Protein–RNA interactions for Protein: Q96EX2

RNFT2, RING finger and transmembrane domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNFT2Q96EX2 FAM155B-201ENST00000252338 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
RNFT2Q96EX2 TMUB2-211ENST00000589184 1837 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
RNFT2Q96EX2 DDC-213ENST00000617822 1809 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
RNFT2Q96EX2 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
RNFT2Q96EX2 FAM167A-201ENST00000284486 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
RNFT2Q96EX2 RAPGEF3-218ENST00000548919 2776 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
RNFT2Q96EX2 MCRIP1-207ENST00000574190 2775 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
RNFT2Q96EX2 IGHG3-202ENST00000641136 2751 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
RNFT2Q96EX2 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
RNFT2Q96EX2 STC1-202ENST00000524323 1748 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
RNFT2Q96EX2 CETP-203ENST00000566128 1733 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
RNFT2Q96EX2 VRK3-217ENST00000599538 2126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
RNFT2Q96EX2 IFITM10-201ENST00000340134 3706 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
RNFT2Q96EX2 USO1-201ENST00000264904 4135 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
RNFT2Q96EX2 SPOUT1-201ENST00000361256 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
RNFT2Q96EX2 LINC00865-202ENST00000448963 4272 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
RNFT2Q96EX2 GP6-201ENST00000310373 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
RNFT2Q96EX2 PTK2-202ENST00000395218 4415 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
RNFT2Q96EX2 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
RNFT2Q96EX2 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
RNFT2Q96EX2 PCDHB3-201ENST00000231130 3355 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
RNFT2Q96EX2 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
RNFT2Q96EX2 CROT-203ENST00000419147 2959 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
RNFT2Q96EX2 ATG13-215ENST00000529655 2566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
RNFT2Q96EX2 CYP4B1-201ENST00000271153 2171 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
RNFT2Q96EX2 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
RNFT2Q96EX2 CCT7-201ENST00000258091 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
RNFT2Q96EX2 BTBD9-206ENST00000481247 8525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
RNFT2Q96EX2 RARG-202ENST00000394426 2640 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
RNFT2Q96EX2 C15orf39-202ENST00000394987 4430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
RNFT2Q96EX2 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
RNFT2Q96EX2 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
RNFT2Q96EX2 CEP85L-203ENST00000368491 7673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
RNFT2Q96EX2 MLXIP-208ENST00000538698 5097 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
RNFT2Q96EX2 GDPD5-201ENST00000336898 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
RNFT2Q96EX2 FLJ40288-201ENST00000332558 1998 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
RNFT2Q96EX2 PATL2-201ENST00000434130 1950 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
RNFT2Q96EX2 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
RNFT2Q96EX2 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
RNFT2Q96EX2 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
RNFT2Q96EX2 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC13.35□□□□□ -0.27
RNFT2Q96EX2 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
RNFT2Q96EX2 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
RNFT2Q96EX2 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
RNFT2Q96EX2 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
RNFT2Q96EX2 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
RNFT2Q96EX2 BCAT2-203ENST00000545387 1272 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
RNFT2Q96EX2 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
RNFT2Q96EX2 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.35□□□□□ -0.27
RNFT2Q96EX2 MIR6074-201ENST00000612054 107 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
RNFT2Q96EX2 TRAK1-210ENST00000613405 4672 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
RNFT2Q96EX2 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
RNFT2Q96EX2 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
RNFT2Q96EX2 ARHGEF9-230ENST00000637178 2145 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
RNFT2Q96EX2 TGIF2-201ENST00000373872 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
RNFT2Q96EX2 KIAA0513-201ENST00000258180 7404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
RNFT2Q96EX2 LCA5-202ENST00000392959 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
RNFT2Q96EX2 MAMDC4-202ENST00000445819 3895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
RNFT2Q96EX2 MFSD2B-201ENST00000338315 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
RNFT2Q96EX2 EHMT2-201ENST00000375528 4047 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
RNFT2Q96EX2 GPR68-204ENST00000535815 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
RNFT2Q96EX2 C22orf34-204ENST00000414287 2197 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
RNFT2Q96EX2 ATL2-210ENST00000452935 2199 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
RNFT2Q96EX2 LINC02396-202ENST00000550636 2324 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
RNFT2Q96EX2 LIPA-202ENST00000336233 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
RNFT2Q96EX2 EIF4G1-207ENST00000411531 4683 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
RNFT2Q96EX2 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
RNFT2Q96EX2 AL022326.1-201ENST00000434516 1778 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
RNFT2Q96EX2 CR382287.2-201ENST00000623370 1942 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
RNFT2Q96EX2 DENND1C-202ENST00000543576 2395 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
RNFT2Q96EX2 PRR34-201ENST00000396008 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
RNFT2Q96EX2 THTPA-201ENST00000288014 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
RNFT2Q96EX2 SLC23A1-201ENST00000348729 2299 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
RNFT2Q96EX2 OR52A1-202ENST00000380367 9783 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
RNFT2Q96EX2 TEX44-201ENST00000313965 1383 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
RNFT2Q96EX2 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
RNFT2Q96EX2 USP48-213ENST00000529637 3228 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
RNFT2Q96EX2 CPN2-202ENST00000429275 2008 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
RNFT2Q96EX2 AC090643.2-201ENST00000623442 2029 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
RNFT2Q96EX2 ZNF641-201ENST00000301042 4544 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
RNFT2Q96EX2 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
RNFT2Q96EX2 EOGT-202ENST00000383701 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
RNFT2Q96EX2 PPP1R3D-201ENST00000370996 3630 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
RNFT2Q96EX2 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
RNFT2Q96EX2 IRF6-204ENST00000542854 4256 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
RNFT2Q96EX2 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
RNFT2Q96EX2 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
RNFT2Q96EX2 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC13.34□□□□□ -0.27
RNFT2Q96EX2 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
RNFT2Q96EX2 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
RNFT2Q96EX2 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
RNFT2Q96EX2 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
RNFT2Q96EX2 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
RNFT2Q96EX2 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
RNFT2Q96EX2 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
RNFT2Q96EX2 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
RNFT2Q96EX2 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
RNFT2Q96EX2 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
RNFT2Q96EX2 PTK7-205ENST00000352931 4023 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
RNFT2Q96EX2 ANGPTL2-202ENST00000373425 3707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.4 ms