Protein–RNA interactions for Protein: Q16600

ZNF239, Zinc finger protein 239, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF239Q16600 HNRNPH1-201ENST00000329433 2114 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
ZNF239Q16600 ATP6V1C1-202ENST00000518738 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
ZNF239Q16600 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
ZNF239Q16600 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
ZNF239Q16600 RBBP4-204ENST00000414241 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
ZNF239Q16600 RMND1-205ENST00000622845 1484 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
ZNF239Q16600 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
ZNF239Q16600 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
ZNF239Q16600 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
ZNF239Q16600 DNAI1-209ENST00000614641 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
ZNF239Q16600 SNAP47-203ENST00000366760 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
ZNF239Q16600 E2F3P2-201ENST00000447755 1422 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
ZNF239Q16600 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
ZNF239Q16600 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
ZNF239Q16600 HIC2-202ENST00000407598 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
ZNF239Q16600 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
ZNF239Q16600 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
ZNF239Q16600 CNTNAP3P2-201ENST00000617175 3861 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
ZNF239Q16600 AC005840.4-201ENST00000541242 2494 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
ZNF239Q16600 CYP4B1-201ENST00000271153 2171 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
ZNF239Q16600 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
ZNF239Q16600 ANKLE1-201ENST00000394458 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
ZNF239Q16600 PXDNL-201ENST00000356297 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
ZNF239Q16600 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
ZNF239Q16600 AC079781.5-202ENST00000641784 3743 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
ZNF239Q16600 ZIM2-AS1-201ENST00000595954 2129 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
ZNF239Q16600 CCDC51-201ENST00000395694 1560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
ZNF239Q16600 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
ZNF239Q16600 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
ZNF239Q16600 PODN-207ENST00000618387 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
ZNF239Q16600 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
ZNF239Q16600 PRM2-201ENST00000241808 680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
ZNF239Q16600 RDH5-201ENST00000257895 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
ZNF239Q16600 AK6-201ENST00000380818 1183 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
ZNF239Q16600 AL391361.3-201ENST00000420601 379 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
ZNF239Q16600 PRM2-202ENST00000435245 723 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
ZNF239Q16600 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
ZNF239Q16600 AL035414.1-201ENST00000451327 857 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
ZNF239Q16600 AC004471.1-201ENST00000456035 582 ntTSL 4 BASIC13.21□□□□□ -0.29
ZNF239Q16600 AC108725.1-201ENST00000495472 409 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
ZNF239Q16600 AC020659.2-202ENST00000512295 513 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
ZNF239Q16600 NME2-206ENST00000513177 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
ZNF239Q16600 MSC-AS1-204ENST00000518916 864 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
ZNF239Q16600 CD74-212ENST00000524315 584 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
ZNF239Q16600 AGER-214ENST00000538695 487 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
ZNF239Q16600 RDH5-204ENST00000548082 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
ZNF239Q16600 CD63-214ENST00000552692 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
ZNF239Q16600 AP003096.1-203ENST00000564469 563 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
ZNF239Q16600 PLA2G15-209ENST00000566188 1203 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
ZNF239Q16600 DUX4L46-201ENST00000566845 751 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
ZNF239Q16600 C1QTNF1-AS1-202ENST00000581579 865 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
ZNF239Q16600 AC132192.2-201ENST00000596206 1147 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
ZNF239Q16600 AC011495.3-201ENST00000596472 427 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
ZNF239Q16600 AC009955.4-201ENST00000597192 544 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
ZNF239Q16600 AGER-215ENST00000620802 737 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
ZNF239Q16600 LINC01648-201ENST00000445180 1519 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
ZNF239Q16600 CIT-219ENST00000612548 1799 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
ZNF239Q16600 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
ZNF239Q16600 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
ZNF239Q16600 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
ZNF239Q16600 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
ZNF239Q16600 LINC01205-202ENST00000497996 1493 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.3
ZNF239Q16600 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
ZNF239Q16600 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
ZNF239Q16600 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
ZNF239Q16600 MCRS1-211ENST00000550165 1936 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
ZNF239Q16600 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
ZNF239Q16600 PHLDB2-203ENST00000412622 5996 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
ZNF239Q16600 RPS6KL1-210ENST00000555647 3309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
ZNF239Q16600 FES-203ENST00000394302 2133 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
ZNF239Q16600 STAG3L2-201ENST00000426587 2130 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.3
ZNF239Q16600 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
ZNF239Q16600 RNF122-201ENST00000256257 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
ZNF239Q16600 ARFGAP1-203ENST00000370283 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
ZNF239Q16600 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
ZNF239Q16600 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
ZNF239Q16600 HHEX-202ENST00000472590 1605 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.3
ZNF239Q16600 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
ZNF239Q16600 LYRM1-203ENST00000412082 1399 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ZNF239Q16600 CDK2AP1-205ENST00000542174 1812 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
ZNF239Q16600 AC092506.1-201ENST00000634580 2275 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
ZNF239Q16600 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ZNF239Q16600 NIPA1-201ENST00000337435 6567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ZNF239Q16600 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
ZNF239Q16600 LINC01305-201ENST00000420866 3123 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ZNF239Q16600 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
ZNF239Q16600 LBHD1-201ENST00000354588 1320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ZNF239Q16600 CRYBG1-204ENST00000633556 9909 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
ZNF239Q16600 RTEL1-203ENST00000360203 4623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
ZNF239Q16600 AL359915.2-205ENST00000418015 1529 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
ZNF239Q16600 IQCE-201ENST00000325979 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
ZNF239Q16600 ZNF790-207ENST00000614179 2361 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
ZNF239Q16600 ASB3-202ENST00000394717 1734 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
ZNF239Q16600 PRPH-201ENST00000257860 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ZNF239Q16600 RAB4B-201ENST00000357052 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ZNF239Q16600 AF274855.1-203ENST00000424126 800 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
ZNF239Q16600 PTPA-215ENST00000432124 567 ntTSL 4 BASIC13.2□□□□□ -0.3
ZNF239Q16600 POM121L10P-201ENST00000436994 1285 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
ZNF239Q16600 ZNF789-204ENST00000448667 1055 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ZNF239Q16600 AL450003.2-201ENST00000450445 428 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
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