Protein–RNA interactions for Protein: Q71RG4

TMUB2, Transmembrane and ubiquitin-like domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 321 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMUB2Q71RG4 PCDHGA5-201ENST00000518069 4602 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
TMUB2Q71RG4 ARFIP2-210ENST00000614314 3846 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
TMUB2Q71RG4 RAB37-203ENST00000392612 2528 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
TMUB2Q71RG4 FBLN2-207ENST00000492059 4193 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
TMUB2Q71RG4 TECTA-201ENST00000264037 6468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
TMUB2Q71RG4 HSPA12A-205ENST00000635765 5841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
TMUB2Q71RG4 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
TMUB2Q71RG4 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
TMUB2Q71RG4 SMAD1-215ENST00000515385 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
TMUB2Q71RG4 NFATC1-203ENST00000329101 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
TMUB2Q71RG4 ACSM2B-201ENST00000329697 2935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
TMUB2Q71RG4 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
TMUB2Q71RG4 TRPC6-201ENST00000344327 4612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
TMUB2Q71RG4 GLP1R-201ENST00000373256 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
TMUB2Q71RG4 DHX30-201ENST00000348968 3994 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
TMUB2Q71RG4 HLA-E-201ENST00000376630 2601 ntAPPRIS P1 BASIC12.06□□□□□ -0.48
TMUB2Q71RG4 HLCS-201ENST00000336648 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
TMUB2Q71RG4 CDK5RAP1-202ENST00000346416 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
TMUB2Q71RG4 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC12.06□□□□□ -0.48
TMUB2Q71RG4 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
TMUB2Q71RG4 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
TMUB2Q71RG4 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC12.06□□□□□ -0.48
TMUB2Q71RG4 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
TMUB2Q71RG4 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
TMUB2Q71RG4 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
TMUB2Q71RG4 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
TMUB2Q71RG4 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
TMUB2Q71RG4 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
TMUB2Q71RG4 LAMTOR5-AS1-209ENST00000597455 805 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
TMUB2Q71RG4 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
TMUB2Q71RG4 SECISBP2-201ENST00000339901 3320 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
TMUB2Q71RG4 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
TMUB2Q71RG4 KCNJ11-201ENST00000339994 2801 ntAPPRIS P1 BASIC12.06□□□□□ -0.48
TMUB2Q71RG4 PDE7B-203ENST00000615259 5234 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
TMUB2Q71RG4 GAB1-202ENST00000262995 7981 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
TMUB2Q71RG4 LOXHD1-203ENST00000398686 1958 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
TMUB2Q71RG4 INIP-203ENST00000374242 4233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
TMUB2Q71RG4 FSTL4-207ENST00000621681 2660 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
TMUB2Q71RG4 TMEM130-201ENST00000339375 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
TMUB2Q71RG4 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
TMUB2Q71RG4 COPS7B-201ENST00000350033 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
TMUB2Q71RG4 ENDOV-203ENST00000517795 2548 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
TMUB2Q71RG4 POU2F2-204ENST00000526816 3218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
TMUB2Q71RG4 JADE1-209ENST00000511647 3560 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
TMUB2Q71RG4 CAD-202ENST00000403525 6900 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
TMUB2Q71RG4 POLD1-201ENST00000440232 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
TMUB2Q71RG4 GTF2F1-201ENST00000394456 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
TMUB2Q71RG4 ELF3-202ENST00000367283 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
TMUB2Q71RG4 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
TMUB2Q71RG4 AMHR2-201ENST00000257863 1863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
TMUB2Q71RG4 POMT1-203ENST00000372228 3123 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
TMUB2Q71RG4 APLP2-202ENST00000278756 3687 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
TMUB2Q71RG4 TROVE2-208ENST00000432079 7848 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
TMUB2Q71RG4 SLC25A18-202ENST00000399813 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
TMUB2Q71RG4 TBC1D3P2-203ENST00000581291 2088 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
TMUB2Q71RG4 ITGA5-201ENST00000293379 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
TMUB2Q71RG4 CMIP-208ENST00000566462 3512 ntTSL 4 BASIC12.06□□□□□ -0.48
TMUB2Q71RG4 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
TMUB2Q71RG4 MATN2-211ENST00000521689 3554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
TMUB2Q71RG4 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
TMUB2Q71RG4 DDX49-214ENST00000629999 1912 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
TMUB2Q71RG4 TMPRSS2-201ENST00000332149 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
TMUB2Q71RG4 HNRNPH1-216ENST00000510411 2105 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
TMUB2Q71RG4 TBC1D3L-201ENST00000612727 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
TMUB2Q71RG4 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
TMUB2Q71RG4 DAO-201ENST00000228476 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
TMUB2Q71RG4 CACNA1C-214ENST00000399634 7590 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
TMUB2Q71RG4 CACNA1C-222ENST00000406454 7590 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
TMUB2Q71RG4 VENTX-201ENST00000325980 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
TMUB2Q71RG4 ZNF197-204ENST00000383745 2935 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
TMUB2Q71RG4 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
TMUB2Q71RG4 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
TMUB2Q71RG4 RNF216-205ENST00000425013 5639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
TMUB2Q71RG4 TMPRSS4-211ENST00000522307 1634 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
TMUB2Q71RG4 SEMA6D-208ENST00000558014 6028 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
TMUB2Q71RG4 DNAJC14-202ENST00000317287 2774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
TMUB2Q71RG4 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
TMUB2Q71RG4 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
TMUB2Q71RG4 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
TMUB2Q71RG4 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
TMUB2Q71RG4 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC12.05□□□□□ -0.48
TMUB2Q71RG4 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC12.05□□□□□ -0.48
TMUB2Q71RG4 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
TMUB2Q71RG4 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
TMUB2Q71RG4 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
TMUB2Q71RG4 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
TMUB2Q71RG4 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
TMUB2Q71RG4 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
TMUB2Q71RG4 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
TMUB2Q71RG4 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
TMUB2Q71RG4 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
TMUB2Q71RG4 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
TMUB2Q71RG4 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
TMUB2Q71RG4 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
TMUB2Q71RG4 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
TMUB2Q71RG4 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
TMUB2Q71RG4 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
TMUB2Q71RG4 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
TMUB2Q71RG4 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC12.05□□□□□ -0.48
TMUB2Q71RG4 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms