96GF1 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
RNF185Q96GF1 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
RNF185Q96GF1 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
RNF185Q96GF1 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC10.64□□□□□ -0.71
RNF185Q96GF1 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
RNF185Q96GF1 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
RNF185Q96GF1 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
RNF185Q96GF1 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
RNF185Q96GF1 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
RNF185Q96GF1 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
RNF185Q96GF1 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC10.64□□□□□ -0.71
RNF185Q96GF1 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
RNF185Q96GF1 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
RNF185Q96GF1 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
RNF185Q96GF1 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
RNF185Q96GF1 BORCS8-202ENST00000462790 1429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
RNF185Q96GF1 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
RNF185Q96GF1 PDLIM2-201ENST00000265810 4592 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
RNF185Q96GF1 CDK3-201ENST00000425876 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
RNF185Q96GF1 CDK3-202ENST00000448471 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
RNF185Q96GF1 TLE3-211ENST00000557997 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
RNF185Q96GF1 AC026992.2-202ENST00000565312 1934 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
RNF185Q96GF1 GPRC5B-209ENST00000569479 2984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
RNF185Q96GF1 THSD4-201ENST00000261862 3133 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
RNF185Q96GF1 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
RNF185Q96GF1 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
RNF185Q96GF1 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
RNF185Q96GF1 KIAA0930-201ENST00000251993 2723 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
RNF185Q96GF1 TMEM132C-201ENST00000435159 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
RNF185Q96GF1 HPS1-215ENST00000613394 3714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
RNF185Q96GF1 KIF12-201ENST00000374118 2001 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
RNF185Q96GF1 UNC5B-202ENST00000373192 6451 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
RNF185Q96GF1 PGAP2-202ENST00000300730 1843 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
RNF185Q96GF1 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
RNF185Q96GF1 DLG4-203ENST00000399510 3975 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
RNF185Q96GF1 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
RNF185Q96GF1 AL445209.1-201ENST00000607269 3491 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
RNF185Q96GF1 ZFHX2-205ENST00000615307 1972 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
RNF185Q96GF1 FIBCD1-202ENST00000372338 3253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
RNF185Q96GF1 OFD1-202ENST00000380550 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
RNF185Q96GF1 CFAP74-209ENST00000493964 5247 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
RNF185Q96GF1 PTK7-203ENST00000345201 4071 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
RNF185Q96GF1 TUBB8-206ENST00000568584 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
RNF185Q96GF1 SGK2-203ENST00000373092 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
RNF185Q96GF1 C15orf59-204ENST00000569673 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
RNF185Q96GF1 AC125807.2-201ENST00000513358 3514 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
RNF185Q96GF1 RGS3-205ENST00000374134 2862 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
RNF185Q96GF1 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
RNF185Q96GF1 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
RNF185Q96GF1 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
RNF185Q96GF1 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.7 ms