Protein–RNA interactions for Protein: Q53S48

ALF, STON1-GTF2A1L readthrough, humanhuman

Predictions only

Length 1,182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALFQ53S48 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ALFQ53S48 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
ALFQ53S48 BLOC1S6-212ENST00000566753 1996 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
ALFQ53S48 PRKD2-202ENST00000433867 3321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
ALFQ53S48 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ALFQ53S48 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ALFQ53S48 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
ALFQ53S48 NLRX1-204ENST00000409991 3716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ALFQ53S48 MINDY2-203ENST00000559228 9238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
ALFQ53S48 OSBPL5-202ENST00000348039 2798 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
ALFQ53S48 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
ALFQ53S48 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
ALFQ53S48 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ALFQ53S48 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ALFQ53S48 DPM3-202ENST00000368399 517 ntBASIC15.05■□□□□ -0
ALFQ53S48 SCARNA21-201ENST00000517026 139 ntBASIC15.05■□□□□ -0
ALFQ53S48 MRPL51-202ENST00000537701 601 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ALFQ53S48 EID1-202ENST00000560490 584 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
ALFQ53S48 TUBB8-202ENST00000562809 820 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ALFQ53S48 KC6-205ENST00000599934 556 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
ALFQ53S48 AC009884.2-201ENST00000603110 324 ntBASIC15.05■□□□□ -0
ALFQ53S48 DIO1-215ENST00000610607 796 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ALFQ53S48 AC004923.1-202ENST00000642106 209 ntBASIC15.05■□□□□ -0
ALFQ53S48 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ALFQ53S48 MEIKIN-203ENST00000442687 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ALFQ53S48 RANBP1-208ENST00000430524 1389 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
ALFQ53S48 TCL1A-203ENST00000554012 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ALFQ53S48 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ALFQ53S48 GNAI2-207ENST00000451956 1486 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ALFQ53S48 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ALFQ53S48 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ALFQ53S48 ALDOA-209ENST00000563060 1550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ALFQ53S48 CYP4F23P-201ENST00000593402 1579 ntBASIC15.05■□□□□ -0
ALFQ53S48 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ALFQ53S48 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ALFQ53S48 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ALFQ53S48 ZNF576-203ENST00000525771 2327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ALFQ53S48 CEP76-201ENST00000262127 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ALFQ53S48 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ALFQ53S48 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ALFQ53S48 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ALFQ53S48 PIDD1-201ENST00000347755 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ALFQ53S48 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ALFQ53S48 CDCA7-202ENST00000347703 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ALFQ53S48 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ALFQ53S48 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ALFQ53S48 ABCB7-202ENST00000339447 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ALFQ53S48 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ALFQ53S48 CYP4B1-201ENST00000271153 2171 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ALFQ53S48 SBF1P1-201ENST00000444527 5631 ntBASIC15.04■□□□□ -0
ALFQ53S48 CAMK2D-205ENST00000394524 5294 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ALFQ53S48 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ALFQ53S48 NTM-205ENST00000425719 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ALFQ53S48 COL4A2-AS2-201ENST00000458403 1522 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ALFQ53S48 PLSCR4-204ENST00000446574 1442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ALFQ53S48 AC020907.1-201ENST00000616460 1350 ntBASIC15.04■□□□□ -0
ALFQ53S48 CASP6-202ENST00000352981 1347 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ALFQ53S48 WASHC3-201ENST00000240079 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ALFQ53S48 C3orf22-201ENST00000318225 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ALFQ53S48 ERCC1-203ENST00000340192 949 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ALFQ53S48 SP6-201ENST00000342234 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ALFQ53S48 C1orf53-201ENST00000367393 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ALFQ53S48 KRTAP10-3-201ENST00000391620 971 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
ALFQ53S48 PPP1R14B-202ENST00000392210 600 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
ALFQ53S48 GTF2A2-205ENST00000396064 633 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
ALFQ53S48 SERPINE3-201ENST00000400389 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ALFQ53S48 GPAA1P2-201ENST00000417923 928 ntBASIC15.04■□□□□ -0
ALFQ53S48 GTF2A2-208ENST00000484743 408 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ALFQ53S48 IGHVIII-5-2-201ENST00000522505 261 ntBASIC15.04■□□□□ -0
ALFQ53S48 AP001258.2-201ENST00000529891 490 ntBASIC15.04■□□□□ -0
ALFQ53S48 AC008805.1-201ENST00000590892 364 ntBASIC15.04■□□□□ -0
ALFQ53S48 AC068587.8-201ENST00000641239 219 ntBASIC15.04■□□□□ -0
ALFQ53S48 HELZ2-204ENST00000467148 8064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ALFQ53S48 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ALFQ53S48 GSN-209ENST00000449733 2702 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ALFQ53S48 MYH6-202ENST00000405093 5941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ALFQ53S48 ZBED8-202ENST00000523213 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ALFQ53S48 TMBIM1-201ENST00000258412 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ALFQ53S48 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ALFQ53S48 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ALFQ53S48 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ALFQ53S48 RHOH-220ENST00000615083 2156 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
ALFQ53S48 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ALFQ53S48 ADAMTS14-202ENST00000373208 5269 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ALFQ53S48 AC144522.1-201ENST00000625111 1658 ntBASIC15.03■□□□□ -0
ALFQ53S48 EHF-212ENST00000533754 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ALFQ53S48 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ALFQ53S48 ELOVL1-201ENST00000372458 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ALFQ53S48 BSDC1-203ENST00000419121 1473 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ALFQ53S48 GPSM3-209ENST00000487761 1460 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ALFQ53S48 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ALFQ53S48 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ALFQ53S48 CDPF1-203ENST00000404583 1439 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ALFQ53S48 AC015802.1-201ENST00000588104 1449 ntBASIC15.03■□□□□ -0
ALFQ53S48 PAK6-202ENST00000455577 4215 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ALFQ53S48 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ALFQ53S48 NMBR-201ENST00000258042 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ALFQ53S48 FAM90A7P-201ENST00000382628 1395 ntBASIC15.03■□□□□ -0
ALFQ53S48 FAM90A23P-201ENST00000400136 1395 ntBASIC15.03■□□□□ -0
ALFQ53S48 KLK3-216ENST00000617027 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.8 ms