Protein–RNA interactions for Protein: Q96FQ7

LINC00526, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00526, humanhuman

Predictions only

Length 95 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00526Q96FQ7 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
LINC00526Q96FQ7 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
LINC00526Q96FQ7 RNF26-201ENST00000311413 2787 ntAPPRIS P1 BASIC10.06□□□□□ -0.8
LINC00526Q96FQ7 GPR132-203ENST00000539291 2779 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
LINC00526Q96FQ7 MAMDC4-202ENST00000445819 3895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
LINC00526Q96FQ7 PTK2-202ENST00000395218 4415 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
LINC00526Q96FQ7 FAM86C1-201ENST00000346333 2010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
LINC00526Q96FQ7 GFRA1-201ENST00000355422 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
LINC00526Q96FQ7 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
LINC00526Q96FQ7 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
LINC00526Q96FQ7 NPHP3-ACAD11-201ENST00000471702 7784 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
LINC00526Q96FQ7 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
LINC00526Q96FQ7 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
LINC00526Q96FQ7 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
LINC00526Q96FQ7 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
LINC00526Q96FQ7 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
LINC00526Q96FQ7 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
LINC00526Q96FQ7 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
LINC00526Q96FQ7 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
LINC00526Q96FQ7 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
LINC00526Q96FQ7 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
LINC00526Q96FQ7 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
LINC00526Q96FQ7 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
LINC00526Q96FQ7 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
LINC00526Q96FQ7 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
LINC00526Q96FQ7 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
LINC00526Q96FQ7 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
LINC00526Q96FQ7 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
LINC00526Q96FQ7 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
LINC00526Q96FQ7 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
LINC00526Q96FQ7 FAM189A1-201ENST00000261275 4705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
LINC00526Q96FQ7 AC020915.4-201ENST00000597230 2708 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
LINC00526Q96FQ7 POLR2E-211ENST00000612655 1749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
LINC00526Q96FQ7 CLCN6-201ENST00000312413 5631 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
LINC00526Q96FQ7 IGFN1-201ENST00000295591 4439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
LINC00526Q96FQ7 LCOR-203ENST00000371097 4852 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
LINC00526Q96FQ7 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
LINC00526Q96FQ7 ZNF655-201ENST00000252713 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
LINC00526Q96FQ7 C10orf71-201ENST00000374144 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
LINC00526Q96FQ7 RAB37-202ENST00000392610 2858 ntTSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
LINC00526Q96FQ7 LINC01833-203ENST00000437916 2880 ntTSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
LINC00526Q96FQ7 SIGLECL1-208ENST00000614422 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
LINC00526Q96FQ7 WASHC5-202ENST00000517845 3667 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
LINC00526Q96FQ7 HDAC11-213ENST00000437379 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
LINC00526Q96FQ7 PTK7-205ENST00000352931 4023 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
LINC00526Q96FQ7 SCD5-202ENST00000319540 3101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
LINC00526Q96FQ7 MGRN1-203ENST00000415496 6405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
LINC00526Q96FQ7 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
LINC00526Q96FQ7 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
LINC00526Q96FQ7 PPT2-245ENST00000361568 1759 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
LINC00526Q96FQ7 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
LINC00526Q96FQ7 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
LINC00526Q96FQ7 ARAF-203ENST00000377045 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
LINC00526Q96FQ7 TRAPPC10-201ENST00000291574 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
LINC00526Q96FQ7 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
LINC00526Q96FQ7 MBP-205ENST00000397860 4844 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
LINC00526Q96FQ7 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
LINC00526Q96FQ7 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
LINC00526Q96FQ7 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
LINC00526Q96FQ7 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
LINC00526Q96FQ7 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
LINC00526Q96FQ7 MINPP1-202ENST00000371996 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
LINC00526Q96FQ7 SPG11-202ENST00000427534 6935 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
LINC00526Q96FQ7 PDE9A-201ENST00000291539 2058 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
LINC00526Q96FQ7 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
LINC00526Q96FQ7 TNK1-207ENST00000576812 3023 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
LINC00526Q96FQ7 TNS2-202ENST00000314276 4944 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
LINC00526Q96FQ7 PPP1R3D-201ENST00000370996 3630 ntAPPRIS P1 BASIC10.05□□□□□ -0.8
LINC00526Q96FQ7 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
LINC00526Q96FQ7 POLN-210ENST00000511885 3253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
LINC00526Q96FQ7 TLE1-203ENST00000376499 3893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
LINC00526Q96FQ7 PREX1-201ENST00000371941 6636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
LINC00526Q96FQ7 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
LINC00526Q96FQ7 FLJ40288-201ENST00000332558 1998 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
LINC00526Q96FQ7 AGL-203ENST00000361915 7368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
LINC00526Q96FQ7 ADGRL1-201ENST00000340736 7853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
LINC00526Q96FQ7 AFDN-211ENST00000447894 5475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
LINC00526Q96FQ7 TRHDE-AS1-201ENST00000426250 3684 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
LINC00526Q96FQ7 AC125611.4-201ENST00000553259 4166 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
LINC00526Q96FQ7 CXCR5-201ENST00000292174 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
LINC00526Q96FQ7 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC10.05□□□□□ -0.8
LINC00526Q96FQ7 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
LINC00526Q96FQ7 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
LINC00526Q96FQ7 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC10.05□□□□□ -0.8
LINC00526Q96FQ7 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
LINC00526Q96FQ7 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
LINC00526Q96FQ7 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
LINC00526Q96FQ7 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
LINC00526Q96FQ7 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
LINC00526Q96FQ7 OTUD4-201ENST00000447906 3829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
LINC00526Q96FQ7 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
LINC00526Q96FQ7 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
LINC00526Q96FQ7 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
LINC00526Q96FQ7 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
LINC00526Q96FQ7 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
LINC00526Q96FQ7 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
LINC00526Q96FQ7 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
LINC00526Q96FQ7 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC10.05□□□□□ -0.8
LINC00526Q96FQ7 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC10.05□□□□□ -0.8
LINC00526Q96FQ7 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.1 ms