Protein–RNA interactions for Protein: Q96BQ3

TRIM43, Tripartite motif-containing protein 43, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 446 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM43Q96BQ3 AC005740.1-201ENST00000515639 522 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIM43Q96BQ3 AC111149.2-202ENST00000518355 599 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIM43Q96BQ3 KNOP1P1-201ENST00000542108 989 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIM43Q96BQ3 AP005899.1-201ENST00000579467 544 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIM43Q96BQ3 Metazoa_SRP.157-201ENST00000622819 262 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIM43Q96BQ3 OSMR-AS1-204ENST00000636516 850 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIM43Q96BQ3 ZNF417-203ENST00000595559 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIM43Q96BQ3 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIM43Q96BQ3 LUC7L2-208ENST00000541170 1525 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIM43Q96BQ3 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIM43Q96BQ3 ARPC1A-201ENST00000262942 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIM43Q96BQ3 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIM43Q96BQ3 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIM43Q96BQ3 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIM43Q96BQ3 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIM43Q96BQ3 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIM43Q96BQ3 LCMT1-203ENST00000399069 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIM43Q96BQ3 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIM43Q96BQ3 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIM43Q96BQ3 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIM43Q96BQ3 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIM43Q96BQ3 KYAT1-201ENST00000302586 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIM43Q96BQ3 TARBP2-202ENST00000394357 1402 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIM43Q96BQ3 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIM43Q96BQ3 PAX7-202ENST00000400661 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIM43Q96BQ3 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIM43Q96BQ3 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIM43Q96BQ3 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIM43Q96BQ3 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIM43Q96BQ3 CTSV-201ENST00000259470 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIM43Q96BQ3 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIM43Q96BQ3 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIM43Q96BQ3 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIM43Q96BQ3 MRPL33-201ENST00000296102 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIM43Q96BQ3 MT1E-202ENST00000330439 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIM43Q96BQ3 MRPS11-202ENST00000353598 766 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIM43Q96BQ3 MRPL33-202ENST00000379666 404 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIM43Q96BQ3 GEMIN8P4-201ENST00000380526 729 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIM43Q96BQ3 VAC14-AS1-201ENST00000398177 2145 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIM43Q96BQ3 AL391839.2-201ENST00000412085 383 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIM43Q96BQ3 ID2-AS1-201ENST00000412712 953 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIM43Q96BQ3 SIX3-AS1-201ENST00000419364 844 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIM43Q96BQ3 ATXN8OS-202ENST00000424524 1236 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIM43Q96BQ3 AC093609.1-201ENST00000434020 952 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIM43Q96BQ3 AC010285.2-201ENST00000510240 569 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIM43Q96BQ3 ADM-203ENST00000525063 867 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIM43Q96BQ3 TROAP-213ENST00000550709 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIM43Q96BQ3 CR383656.13-201ENST00000550928 563 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIM43Q96BQ3 AL132994.1-201ENST00000554098 400 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIM43Q96BQ3 AL512310.10-201ENST00000555580 563 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIM43Q96BQ3 TNNI1-205ENST00000555948 580 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIM43Q96BQ3 PPCDC-206ENST00000564923 757 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIM43Q96BQ3 KRT17P4-206ENST00000584151 719 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIM43Q96BQ3 AL009176.1-201ENST00000607876 650 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIM43Q96BQ3 AC073578.2-201ENST00000618927 464 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIM43Q96BQ3 AC129778.1-201ENST00000623957 920 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIM43Q96BQ3 ADAMTS9-AS1-216ENST00000626280 882 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIM43Q96BQ3 AC233280.19-201ENST00000633223 136 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIM43Q96BQ3 TMEM9-203ENST00000367333 1564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIM43Q96BQ3 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIM43Q96BQ3 AC007491.1-201ENST00000637560 1306 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIM43Q96BQ3 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIM43Q96BQ3 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIM43Q96BQ3 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIM43Q96BQ3 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIM43Q96BQ3 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIM43Q96BQ3 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIM43Q96BQ3 HERPUD1-202ENST00000344114 1388 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIM43Q96BQ3 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIM43Q96BQ3 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIM43Q96BQ3 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIM43Q96BQ3 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIM43Q96BQ3 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIM43Q96BQ3 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIM43Q96BQ3 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIM43Q96BQ3 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIM43Q96BQ3 GNAI2-201ENST00000266027 2169 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIM43Q96BQ3 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIM43Q96BQ3 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIM43Q96BQ3 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIM43Q96BQ3 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIM43Q96BQ3 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIM43Q96BQ3 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIM43Q96BQ3 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIM43Q96BQ3 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIM43Q96BQ3 SIAE-206ENST00000618733 1980 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIM43Q96BQ3 ORC6-201ENST00000219097 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIM43Q96BQ3 GOT2-202ENST00000434819 1615 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIM43Q96BQ3 TMEM14C-201ENST00000229563 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIM43Q96BQ3 CMTM1-201ENST00000328020 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIM43Q96BQ3 CMTM1-202ENST00000332695 624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIM43Q96BQ3 PIFO-201ENST00000369737 746 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIM43Q96BQ3 CMTM1-205ENST00000379500 1064 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIM43Q96BQ3 S100A13-203ENST00000392623 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIM43Q96BQ3 PEMT-204ENST00000395783 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIM43Q96BQ3 LINC00265-2P-201ENST00000413372 782 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIM43Q96BQ3 KRT18P4-201ENST00000422599 1288 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIM43Q96BQ3 AL080243.1-201ENST00000423293 1060 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIM43Q96BQ3 PSAT1P2-201ENST00000426107 972 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIM43Q96BQ3 AC107464.2-201ENST00000502923 569 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
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