Protein–RNA interactions for Protein: Q17RS7

GEN1, Flap endonuclease GEN homolog 1, humanhuman

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Length 908 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GEN1Q17RS7 SCARNA20.5-201ENST00000516991 142 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
GEN1Q17RS7 CNGA4-202ENST00000533426 936 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GEN1Q17RS7 ACTG1P17-201ENST00000558391 1119 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
GEN1Q17RS7 AC022903.1-201ENST00000579327 469 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GEN1Q17RS7 NAT9-222ENST00000583476 583 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GEN1Q17RS7 AC020914.3-201ENST00000594712 304 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
GEN1Q17RS7 MRPL34-203ENST00000595444 863 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GEN1Q17RS7 AC106017.2-201ENST00000631194 1173 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GEN1Q17RS7 IARS2-201ENST00000366922 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GEN1Q17RS7 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GEN1Q17RS7 ZNF800-203ENST00000393313 4358 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GEN1Q17RS7 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GEN1Q17RS7 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GEN1Q17RS7 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GEN1Q17RS7 FEM1A-201ENST00000269856 9593 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GEN1Q17RS7 SAMD4A-213ENST00000631086 6677 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GEN1Q17RS7 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GEN1Q17RS7 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GEN1Q17RS7 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GEN1Q17RS7 HIPK1-205ENST00000369558 8157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GEN1Q17RS7 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GEN1Q17RS7 SLC12A7-201ENST00000264930 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GEN1Q17RS7 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GEN1Q17RS7 SEMA6D-208ENST00000558014 6028 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GEN1Q17RS7 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GEN1Q17RS7 AL359915.2-205ENST00000418015 1529 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GEN1Q17RS7 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GEN1Q17RS7 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GEN1Q17RS7 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GEN1Q17RS7 OCRL-202ENST00000371113 5162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GEN1Q17RS7 AC138028.6-201ENST00000616106 1482 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
GEN1Q17RS7 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GEN1Q17RS7 SAMD4A-202ENST00000392067 6833 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GEN1Q17RS7 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
GEN1Q17RS7 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GEN1Q17RS7 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GEN1Q17RS7 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GEN1Q17RS7 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GEN1Q17RS7 TEX13B-201ENST00000302917 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GEN1Q17RS7 TMEM52-203ENST00000378602 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GEN1Q17RS7 PSME1-202ENST00000382708 1136 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GEN1Q17RS7 MAPK15-203ENST00000395108 765 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GEN1Q17RS7 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
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GEN1Q17RS7 AC044849.1-201ENST00000519737 1188 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
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GEN1Q17RS7 GAB1-202ENST00000262995 7981 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GEN1Q17RS7 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
GEN1Q17RS7 ITSN1-210ENST00000399353 3913 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GEN1Q17RS7 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
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GEN1Q17RS7 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GEN1Q17RS7 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
GEN1Q17RS7 MRFAP1-202ENST00000382581 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GEN1Q17RS7 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GEN1Q17RS7 PCDHA5-201ENST00000529619 4157 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GEN1Q17RS7 PDHB-206ENST00000474765 1503 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
GEN1Q17RS7 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GEN1Q17RS7 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
GEN1Q17RS7 CACNA1I-202ENST00000402142 10004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GEN1Q17RS7 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
GEN1Q17RS7 LINC01667-202ENST00000623919 1422 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
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GEN1Q17RS7 DDX31-204ENST00000372159 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GEN1Q17RS7 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GEN1Q17RS7 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GEN1Q17RS7 NEDD4L-205ENST00000400345 3647 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GEN1Q17RS7 ATP2C1-214ENST00000508532 4969 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GEN1Q17RS7 SPIDR-201ENST00000297423 3988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GEN1Q17RS7 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GEN1Q17RS7 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
GEN1Q17RS7 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GEN1Q17RS7 CSH2-201ENST00000336844 1173 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
GEN1Q17RS7 CSH2-202ENST00000345366 598 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
GEN1Q17RS7 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GEN1Q17RS7 AL162742.1-201ENST00000434792 954 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
GEN1Q17RS7 PGAP2-214ENST00000465307 1100 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
GEN1Q17RS7 SERPINA13P-202ENST00000478994 924 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
GEN1Q17RS7 CDKN2AIP-205ENST00000510928 860 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
GEN1Q17RS7 TMEM208-207ENST00000563953 887 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
GEN1Q17RS7 FXYD6-217ENST00000584394 669 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
GEN1Q17RS7 DIO1-215ENST00000610607 796 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
GEN1Q17RS7 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
GEN1Q17RS7 NACC2-202ENST00000371753 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
GEN1Q17RS7 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
GEN1Q17RS7 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
GEN1Q17RS7 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
GEN1Q17RS7 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.03
GEN1Q17RS7 CX3CL1-204ENST00000565912 5796 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
GEN1Q17RS7 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
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