Protein–RNA interactions for Protein: Q17R55

FAM187B, Protein FAM187B, humanhuman

Predictions only

Length 369 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM187BQ17R55 SAPCD1-208ENST00000415669 916 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FAM187BQ17R55 AC131097.3-203ENST00000420272 1193 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FAM187BQ17R55 AC026320.2-201ENST00000434379 478 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
FAM187BQ17R55 TAC3-208ENST00000441881 731 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FAM187BQ17R55 AC234782.1-201ENST00000451950 919 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
FAM187BQ17R55 DUX4L50-201ENST00000455245 715 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
FAM187BQ17R55 ZNF124-204ENST00000491356 956 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FAM187BQ17R55 AC005833.2-201ENST00000527518 1249 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FAM187BQ17R55 PSORS1C1-206ENST00000547221 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FAM187BQ17R55 AC016044.1-201ENST00000560818 572 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FAM187BQ17R55 SHBG-207ENST00000570547 801 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FAM187BQ17R55 AC040162.4-201ENST00000574912 1185 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FAM187BQ17R55 MIR3907-201ENST00000579424 151 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
FAM187BQ17R55 AC006064.4-201ENST00000602946 422 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FAM187BQ17R55 AL109837.1-201ENST00000603272 613 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
FAM187BQ17R55 AC012044.1-201ENST00000603431 297 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
FAM187BQ17R55 TAC3-211ENST00000615887 1120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FAM187BQ17R55 RPN2-202ENST00000373622 2348 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FAM187BQ17R55 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FAM187BQ17R55 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FAM187BQ17R55 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FAM187BQ17R55 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FAM187BQ17R55 LRP5L-202ENST00000402859 1661 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FAM187BQ17R55 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FAM187BQ17R55 ZNF619-201ENST00000314686 2233 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FAM187BQ17R55 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FAM187BQ17R55 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FAM187BQ17R55 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FAM187BQ17R55 ALDH3A1-201ENST00000225740 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FAM187BQ17R55 CD59-201ENST00000351554 1775 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FAM187BQ17R55 FAM90A2P-201ENST00000511144 1395 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
FAM187BQ17R55 FAM90A25P-201ENST00000528404 1395 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
FAM187BQ17R55 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FAM187BQ17R55 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FAM187BQ17R55 EFHC1-227ENST00000637089 2133 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FAM187BQ17R55 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FAM187BQ17R55 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FAM187BQ17R55 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FAM187BQ17R55 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FAM187BQ17R55 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FAM187BQ17R55 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FAM187BQ17R55 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FAM187BQ17R55 TCEAL6-201ENST00000372773 983 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FAM187BQ17R55 CEP164P1-201ENST00000455142 418 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
FAM187BQ17R55 AC083949.1-202ENST00000458490 552 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FAM187BQ17R55 AC008723.1-201ENST00000506922 207 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
FAM187BQ17R55 SPAG5-AS1-203ENST00000554154 491 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FAM187BQ17R55 AC009093.8-202ENST00000562902 677 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FAM187BQ17R55 NAT9-220ENST00000582870 896 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FAM187BQ17R55 ELOF1-202ENST00000586120 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FAM187BQ17R55 AL133499.1-201ENST00000596207 608 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
FAM187BQ17R55 PRKAB1-210ENST00000630317 258 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FAM187BQ17R55 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FAM187BQ17R55 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FAM187BQ17R55 LGALS12-202ENST00000340246 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FAM187BQ17R55 NELFE-201ENST00000375425 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FAM187BQ17R55 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FAM187BQ17R55 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FAM187BQ17R55 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FAM187BQ17R55 TLE3-203ENST00000451782 2356 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
FAM187BQ17R55 PRIMPOL-211ENST00000515774 2007 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FAM187BQ17R55 SLC35B2-206ENST00000615337 2014 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
FAM187BQ17R55 SLC38A6-201ENST00000267488 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FAM187BQ17R55 CCT8L1P-201ENST00000465400 1674 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
FAM187BQ17R55 AC104667.2-202ENST00000452801 1301 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
FAM187BQ17R55 DUSP13-208ENST00000478873 1335 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
FAM187BQ17R55 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FAM187BQ17R55 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FAM187BQ17R55 FOSB-213ENST00000615753 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FAM187BQ17R55 CNN1-201ENST00000252456 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FAM187BQ17R55 TINF2-215ENST00000626689 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
FAM187BQ17R55 LRP10-203ENST00000546834 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
FAM187BQ17R55 NBAT1-201ENST00000566912 1940 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
FAM187BQ17R55 HFE-201ENST00000309234 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
FAM187BQ17R55 RPL3-202ENST00000401609 1289 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FAM187BQ17R55 BX276092.5-201ENST00000439926 886 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
FAM187BQ17R55 BMS1P17-203ENST00000444357 552 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
FAM187BQ17R55 RPSAP15-201ENST00000448168 861 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
FAM187BQ17R55 LINC00322-201ENST00000450205 699 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
FAM187BQ17R55 RPS6KA2-AS1-201ENST00000455390 627 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
FAM187BQ17R55 SNHG21-204ENST00000559366 674 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
FAM187BQ17R55 AC135983.1-201ENST00000562108 1097 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
FAM187BQ17R55 ANKRD11-208ENST00000563291 593 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
FAM187BQ17R55 BMS1P22-203ENST00000609679 552 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
FAM187BQ17R55 LINC00923-205ENST00000615399 932 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
FAM187BQ17R55 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FAM187BQ17R55 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FAM187BQ17R55 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FAM187BQ17R55 KRT8P31-201ENST00000504812 1408 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
FAM187BQ17R55 TBC1D3J-201ENST00000620719 1426 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
FAM187BQ17R55 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FAM187BQ17R55 NUP54-217ENST00000514987 1563 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
FAM187BQ17R55 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FAM187BQ17R55 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FAM187BQ17R55 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
FAM187BQ17R55 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FAM187BQ17R55 KIAA0513-207ENST00000567328 1873 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FAM187BQ17R55 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
FAM187BQ17R55 GNAI2-201ENST00000266027 2169 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
FAM187BQ17R55 AGPAT3-218ENST00000546158 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98.8 ms